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2023 年度 実績報告書

クチナーゼCut190のCa2+結合に伴う動的構造変化とPET分解分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21H02120
研究機関京都府立大学

研究代表者

織田 昌幸  京都府立大学, 生命環境科学研究科, 教授 (20318231)

研究分担者 関口 博史  公益財団法人高輝度光科学研究センター, 回折・散乱推進室, 主幹研究員 (00401563)
沼本 修孝  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (20378582)
神谷 成敏  兵庫県立大学, 情報科学研究科, 特任教授 (80420462)
宮ノ入 洋平  大阪大学, 蛋白質研究所, 准教授 (80547521)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワード酵素 / PET分解 / 構造機能相関
研究実績の概要

放線菌Saccharomonospora viridis AHK190由来のクチナーゼ(Cut190)の分子内にジスルフィド結合を導入した変異体(Cut190**SS)を鋳型とした高機能化変異体の探索で、F77L変異に加えて、E184R変異でも、PET分解の高機能化が認められた。両部位は、Ca2+結合サイト(Site 1とSite 3)にあり、Ca2+結合に伴うCut190の構造変化を制御することが、高機能化に繋がることを示唆した。これら高機能化変異体と基質アナログとの共結晶化に取り組み、高機能化の構造機能相関を解明することを行ったが、現時点で、高分解能構造を得られていない。一方、MD計算の結果、F77L変異により、種々の結晶構造のうちclosed型の増加が示された。結晶構造情報に基づき、Ca2+が結合してopen型に、続いてCa2+が解離してclosed型に変化し、基質を加水分解する知見を踏まえると、F77L変異が加水分解時の構造分布を増やすことで、活性が高まったと考えられる。また種々のPET分解反応条件も検討した。高圧下でのPET分解の効率化は、100 MPa程度で認められ、同高圧下では、65, 70, 75℃のうち、70℃が最も高効率であることが示された。これはPETのガラス転移温度(約70℃)付近が最適で、より高温側(75℃)では、PETの結晶化度が高まり、分解効率が低下したと考えられる。また微粉化したPETを用いることで、分解効率が高まるが、さらに反応溶液を振盪させることでも分解効率が高まった。この結果は、PETと酵素との接触効率が、分解の効率化に寄与することを示唆する。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] クチナーゼCut190のPET 分解能向上による実用化のための基盤及び実証研究2024

    • 著者名/発表者名
      近藤 史弥, 加藤 稔, 織田 昌幸
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 62 ページ: 82-87

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Improvement of the Thermostability and Activity of the PET-Degrading Enzyme Cut190 toward a Detailed Understanding and Application of the Enzymatic Reaction Mechanism2023

    • 著者名/発表者名
      Numoto Nobutaka, Kamiya Narutoshi, Oda Masayuki
    • 雑誌名

      ACS Books, Sustainable Green Chemistry in Polymer Research

      巻: 1 ページ: 89-100

    • DOI

      10.1021/bk-2023-1450.ch006

    • 査読あり
  • [学会発表] PET分解酵素Cut190の高機能化と構造機能相関解析2024

    • 著者名/発表者名
      近藤 史弥、Gert-Jan Bekker、神谷 成敏、沼本 修孝、織田 昌幸
    • 学会等名
      日本農芸化学会関西支部第529回講演会
  • [学会発表] PET分解酵素Cut190のアロステリック反応機構に基づく機能向上変異体の合理的設計2023

    • 著者名/発表者名
      沼本 修孝、Gert-Jan Bekker、神谷 成敏、織田 昌幸、伊藤 暢聡
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会年会
  • [学会発表] PET分解酵素Cut190のCa2+結合部位に着目した構造機能相関解析2023

    • 著者名/発表者名
      近藤 史弥、Gert-Jan Bekker、神谷 成敏、沼本 修孝、織田 昌幸
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
  • [学会発表] PET分解酵素Cut190の構造機能解析とLCCとの比較に基づく高機能化の検討2023

    • 著者名/発表者名
      竹中 理莉、近藤 史弥、織田 昌幸
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会

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公開日: 2024-12-25  

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