PASドメインタンパク質の多様な情報伝達は共通の機構で駆動しているか?

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21770175
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 奈良先端科学技術大学院大学
• 研究代表者: 山崎 洋一 奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 助教 (40332770)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• キーワード: 光生物学 / シグナル伝達 / タンパク質間相互作用 / PASドメイン

研究概要

PASドメインタンパク質の駆動原理を解析するため、2つの異なるPYPタンパク質をモデルとして、PASドメイン共通構造に内在するタンパク質構造変化様式を検証した。その結果、(1)両者において機能上重要な部位がN末端部位に存在していること。(2)補欠分子の結合部位は基本的に相同であるが、微小な差異によってその性質を変化させていること、(3)構造の土台となるC末端領域が個々のPYPの性質を大きく決定づけ、その他の領域はこのC末端部位との関係においては同様の性質を制御していることが示された。

研究成果

• [雑誌論文] Systematic alanine insertion reveals the essential regions that encode structure formation and activity of dihydrofolate reductase. (2011)
  • 著者名/発表者名: R.Shiba, M.Umeyama, S.Tsukasa, H.Kamikubo, Y.Yamazaki, M.Yamaguchi, M.Iwakura, M.Kataoka
  • 雑誌名: BIOPHYSICS 7巻 ページ: 1-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nonlocal interactions are responsible for tertiary structure formation in staphylococcal nuclease. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kato S, Kamikubo H, Hirano S, Yamazaki Y, Kataoka M.
  • 雑誌名: Biophys J. 98巻 ページ: 678-686
  • 査読あり
• [学会発表] Analysis of solution state of the interaction protein of Rc-PYP. (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Hayashi, Y.Yamazaki, H.Kamikubo, M.
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2010-09-21
• [学会発表] Substitution effects of basic residues in the photoactive yellow protein of Rhodobacter caplslatus. (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Yamazaki, H.Kamikubo, M.Kataoka.
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2010-09-21
• [学会発表] Photoactive Yellow Proteinにおける発色団の機能変調 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山崎洋一, 上久保裕生, 片岡幹
  • 学会等名: 第16回日本光生物学協会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-08-11
• [学会発表] 2種類のPYPにおける発色団の機能変調 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山崎洋一、上久保裕生、片岡幹雄
  • 学会等名: 分子研研究会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2010-03-23
• [学会発表] Light dependent enzyme activity control by use of interaction of the Rc-PYP. (2009)
  • 著者名/発表者名: H.Kubo, Y.Yamazaki, H.Kamikubo, M.Kataoka.
  • 学会等名: 第47回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2009-10-30
• [学会発表] Interaction mechanism of the photoactive yellow protein ofRhodobacter caplsolatus. (2009)
  • 著者名/発表者名: Y.Yamazaki, N.Ota, H.Kamikubo, M.Kataoka.
  • 学会等名: 第47回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2009-10-30
• [学会発表] The low-temperature spectroscopy of Rc-PYP. (2009)
  • 著者名/発表者名: Y.Hamaguchi, Y.Yamazaki, H.Kamikubo, M.Kataoka.
  • 学会等名: 第47回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2009-10-30
• [学会発表] Analysis of the different properties in two PYPs by use of chimera proteins. (2009)
  • 著者名/発表者名: K.Matsumoto, Y.Yamazaki, H.Kamikubo, M.Kataoka.
  • 学会等名: 第47回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2009-10-30
• [学会発表] Low-barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein. (2009)
  • 著者名/発表者名: S.Yamaguchi, H.Kamikubo, K.Kurihara, R.Kuroki, Y.Yamazaki, M.Kataoka.
  • 学会等名: 第47回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2009-10-30
• [学会発表] 光合成細菌Rhodobacter capsulatus由来PYPの光反応のpH依存性 (2009)
  • 著者名/発表者名: Y.Yamazaki, M.Sakoguchi, H.Kamikubo, M.Kataoka.
  • 学会等名: 第15回日本光生物学協会年会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2009-08-19