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本研究では原位置培養法などによって得られた希少菌株のゲノム配列を解析し、生合成遺伝子クラスターの情報をもとに選別した菌株について、生物活性とLC-MSプロファイルの双方を指標に新規天然物の探索を進めた。その結果、北海道大学キャンパス土壌より分離したVariovorax属の菌株より複数のペプチド関連化合物を見出した。さらに、Acidobacteria門の菌株のゲノム情報からカリクリン生合成遺伝子を見出し、海綿以外の生物から初めてカリクリン類を単離した。さらに新たな休眠遺伝子の活性化方法として、バクテリアが産生する細胞外膜小胞（MVs）を用いた休眠遺伝子活性化方法を開発した。
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