複合汚染環境における微生物遺伝子応答の網羅的解析と環境評価に関する研究

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21810021
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 環境影響評価・環境政策
• 研究機関: 愛媛大学
• 研究代表者: 濱村 奈津子 愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター・グローバルCOE, 准教授 (50554466)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• キーワード: メタトランスクリプトーム / ヒ素 / 微生物生態

研究概要

本研究では、複合汚染の現場生態系に及ぼす影響をより総合的に評価するため、環境微生物群の汚染物質暴露に対する遺伝子発現応答を網羅的に診断する手法の開発を目的とした。ヒ素等を含む汚染環境サンプルの解析では、汚染物質の毒性に対応して重金属耐性や代謝機能遺伝子の発現が検出された。それら遺伝子群の多くは複数の重金属類の輸送に関与しており、汚染に対応する指標マーカーとして有用である可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Distribution of aerobic arsenite oxidase genes within the Aquificales. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hamamura, N, R.E.Macur, Y.Liu, W.P.Inskeep, A-L.Reysenbach
  • 雑誌名: Interdisciplinary studies on Environmental Chemistry Vol.3 ページ: 47-55
• [雑誌論文] Metagenomes from high-temperature chemotrophic systems reveal importance of geochemical controls on microbial community structure and function. (2010)
  • 著者名/発表者名: Inskeep, W.P., D.B.Rusch, Z.Jay, M.J.Herrgard, M.A.Kozubal, T.H.Richardson, R.E.Macur, N.Hamamura, 他11名
  • 雑誌名: PLOS One Vol.5, No.3 ページ: e9773
  • 査読あり
• [学会発表] 環境中ヒ素動態に影響を及ぼす微生物群集機能の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 濱村奈津子
  • 学会等名: トピア科学シンポジウム「バイオレメディエーション微生物群の解析からデザイン化まで」講演要旨集,5.招待講演
  • 発表場所: 名古屋市
  • 年月日: 2011-01-28
• [学会発表] Comparative meta-transcriptomic analysis of Aquificales-dominant terrestrial hot springs. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hamamura N., Meneghin, J., Reysenbach, A-L.
  • 学会等名: TBI/INL/RCN- Metagenomic Analysis Workshop(講演要旨集5.)(ポスター発表)
  • 発表場所: Jackson Hole, Wyoming, U.S.A.
  • 年月日: 2011-01-14
• [学会発表] Diversity and functional analysis of bacterial communities associated with soda lake in Khovsgol. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hamamura N., Itai, T., Liu, Y., Inskeep, W.P., Reysenbach, A-L.
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第26回大会,講演要旨集,127.ポスター発表
  • 発表場所: つくば市
  • 年月日: 2010-11-25
• [学会発表] Comparative meta-transcriptomic analysis of Aquificales-dominant terrestrial hot springs. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hamamura N., Meneghin, J., Reysenbach, A-L.
  • 学会等名: The 13th International Symposium in Microbial Ecology, Abstracts, CT35.002.口頭発表
  • 発表場所: Seattle, Washington, USA
  • 年月日: 2010-08-26
• [学会発表] Comparative community gene expression analysis of Aquificales-dominant geothermal springs. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hamamura N., Meneghin, J., Reysenbach, A-L.
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物大会,講演要旨集,31.口頭発表
  • 発表場所: 福岡市
  • 年月日: 2010-03-08
• [学会発表] Comparative metatranscriptomics of Aquificales-dominant hot springs. (2009)
  • 著者名/発表者名: Hamamura N., Meneghin, J., Reysenbach, A-L.
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第25回大会,講演要旨集,24.口頭発表
  • 発表場所: 広島市
  • 年月日: 2009-11-21
• [備考] アウトリーチ活動:微生物生態学会平成22年度大会の一環として催した一般向け公開講座(微生物観察教室)の実行委員として企画運営を行った。(2010年11月23日開催)