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2010 年度 実績報告書

チャルメルソウ属の送粉様式を支配する「種分化遺伝子」の単離および進化生態学的解析

研究課題

研究課題/領域番号 21870051
研究機関独立行政法人国立科学博物館

研究代表者

奥山 雄大  独立行政法人国立科学博物館, 植物研究部, 研究員 (40522529)

キーワード種分化 / SuperSAGE法 / トランスクリプトーム / 次世代DNAシーケンサー / 遺伝マーカー / 花香成分
研究概要

作年度行ったチャルメルソウ節を10種間でのゲノムワイドかつ網羅的なトランスクリプトーム比較結果と、対応する匂い成分プロファイルのデータとの間で相関解析を行い、それぞれの花香成分の放出パターンと強く相関する発現パターンを示す遺伝子を物質ごとにそれぞれ2-46遺伝子特定した。これらのうち、モノテルペンであるライラックアルデヒド(LALs)の放出パターンと相関していた13遺伝子について、その周辺配列を決定し、遺伝子アノテーションを行ったところ、この中にはチトクロムP450遺伝子やテルペノイド生合成MEP経路の起点となる遺伝子DXSなど、明らかにLALsの生合成に関与すると考えられる遺伝子群が含まれていた。
特にここで得られた1遺伝子についてさらなる解析を進め、この遺伝子が正の自然淘汰を受けた痕跡である加速分子進化パターンを示し、さらにLALsを生合成できないチャルメルソウ属3種において独立に擬遺伝子化していることを突き止めた。すなわち本研究で新規に得られた遺伝子は、遺伝子配列と遺伝子発現の両面から実際にLALs生合成の鍵になる完全な新規遺伝子である可能性が高いことが示された。
またこの結果を遺伝学的に確認するため、ライラックアルデヒドを放出するミカワチャルメルソウと放出しないコチャルメルソウの間の雑種F2世代を230個体作成した。またこれらの開花個体すべてから花の匂い成分プロファイルを得るための大規模匂い捕集システムを開発した。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (4件) 図書 (2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] A multi-faceted genomics approach allows the isolation of rice Pia-blast resistance gene consisting of two adjacent NBS-LRR protein genes.2011

    • 著者名/発表者名
      Yudai Okuyama, Hiroyuki Kanzaki, Akira Abe, Kentaro Yoshida, Muluneh Tamiru, Hiromasa Saitoh, Takahiro Fujibe, Hideo Matsumura, Matt Shenton, Dominique Clark Galam, Jerwin Undan, Akiko Ito, Teruo Sone, Ryohei Terauchi
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 66 ページ: 467-479

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Which genus to study? In search of plant genera underrepresented or overrepresented in the research from the flora of Japan.2010

    • 著者名/発表者名
      Yudai Okuyama
    • 雑誌名

      Bulletin of the National Museum of Nature and Science.Series B, Botany

      巻: 36 ページ: 82-89

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Arabidopsis Qa-SNARE SYP2 proteins localized to different subcellular regions function redundantly in vacuolar protein sorting and plant development.2010

    • 著者名/発表者名
      Makoto Shirakawa, Haruko Ueda, Tomoo Shimada, Yasuko Koumoto, Takashi L.Shimada, Maki Kondo, Taku Takahashi, Yudai Okuyama, Mikio Nishimura, Ikuko Hara-Nishimura
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 64 ページ: 924-935

    • 査読あり
  • [学会発表] 形質、遺伝子、適応をつなぐ-新しい多様性生物学への挑戦-2011

    • 著者名/発表者名
      奥山雄大
    • 学会等名
      日本生態学会第58回全国大会
    • 発表場所
      札幌市札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2011-03-10
  • [学会発表] 多様な生活史形質を決定する遺伝子の探索:非モデル生物で行う多種間比較オミクス2011

    • 著者名/発表者名
      奥山雄大
    • 学会等名
      日本分類学会連合第10回公開シンポジウム
    • 発表場所
      国立科学博物館新宿分館
    • 年月日
      2011-01-09
  • [学会発表] Use of phylogenetic-based multi-species comparison to identify the key determinants in plant pollinator interactions.2010

    • 著者名/発表者名
      Yudai Okuyama, Tomoko Okamoto, Ryutaro Goto, Makoto Kato
    • 学会等名
      Memorial Symposium for the 26th International Prize for Biology"Biology of Symbiosis"-Celebrating Dr.Nancy A.Moran-
    • 発表場所
      茨城県つくば市エポカルつくば
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] 分子系統樹を用いた比較法と祖先形質復元:膨大な生物多様性情報を活用する.ため.に(進化学・夏の学校)2010

    • 著者名/発表者名
      奥山雄大
    • 学会等名
      日本進化学会第12回東京大会
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山キャンパス
    • 年月日
      2010-08-02
  • [図書] 日本の固有植物2011

    • 著者名/発表者名
      加藤雅啓、海老原淳 編(共著)
    • 総ページ数
      503
    • 出版者
      東海大学出版会
  • [図書] The Handbook of Plant Mutation Screening : Mining of Natural and Induced Alleles.Chapter 11.Use of TILLING for Reverse and Forward Genetics of Rice.2011

    • 著者名/発表者名
      Sujay Rakshit, Hiroyuki Kanzaki, Hideo Matsumura, Arunita Rakshit, Takahiro Fujibe, Yudai Okuyama, Kentaro Yoshida, Muluneh Oli, Matt Shenton, Hiroe Utsushi, Chikako Mitsuoka, Akira Abe, Yutaka Kiuchi, Ryohei Terauchi
    • 総ページ数
      13(185-197)
    • 出版者
      Wiley-VCH Verlag GmbH & Co.KGaA, Weinheim, Germany.
  • [備考]

    • URL

      http://www.kahaku.go.jp/research/researcher/researcher.php?d=yokuyama

  • [備考]

    • URL

      https://sites.google.com/site/okuyamanokenkyuupeji/home

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公開日: 2012-07-19  

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