| 研究実績の概要 |
植物の環境適応能力は表現型の可塑性と遺伝的な変化（進化）によって担保されているが、一体どのような遺伝的な変化が環境適応を推進するのかという問いに明確な回答は出されていない。本研究では、自然集団中に多型がみられるシロイヌナズナの新規RNAメチルトランスフェラーゼFIONA1に注目し、 (1)分子メカニズム、(2) 環境適応における機能性の解明を目指して研究を実施した。
FIONA1は哺乳類におけるRNAアデノシンメチル化酵素であるMETTL16のホモログであり、2022年以降、FIONA1の主要な機能性に関する複数の論文が立て続けに報告されてきたが、(1) スプライスソームユニットU6 snRNAメチル化修飾を介したスプライシング制御 (Parker et al. eLife, 2022)、(2) メッセンジャーRNAの修飾を介したRNA代謝の調節機能 (Wang et al. Genome Biol, 2022; Sun et al., PLoS Genet, 2022, Xu et al., 2022, Adv. Science) のいずれが主要機能であるかという点に関して研究グループ間で見解が分かれる。私たちは既報の公開データおよびRNAメチル化変異体に加え、取得済みのFIONA1欠損変異体のRNAシークエンスデータを用いてデータ解析パイプラインの評価を行い、スプライシングパターン、RNAメチル化修飾領域ともに、解析パイプライン依存的な大きなバイアスが存在し、各論文の結論に影響を及ぼしていることを明らかにした。また、メタ解析とモチーフ解析を用いて、FIONA1がスプライスソームユニットU6 snRNAメチル化を通じてスプライシング調節に寄与している事を検証し、これらの結果とスプライシング解析における技術的な留意点などを喚起する論文を投稿した（査読中）。
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