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2010 年度 実績報告書

3次元構造を基にした、生理活性小分子化合物のデザイン

研究課題

研究課題/領域番号 21870016
研究機関京都大学

研究代表者

佐藤 慎一  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 助教 (70534478)

キーワードX線結晶解析 / 標的タンパク質同定 / 生理活性化合物 / 分子設計 / 分子認識
研究概要

本研究では、生理活性物質レンチノロールとその標的タンパク質複合体の構造を解析し、その構造情報を基にレンチノロールを分子設計し、標的タンパク質への特異性の向上を目指した。本年度では、レンチノロールアフィニティー樹脂により同定した、標的タンパク質S-100A11、S-100A13およびS-100A16とレンチノロールの共結晶をそれぞれ作成し、X線結晶解析による複合体の構造決定を目指した。結晶構造解析を行うために、リコンビナントS-100A11、S-100A13およびS-100A16を大量発現・精製を行った。また、レンチノロールを合成により、大量調整した。調整したS100タンパク質とレンチノロールは完全なS100タンパク質-wrenchnolol複合体を形成させるために、モル比でwrenchnolol過剰となるように混ぜることで複合体形成を行った。複合体の形成は、wrenchnolol-S100タンパク質のUV吸収をモニタリングすることで行った。複合体のUV吸収波形は、レンチノロールのUV吸収波形とS100タンパク質のUV吸収波形をそれぞれ合算することで予想した。得られたS100タンパク質-wrenchnolol複合体は、限外ろ過を利用して緩衝液の置換(50mM Tris-HCl (pH.7.0) containing 1mM CaCl2)を行い、最終的に2mMの濃度までS100タンパク質-wrenchnolol複合体を濃縮した。得られたS100A11-wrenchonolol複合体溶液は、共結晶作成条件をキットによりそれぞれ960種の条件をスクリーニングした。このスクリーニングにより数種類の結晶を作成することに成功した。得られた結晶は、Crystal stainを用いてタンパク質結晶であることを確認した。しかしながら、X線結晶解析が行える良質のタンパク質の結晶を得るまでには至らず、再度、結晶化条件を検討することで良質の結晶を得られる条件を決定する必要がある。今後、良質な共結晶を作製し、X線結晶解析によりwrenchnolol-S100A11複合体の共結晶の構造を解く予定である。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Small-molecule fluorescent probes for specific RNA targets2011

    • 著者名/発表者名
      Murata, A., Sato, S., Kawazoe, Y., Uesugi M.
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 47 ページ: 4712-4714

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Marine Natural Product Aurilide Activates the OPA1-Mediated Apoptosis by Binding to Prohibitin2011

    • 著者名/発表者名
      Sato, S., Murata, A., Orihara, T., Shirakawa, T., Suenaga, K., Kigoshi, H., Uesugi, M.
    • 雑誌名

      Chemistry & Biology

      巻: 18 ページ: 131-139

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deactivation of STAT6 through serine 707 phosphorylation by JNK2011

    • 著者名/発表者名
      Shirakawa, T., Kawazoe, Y., Tsujikawa, T., Jung, D., Sato, S., Uesugi M.
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry

      巻: 286 ページ: 4003-4010

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biochemical target isolation for novices : affinity-based strategies2010

    • 著者名/発表者名
      Sato, S., Murata, A., Shirakawa, T., Uesugi, M.
    • 雑誌名

      Chemistry & Biology

      巻: 17 ページ: 616-623

    • 査読あり
  • [学会発表] Natural Product Aurilide Activates the OPA1-Mediated Apoptosis by Binding to Prohibitin.2010

    • 著者名/発表者名
      Sato, S., Murata, A., Orihara, T., Suenaga, K., Kigoshi, H., Uesugi, M.
    • 学会等名
      The 8th iCeMS International Symposium
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 年月日
      2010-11-01
  • [学会発表] Protein Target Identification of Bioactive Small Molecules.2010

    • 著者名/発表者名
      Sato, S.
    • 学会等名
      University of Georgia, Department of Chemistry Seminar
    • 発表場所
      Athens, Georgia, USA
    • 年月日
      2010-10-06
  • [図書] 生理活性物質による創薬標的同定のコツ2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤慎一, 村田亜沙子, 白川貴詩, 上杉志成
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      創薬研究のためのタンパク質・プロテオミクス解析

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公開日: 2012-07-19  

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