脱凝集活性を持つ分子シャペロンClpBの構造変化と機能

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21770151
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 機能生物化学
• 研究機関: 甲南大学
• 研究代表者: 渡辺 洋平 甲南大学, 理工学部, 講師 (40411839)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 酵素の触媒機構

研究概要

ClpBは凝集したタンパク質を再生(脱凝集)できる。Nドメインの動きをジスルフィド結合で制限すると、ClpBの脱凝集活性が低下するが、その原因は基質を結合した後の糸通し過程にあることを明らかにした。また、ClpB6量体の隣り合うサブユニット2つ、あるいは6つ全てをジスルフィド結合でつないだ変異体をそれぞれ作成した。これらの変異体を用いた実験により、ClpBによる効率的な脱凝集には、6量体の適度な解離会合が必要であることが分かった。

研究成果

• [雑誌論文] Orientation of the amino-terminal domain of ClpB affects the disaggregation of the protein (2012)
  • 著者名/発表者名: Sayaka Mizuno, Yosuke Nakazaki, Masasuke Yoshida, Yo-hei Watanabe
  • 雑誌名: FEBS J. 巻: 279 ページ: 1474-1484
  • DOI: DOI:10.1111/j.1742-4658.2012.08540.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Roles of conserved arginines in ATP-binding domains of AAA+chaperone ClpB from Thermus thermophilus (2011)
  • 著者名/発表者名: Takashi Yamasaki, Yosuke Nakazaki, Masasuke Yoshida, Yo-hei Watanabe
  • 雑誌名: FEBS J. 巻: 278 ページ: 2395-2403
  • DOI: DOI:10.1111/j.1742-4658.2011.08167.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Temperature-dependent regulation of Thermus thermophilus DnaK/DnaJ chaperone by DafA protein (2009)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Mizutani, Shohei Nemoto, Masasuke Yoshida, Yo-hei Watanabe
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 14 ページ: 1405-1413
  • DOI: DOI:10.1111/j.1365-2443.2009.01357.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stability of the two wings of the coiled-coil domain of ClpB chaperone is Critical for its disaggregation activity (2009)
  • 著者名/発表者名: Yo-hei Watanabe, Yosuke Nakazaki, Ryoji Suno, Masasuke Yoshida
  • 雑誌名: Biochem. J. 巻: 421 ページ: 71-77
  • DOI: DOI:10.1042/BJ20082238
  • 査読あり
• [学会発表] 分子シャペロンClpBのサブユニット間の協同性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山崎孝史、中村俊樹、吉田賢右、渡辺洋平
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-09-23
• [学会発表] 分子シャペロンClpBの6量体構造の安定性とシャペロン活性との関係 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中村俊樹、山崎孝史、本多大輔、吉田賢右、渡辺洋平
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] 分子シャペロンClpB変異体の基質糸通し速度の測定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中崎洋介、水野さやか、吉田賢右、渡辺洋平
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 分子シャペロンClpBのアルギニンフィンガーの役割 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山崎孝史、中村俊樹、吉田賢右、渡辺洋平
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] Roles of the motion of the N-terminal domain of ClpB chaperone (2010)
  • 著者名/発表者名: Yosuke Nakazaki, Sayaka Mizuno, Masasuke Yoshida, Yo-hei Watanabe
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Protein Community
  • 発表場所: 奈良
  • 年月日: 2010-09-14
• [学会発表] 分子シャペロンClpBにおけるミドルドメインWing-2の保存荷電残基の重要性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 渡邊久美子、中村俊樹、中崎洋介、水野さやか、吉田賢右、渡辺洋平
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-10-22
• [学会発表] ClpB変異体の基質糸通し活性の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中崎洋介、水野さやか、渡邊久美子、中村俊樹、吉田賢右、渡辺洋平
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-10-22
• [学会発表] サブユニット間ジスルフィド結合による分子シャペロンClpBの6量体構造の固定化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中村俊樹、中崎洋介、渡辺洋平
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-10-22