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FKBPはFK506免疫抑制剤と結合し脱リン酸化酵素カルシニューリンを抑制することが知られている。カルシニューリンは細胞内カルシウムレベルによって活性化され、様々な標的タンパク質を脱リン酸化し、その機能を制御する。転写因子NFATはカルシニューリンの主要な標的のひとつで、免疫応答、悪性腫瘍の形質転換など、様々な生物学的活動において重要な役割を果たしている。NFATは、カルシニューリンによって脱リン酸化され、核内に移動して転写活性化をもたらす。FKBPはNFATの局在制御や安定性を担っている可能性が示唆された。NFATの分解制御については不明な点が多く、カルシニューリンがNFATの安定性に寄与しているかどうかも不明である。カルシニューリン阻害がNFATタンパク質の安定性に及ぼす影響を検討し、カルシニューリンによるNFATの脱リン酸化がNFATの安定化を促進すること、一方、リン酸化酵素活性が欠損したカルシニューリン変異体はNFATを安定化できないことを見出した。カルシニューリンの活性化に必須な細胞内カルシウムイオン濃度の上昇も、NFATの安定化を誘導した。さらに、SCFユビキチンリガーゼ複合体のF-boxタンパク質であるS-phase kinase associated protein 2が、カルシニューリンの枯渇時にNFATの分解を媒介する因子であることを同定した。
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