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2023 年度 実績報告書

多様な補因子によるp97の基質特異性制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21H02418
研究機関鳥取大学

研究代表者

佐藤 裕介  鳥取大学, 工学研究科, 准教授 (50568061)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワードユビキチン / タンパク質分解 / タンパク質複合体 / クライオ電子顕微鏡 / ATPase
研究実績の概要

p97は補因子と共にはたらき、主にユビキチン鎖で修飾された基質をアンフォールディングすることでプロテアソームによる分解へと導く。この機構は、異常タンパク質の除去にとどまらず、ERAD、オートファジー、膜融合、細胞死、DNA修復、免疫応答、細胞周期の制御など、多岐にわたる細胞内プロセスに関与している。p97の機能の多様性は、ユビキチン鎖の修飾様式の多様さに加え、p97が30種類異常にもおよぶ補因子と結合し、それぞれの補因子依存的に活性制御や局在制御、基質特異性などを獲得することに起因する。しかし、大半の補因子については、p97がどのようにこれらの制御を受けているのか、その分子機構は明らかになっていない。本研究では、多様な補因子によるp97の制御機構を解明することを目的に、生化学的解析およびクライオ電子顕微鏡単粒子解析を実施した。まず、網羅的なスクリーニングにより、p97の活性を顕著に亢進させる複数の補因子を同定し、それらに対して切り詰め実験を行うことで、各補因子におけるp97活性化ドメインを特定した。さらに、p97-補因子-基質からなる三者複合体の構造解析も試みたが、多くの粒子でp97と補因子の結合が解離しており、現段階では構造決定には至っていない。一方、AlphaFold3を用いた計算解析により、複数の補因子間に存在する相互作用を予測し、変異体を用いた解析によって、この相互作用がp97の活性化に不可欠であることを明らかにした。これらの知見は、補因子間相互作用の構造的基盤と機能的役割を理解する手がかりとなる。現在、本研究成果は論文化に向けて整理中であり、2025年度中の投稿を予定している。

現在までの達成度 (段落)

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2025 2024 2023

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Combinatorial ubiquitin code degrades deubiquitylation-protected substrates2025

    • 著者名/発表者名
      Morita Mai、Takao Miyu、Tokuhisa Honoka、Chiba Ryotaro、Tomomatsu Shota、Akizuki Yoshino、Tomita Takuya、Endo Akinori、Saeki Yasushi、Sato Yusuke、Ohtake Fumiaki
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 16 ページ: 2496

    • DOI

      10.1038/s41467-025-57873-9

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Chemical Diversification of Enzymatically Assembled Polyubiquitin Chains to Decipher the Ubiquitin Codes Programmed on the Branch Structure2024

    • 著者名/発表者名
      Furuhata Takafumi、Choi Bumkyu、Uno Taiki、Shinohara Ryota、Sato Yusuke、Okatsu Kei、Fukai Shuya、Okamoto Akimitsu
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: Online ahead of print ページ: OAP

    • DOI

      10.1021/jacs.4c11279

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A strategy for orthogonal deubiquitination using a bump-and-hole approach2023

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Takumi、Utsugi Yuki、Yamanaka Satoshi、Takahashi Hirotaka、Sato Yusuke、Sawasaki Tatsuya、Miyamae Yusaku
    • 雑誌名

      RSC Chemical Biology

      巻: 4 ページ: 879~883

    • DOI

      10.1039/d3cb00095h

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Toward elucidation of the mechanism of enhancement of VCP unfoldase activity by Ubx52024

    • 著者名/発表者名
      落合 陸斗
    • 学会等名
      第97回日本生化学会大会
  • [学会発表] Analysis of the VCP activation mechanism by the long helix domain of FAF12024

    • 著者名/発表者名
      宮内 駿希
    • 学会等名
      第97回日本生化学会大会
  • [学会発表] FAF1 およびUBXD7 のp97 活性化ドメインの同定2023

    • 著者名/発表者名
      佐藤 裕介
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会年会
  • [学会発表] Introduction of how to use AlphaFold22023

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕介
    • 学会等名
      2024 International Joint Meeting of the 23rd International Conference on Cytochrome P450 and the 38th Annual Meeting of the Japanese Society for the Study of Xenobiotics
    • 国際学会

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公開日: 2025-12-26  

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