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2021 年度 実績報告書

細胞核内のアクチン繊維によるゲノム機能制御のメカニズム解明と応用展開

研究課題

研究課題/領域番号 21H02151
研究機関東北大学

研究代表者

原田 昌彦  東北大学, 農学研究科, 教授 (70218642)

研究分担者 堀籠 智洋  東北大学, 農学研究科, 助教 (10771206)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワード細胞核 / クロマチン / 核内アクチン / テラヘルツ光
研究実績の概要

細胞核内のクロマチン構造や核内配置がゲノム機能の制御に重要な役割を果たしている。アクチンとアクチンファミリーは、これまでにも細胞質での機能が知られているが、細胞核内ではクロマチン構造変化や核内配置においても重要や役割を果たしている。我々は、これまでにも遺伝子発現やDNA損傷修復に核内アクチンが関与していることを示している。本研究では、遺伝子発現制御とDNA損傷修復における、核内アクチン繊維とクロマチンの相互作用メカニズムを明らかにし、合成二重環状ペプチドやテラヘルツ光を核内アクチン繊維に作用させることで、ゲノム機能制御の人為操作技術の基盤を確立することを目的としている。これまでの出芽酵母や培養細胞を用いた解析によって、ヒストンバリアントH2A.Zが導入されているゲノム領域と、核内アクチンのクロマチン結合領域での重複が観察された。また、培養細胞にテラヘルツ光を照射することで、細胞質のアクチン繊維形成が促進されること、また細胞周期の細胞質分裂の際に、アクチン収縮管の脱重合が抑制されて細胞質分裂が抑制されることなどが示された。さらに、培養細胞に抗がん剤などを作用させてDNA二重鎖切断を誘導させた状態でテラヘルツ光を細胞に照射することによって、DNA損傷修復を促進させる効果があることも示された。これらの観察結果は、核内アクチンがゲノム機能制御に重要な役割を果たすと共に、テラヘルツ光による核内アクチン制御がゲノム機能の人為制御に有用である可能性を示している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

ヒストンバリアントH2A.Zが導入されているゲノム領域と、核内アクチンのクロマチン結合領域での重複を示すことができた。また、培養細胞にテラヘルツ光を照射することで、細胞質のアクチン繊維形成が促進されること、また細胞周期の細胞質分裂の際に、アクチン収縮管の脱重合が抑制されて細胞質分裂が抑制されることなどが示された。さらに、培養細胞に抗がん剤などを作用させてDNA二重鎖切断を誘導させた状態でテラヘルツ光を細胞に照射することによって、DNA損傷修復を促進させる効果があることを示すことができた。

今後の研究の推進方策

ゲノム機能制御におけるアクチンの重要性や、テラヘルツ光による人為制御可能性を示すことができたため、このような現象をさらに詳細に解析すると共に、このような現象を支える分子メカニズムについても解析を進める。

  • 研究成果

    (26件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 3件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 3件、 招待講演 6件)

  • [国際共同研究] Institute of Molecular Genetics(チェコ)

    • 国名
      チェコ
    • 外国機関名
      Institute of Molecular Genetics
  • [雑誌論文] Near-field sensor array with 65-GHz CMOS oscillators can rapidly and comprehensively evaluate drug susceptibility of Mycobacterium.2023

    • 著者名/発表者名
      Kikuchi S, Yamashige Y, Hosoki R, Harata M, Ogawa Y.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 ページ: 3825

    • DOI

      10.1038/s41598-023-30873-9

    • 査読あり
  • [雑誌論文] PIP2-Effector Protein MPRIP Regulates RNA Polymerase II Condensation and Transcription.2023

    • 著者名/発表者名
      Balaban C, Sztacho M, Antiga L, Miladinovi A, Harata M, Hozak P.
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 13 ページ: 426

    • DOI

      10.3390/biom13030426

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The auxin-inducible degron 2 (AID2) system enables controlled protein knockdown during embryogenesis and development in Caenorhabditis elegans.2022

    • 著者名/発表者名
      Negishi T, Kitagawa S, Horii N, Tanaka Y, Haruta N, Sugimoto A, Sawa H, Hayashi KI, Harata M, Kanemaki MT.
    • 雑誌名

      Genetics

      巻: 220 ページ: iyab218

    • DOI

      10.1093/genetics/iyab218

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 次世代放射光施設の特徴と利活用に向けた取り組み2022

    • 著者名/発表者名
      原田 昌彦, 高田 昌樹, 村松 淳司
    • 雑誌名

      オレオサイエンス

      巻: 22 ページ: 55-60

    • DOI

      10.5650/oleoscience.22.55

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 食品研究における放射光のポテンシャル:次世代放射光施設活用に向けた取り組み2022

    • 著者名/発表者名
      日髙將文、原田昌彦
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 60 ページ: 499-501

    • DOI

      10.1271/kagakutoseibutsu.60.499

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nucleoskeleton proteins for nuclear dynamics.2021

    • 著者名/発表者名
      Miyamoto K, Harata M.
    • 雑誌名

      J Biochem.

      巻: 169 ページ: 237-241

    • DOI

      10.1093/jb/mvab006.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] THz irradiation inhibits cell division by affecting actin dynamics.2021

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki S, Ueno Y, Hosoki R, Saito T, Idehara T, Yamaguchi Y, Otani C, Ogawa Y, Harata M, Hoshina H.
    • 雑誌名

      PLoS One.

      巻: 16 ページ: :e0248381

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0248381.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] In Vitro-Evolved Peptides Bind Monomeric Actin and Mimic Actin-Binding Protein Thymosin-β4.2021

    • 著者名/発表者名
      Gubeli RJ, Bertoldo D, Shimada K, Gerhold CB, Hurst V, Takahashi Y, Harada K, Mothukuri GK, Wilbs J, Harata M, Gasser SM, Heinis C.
    • 雑誌名

      ACS Chem Biol.

      巻: 16 ページ: 820-828

    • DOI

      10.1021/acschembio.0c00825.

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Modulating dynamics and function of nuclear actin with synthetic bicyclic peptides.2021

    • 著者名/発表者名
      Machida N, Takahashi D, Ueno Y, Nakama Y, Gubeli RJ, Bertoldo D, Harata M.
    • 雑誌名

      J Biochem

      巻: 169 ページ: 295-302

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa130.

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Analysis of the molecular evolution of histone variant H2A.Z using a linker-mediated complex strategy and yeast genetic complementation.2021

    • 著者名/発表者名
      Kitagawa S, Kusakabe M, Takahashi D, Narimiya T, Nakabayashi Y, Seki M, Horigome C, Harata M.
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem.

      巻: 86 ページ: 104-108

    • DOI

      10.1093/bbb/zbab190.

    • 査読あり
  • [学会発表] 食・農領域における放射光のポテンシャル:ナノテラス利活用に向けた東北大学農学研究科の取組2023

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      岩手大学放射光利用セミナー
    • 招待講演
  • [学会発表] 食・農領域におけるNanoTerasu利活用に向けた東北大学農学研究科の取組2023

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      NanoTerasuが結ぶ食・農研究の連携ネットワーク
    • 招待講演
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡と放射光の連携で視るneo日本酒像2023

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      東北大学ソフトマテリアル研究拠点2022年度活動報告会
    • 招待講演
  • [学会発表] 食・農領域での次世代放射光利活用の推進2023

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦、高山裕貴、日髙將文
    • 学会等名
      第166回微小光学研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] 東北大学農学研究科における放射光利用への取り組み2022

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      北海道大学ー東北大学連携による食・農領域放射光利用シンポジウム:放射光の「ナノの眼」と大学連携が拓く食と農の未来
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞内蛋白質に対するテラヘルツ光照射影響2022

    • 著者名/発表者名
      上野佑也、山崎祥他、大谷知行、原田昌彦、保科宏道
    • 学会等名
      理研シンポジウム第 9 回「光量子工学研究」―エクストリームフォトニクスが拓く未来の光科学―
  • [学会発表] フッ素系不活性液体添加による細菌増殖促進メカニズムの解析2022

    • 著者名/発表者名
      細木亮輔、川田晃士、山重貴久、菊池正二郎、小川雄一、原田昌彦
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
  • [学会発表] Perfluorocarbonの増殖促進効果メカニズム:アセテートの増殖抑制効果に対する影響の解析2022

    • 著者名/発表者名
      川田晃士, 細木亮輔, 山重貴久, 菊池正二郎, 小川雄一, 原田昌彦
    • 学会等名
      2022年度 農芸化学会京都大会
  • [学会発表] THz Irradiation Reduces The DNA Damage Marker γH2AX In Human Cells: THz Wave Enhances DNA Damage Repair?2022

    • 著者名/発表者名
      Yuya Ueno, Shota Yamazaki, Hiromichi Hoshina, Masahiko Harata
    • 学会等名
      2022 47th International Conference on Infrared, Millimeter and Terahertz Waves (IRMMW-THz)
    • 国際学会
  • [学会発表] テラヘルツ光照射によるDNA損傷修復の制御2022

    • 著者名/発表者名
      上野佑也, 山崎祥他, 保科宏道, 原田昌彦
    • 学会等名
      令和4年度 日本農芸化学会 北海道・東北支部 合同支部会
  • [学会発表] Modulation of DNA damage repair in living cells by THz irradiation2022

    • 著者名/発表者名
      Yuya Ueno、 Shota Yamazaki, Hiromichi Hoshina, and Masahiko Harata
    • 学会等名
      FTT2022
  • [学会発表] 早老症における細胞核内アクチン繊維変化の解析と病態抑制の試み2022

    • 著者名/発表者名
      高橋祐人、名嘉真良広、松下純平、原田昌彦
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] テラヘルツ光照射によるDNA損傷修復への影響2022

    • 著者名/発表者名
      上野佑也、山崎祥他、保科宏道、原田昌彦
    • 学会等名
      理研シンポジウム:第10回「光量子工学研究」ポストコロナ時代の新しい光科学
  • [学会発表] Noninvasive manipulation of actin polymerization in living cells: experimental applications of terahertz wave irradiation and fluorocarbon solvents2022

    • 著者名/発表者名
      Ryosuke Hosoki, Yuya Ueno, Shota Yamazaki, Hiromichi Hoshina,Yuichi Ogawa,Masahiko Harata
    • 学会等名
      16TH INTERNATIONAL CONGRESS OF HISTOCHEMISTRY AND CYTOCHEMISTRY
    • 国際学会
  • [学会発表] Crosstalks between actin and actin-related proteins in nuclear organization and functions2022

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      16th International Congress of Histochemistry and Cytochemistry
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2023-12-25  

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