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2022 年度 実績報告書

酸化還元状態に厳密に留意した植物型Fdと光合成蛋白質との複合体構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 21H02417
研究機関大阪大学

研究代表者

栗栖 源嗣  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (90294131)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワード光合成 / 構造生物学 / 生物物理学 / 電子伝達複合体
研究実績の概要

光合成電子伝達は直鎖型と循環型の2種類の電子伝達経路が存在することが知られている。循環型の場合に光化学系Iから伝わったFdの還元力がチラコイド膜中のプラストキノン(PQ)に戻ってくるが、未だにその分子機構の詳細はわかっていない。我々は、チラコイド膜中のPQと電子伝達蛋白質プラストシアニン間の酸化還元反応を触媒するシトクロムb6f複合体に着目した。ホウレン草からb6f複合体を精製すると、ほぼ1対1の割合でFNRが結合してくる。b6f複合体に結合したFNRがFdからの電子を受け取り、PQを還元する電子伝達経路が強く示唆される状況にあった。そこで、ホウレン草由来FNRを大腸菌発現系をもちいて大量に調製し、b6f複合体に対して等温滴定熱測定を実施した。その結果、FNRの結合はb6f複合体の可溶化にもちいる界面活性剤(UDM)の影響を強く受けており、FNR自体がUDMの影響で一部変性している可能性が示唆された。今後、FNRとシトクロムb6f複合体の構造解析を行うためには、UDMを用いない精製法を確立し、FNRと十分に強く結合する条件を検討する必要があることがわかった。電子伝達に伴う機能的構造変化や、効率的な電子伝達機構を明らかにする目的で、好熱性シアノバクテリアPSIと電子受容体であるFdおよび電子供与体であるシトクロムc6(Cyt c6)を結合した三重複合体の構造解析に挑戦した。各電子伝達蛋白質の酸化還元状態に留意した試料調整を行い、PSI:Fd:Cyt c6の三重複合体のCryo-EM構造を1.97A分解能で構造解析することに成功した。側鎖の構造変化や,水分子を介した相互作用までも可視化することができ、特にPSIとFdとでITC測定を併用することで、複合体形成がエントロピー駆動型であることを明らかにすることができた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初,担当の大学院生(留学生)の来日がCOVID-19の影響で遅くなり,研究の進捗が心配されたが,現在は概ね順調に進展している。

今後の研究の推進方策

緑藻クラミドモナス由来PSIとFdとの複合体構造解析については,現在,論文のリバイス中であり,論文発表は非常に現実的であると考えている。また,今後,[FeFe]-ヒドロゲナーゼの複合体構造解析においては,構造決定に成功した酸素耐性をもつ[FeFe]ヒドロゲナーゼ(論文投稿中)の不活化型を利用することも検討する。

  • 研究成果

    (15件)

すべて 2022 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 3件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (4件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Department of Biological Sciences/Purdue University(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Department of Biological Sciences/Purdue University
  • [国際共同研究] Department of Biotechnology and Biology/Ruhr University Bochum(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      Department of Biotechnology and Biology/Ruhr University Bochum
  • [国際共同研究] Department of Plant Biology/University of Muenster(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      Department of Plant Biology/University of Muenster
  • [雑誌論文] Isothermal titration calorimetry of membrane protein interactions: FNR and the cytochrome b6f complex2022

    • 著者名/発表者名
      Zakharov Stanislav D.、Savikhin Sergei、Misumi Yuko、Kurisu Genji、Cramer William A.
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 121 ページ: 300~308

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2021.12.014

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Energy transfer fluctuation observed by single-molecule spectroscopy of red-shifted bacteriochlorophyll in the homodimeric photosynthetic reaction center2022

    • 著者名/発表者名
      Kondo Toru、Mutoh Risa、Arai Shun、Kurisu Genji、Oh-oka Hirozo、Fujiyoshi Satoru、Matsushita Michio
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 156 ページ: 105102~105102

    • DOI

      10.1063/5.0077290

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structures of multisubunit membrane complexes with the CRYO ARM 2002022

    • 著者名/発表者名
      Gerle Christoph、Kishikawa Jun-ichi、Yamaguchi Tomoko、Nakanishi Atsuko、?oruh Orkun、Makino Fumiaki、Miyata Tomoko、Kawamoto Akihiro、Yokoyama Ken、Namba Keiichi、Kurisu Genji、Kato Takayuki
    • 雑誌名

      Microscopy

      巻: 71 ページ: 249~261

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfac037

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure of cyanobacterial photosystem I complexed with ferredoxin at 1.97?? resolution2022

    • 著者名/発表者名
      Li Jiannan、Hamaoka Noriyuki、Makino Fumiaki、Kawamoto Akihiro、Lin Yuxi、R?gner Matthias、Nowaczyk Marc M.、Lee Young-Ho、Namba Keiichi、Gerle Christoph、Kurisu Genji
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 5 ページ: 951

    • DOI

      10.1038/s42003-022-03926-4

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Crystal structure and reaction mechanism of a bacterial Mg‐dechelatase homolog from the Chloroflexi <i>Anaerolineae</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Dey Debayan、Nishijima Masayoshi、Tanaka Ryouichi、Kurisu Genji、Tanaka Hideaki、Ito Hisashi
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 31 ページ: e4430

    • DOI

      10.1002/pro.4430

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of Active-Center Reduction of Plant-Type Ferredoxin on Its Structure and Dynamics: Computational Analysis Using Molecular Dynamics Simulations2022

    • 著者名/発表者名
      Nakayoshi Tomoki、Ohnishi Yusuke、Tanaka Hideaki、Kurisu Genji、Kondo Hiroko X.、Takano Yu
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 23 ページ: 15913~15913

    • DOI

      10.3390/ijms232415913

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural insights into blue-green light utilization by marine green algal light harvesting complex II at 2.78 ?2022

    • 著者名/発表者名
      Seki Soichiro、Nakaniwa Tetsuko、Castro-Hartmann Pablo、Sader Kasim、Kawamoto Akihiro、Tanaka Hideaki、Qian Pu、Kurisu Genji、Fujii Ritsuko
    • 雑誌名

      BBA Advances

      巻: 2 ページ: 100064~100064

    • DOI

      10.1016/j.bbadva.2022.100064

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Structure of cyanobacterial photosystem I complexed with Cytochrome c6 and Ferredoxin2022

    • 著者名/発表者名
      Jiannan Li、浜岡紀之、牧野文信、川本晃大、難波啓一、Christoph Gerle、栗栖源嗣
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
  • [学会発表] Neutron crystallographic analysis of ferredoxin-NADP+ reductase2022

    • 著者名/発表者名
      Midori UENKA, Yusuke OHNISI, Hideaki TANAKA, Genji KURISU
    • 学会等名
      日本生物物理学会
  • [学会発表] Cryo-EM structure of cytochrome b6f complex from Chlamydomonas reinhardtii reveals the functional domain movement of Rieske ISP2022

    • 著者名/発表者名
      Hatsuki Tanabe, Shinichiro Ozawa,Akihiro Kawamoto, Hideaki Tanaka, Yuichiro Takahashi Genji Kurisu
    • 学会等名
      日本生物物理学会
  • [学会発表] Structural study of RubisCO from diatom Thalassiosira pseudonana and its interaction with novel pyrenoid proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Taiki Fukuzawa, Rei Toda, Hermanus Nawely, Natumi Morishima, Ryosuke Okubo, Yoshinori Tsuji, Kawamoto Akihiro, Hideaki Tanaka, Christoph Gerle, Yusuke Matuda, Genji Kurisu
    • 学会等名
      日本生物物理学会
  • [備考] 大阪大学蛋白質研究所蛋白質結晶学研究室

    • URL

      http://www.protein.osaka-u.ac.jp/crystallography/

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公開日: 2023-12-25  

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