ダイズの乾燥耐性向上に向けたGmNAC転写因子の包括的解析

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 21870046
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 植物分子生物・生理学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: TRAN Lam-Son・P 独立行政法人理化学研究所, 発現調節研究ユニット, ユニットリーダー (10549009)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2010
• キーワード: ダイズ / 転写因子 / GmNAC / データベース / シス因子解析 / アノテーション

研究概要

ダイズの全ゲノム配列よりNAC転写因子であるGmNAC遺伝子を包括的に解析し、データベースを作成した。さらにGmNAC遺伝子とその上流因子である2成分制御系(TCS)について詳しい解析を行った。本研究は、乾燥応答性NACシグナル伝達経路とそれを制御する2成分制御系の基盤研究としてだけでなく、遺伝子組み換え技術をもちいた乾燥耐性ダイズ作製に必要なGmNAC遺伝子および乾燥応答性プロモーターを選抜するためにも役立つものである。

研究成果

• [雑誌論文] Genome-wide survey and expression analysis of plant-specific NAC transcription factor family in soybean during development and dehydration stress. (2011)
  • 著者名/発表者名: Le TD, Nishiyama R, Watanabe Y, Mochida K, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, Tran LS
  • 雑誌名: DNA Res (accepted)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Progress studies of drought-responsive genes in rice. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hadiarto T, Tran LS
  • 雑誌名: Plant Cell Reports 30 ページ: 297-310
  • 査読あり
• [雑誌論文] LegumeTFDB : An integrative database of Glycine max, Lotus japonicus and Medicago truncatula transcription factors. (2010)
  • 著者名/発表者名: Mochida K, Yoshida T, Sakurai T, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, Tran LS
  • 雑誌名: Bioinformatics 26 ページ: 290-291
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of two-component system and prediction of stress-responsive TCS members in soybean. (2010)
  • 著者名/発表者名: Mochida K, Yoshida T, Sakurai T, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, Tran LS
  • 雑誌名: DNA Res 17 ページ: 303-324
  • 査読あり
• [雑誌論文] Amino acids conferring herbicide resistance in tobacco acetohydroxyacid synthase. (2010)
  • 著者名/発表者名: Le TD, Choi J-D, Tran LS
  • 雑誌名: GM Crops 1 ページ: 62-67
  • 査読あり
• [雑誌論文] Potential utilization of NAC transcription factors to enhance abiotic stress tolerance in plants by biotechnological approach. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tran LS, Nishiyama R, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K
  • 雑誌名: GM Crops 1 ページ: 34-41
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional genomics of soybean for improvement of productivity in adverse conditions. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tran LS, Mochida K
  • 雑誌名: Funct Integr Genomics 10 ページ: 447-462
  • 査読あり
• [雑誌論文] A platform for functional prediction and comparative analyses of transcription factors of legumes and beyond. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tran LS, Mochida K
  • 雑誌名: Plant Signal Behav(Addendum to Mochida K et al. Bioinformatics 26: 290-291) 5 ページ: 550-552
• [雑誌論文] Identification and prediction of abiotic stress responsive transcription factors involved in abiotic stress signaling in soybean. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tran LS, Mochida K
  • 雑誌名: Plant Signal Behav(Addendum to Mochida K et al. DNA Res 16: 353-369) 5 ページ: 255-257
• [雑誌論文] Role of cytokinin responsive two- component system in ABA and osmotic stress signalings. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tran LS, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K
  • 雑誌名: Plant Signal Behav(Addendum to Tran LS et al. PNAS 104: 20623-8) 5 ページ: 148-150
• [雑誌論文] In silico analysis of transcription factor repertoire and prediction of stress responsive transcription factors in soybean. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mochida K, Yoshida T, Sakurai T, Yamaguchi-Shinozaki K, Shinozaki K, Tran LS
  • 雑誌名: DNA Res 16 ページ: 353-369
  • 査読あり
• [図書] Environmental Adaptations and Stress Tolerance of Plants in the Era of Climatic Change(eds.Ahmad P and Prasad MNV)(Transcription factors involved in environmental stress response in plants) (2011)
  • 著者名/発表者名: Xin H, Qin F, Tran LS
  • 出版者: Springer Science, New York, NY 10013, USA(in press)
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://labs.psc.riken.jp/spru/
• [備考] ダイズの全転写因子データベース(SoybeanTFDB)
  • URL: http://soybeantfdb.psc.riken.jp
• [備考] マメ科植物の転写因子統合データベース(LegumeTFDB)
  • URL: http://legumetfdb.psc.riken.jp/index.pl