微量試料からの高効率クロマチンプルダウン法の開発

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21770251
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 発生生物学
• 研究機関: 京都大学 (2010-2011); 独立行政法人理化学研究所 (2009)
• 研究代表者: 栗本 一基 京都大学, 医学研究科, 助教 (20415152)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• キーワード: 生殖細胞 / エピジェネティクス

研究概要

本研究の目的は、哺乳類(マウス)の、始原生殖細胞をはじめとする少数の細胞における転写制御因子の結合部位を決定するための手法を開発することである。特定の転写因子に結合したゲノムDNAを効率よく精製するため、その転写因子に目印(タグ)をつけた遺伝子改変マウスや細胞を作成した。転写因子に結合したゲノムDNAを増幅する手法を開発し、定量的な増幅が行われる条件を見出した。これらを総合し、10, 000個の細胞において転写因子に結合したゲノム部位を決定できるようになった。

研究成果

• [雑誌論文] Epigenetic reprogramming in mouse pre-implantation development and primordial germ cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Saitou, M., Kagiwada, S., Kurimoto, K.
  • 雑誌名: Development 巻: 139 ページ: 15-31
  • DOI: DOI:139/1/15[pii],10.1242/dev.050849
• [雑誌論文] A global single-cell cDNA amplification method for quantitative micro array analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurimoto, K., and Saitou, M.
  • 雑誌名: Methods Mol Biol 巻: 687 ページ: 91-111
  • DOI: DOI:10.1007/978-1-60761-944-4_7
• [雑誌論文] Reconstitution of the mouse germ cell specification pathway in culture by pluripotentstem cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, K., Ohta, H., Kurimoto, K., Aramaki, S., and Saitou, M.
  • 雑誌名: Cell 巻: 146 ページ: 519-532
  • DOI: DOI:10.1016/j.cell.2011.06.052
  • 査読あり
• [雑誌論文] TDRD5is required for retrotransposon silencing, chromatoid body assembly, and spermiogenesis in mice (2011)
  • 著者名/発表者名: Yabuta, Y., Ohta, H., Abe, T., Kurimoto, K., Chuma, S., and Saitou, M.
  • 雑誌名: J Cell Biol 巻: 192 ページ: 781-795
  • DOI: DOI:10.1083/jcb.201009043
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single-cell cDNA micro array profiling of complex biological processes of differentiation (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurimoto, K., and Saitou, M.
  • 雑誌名: Curr Opin Genet Dev 巻: 20 ページ: 470-477
  • DOI: DOI:10.1016/j.gde.2010.06.003
• [雑誌論文] Conditional knockdown of Nanoginduces apoptotic cell death in mouse migrating primordial germ cells (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi, S., Kurimoto, K., Yabuta, Y., Sasaki, H., Nakatsuji, N., Saitou, M., and Tada, T.
  • 雑誌名: Development 巻: 136 ページ: 4011-4020
  • DOI: DOI:10.1242/dev.041160
  • 査読あり
• [学会発表] Global transcription profiling of complex biological processes of cellular differentiation at the single-cell resolution (2010)
  • 著者名/発表者名: Saitou, M., Kurimoto, K.
  • 学会等名: Pacific hem 2010, Recent Advances in Bioanalysis : Ultra-Small Volumes
  • 発表場所: Honolulu, Hawaii, USA
  • 年月日: 2010-12-19
• [図書] 卵子学第I章卵子の発生と新生/3生殖系列の決定機構とその特性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 栗本一基、斎藤通紀
  • 総ページ数: 1195
  • 出版者: 京都大学学術出版
• [図書] 単一細胞cDNA増幅法実験医学別冊・新遺伝子工学ハンドブック (2010)
  • 著者名/発表者名: 栗本一基, 斎藤通紀
  • 総ページ数: 365
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 哺乳類の生殖細胞形成を制御する分子機構実験医学Vol.27No.3(2月号) (2009)
  • 著者名/発表者名: 栗本一基, 山路剛史, 関由行, 斎藤通紀
  • 総ページ数: 480
  • 出版者: 羊土社