| 研究課題/領域番号 |
21H02796
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| 研究機関 | 国立研究開発法人国立がん研究センター |
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研究代表者 |
荻原 秀明 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (40568953)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| キーワード | 合成致死性 / 標的探索 / がん治療 / 分子標的薬 / 阻害薬 / クロマチン制御因子 |
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| 研究実績の概要 |
本研究では、クロマチン制御因子のパラログ因子群の同時抑制による治療標的探索法を確立し、クロマチン制御因子欠損がんに選択的に致死性を示す治療標的を同定することを目的としている。2021年度は、クロマチン制御遺伝子のパラログペアを同時に抑制するsiRNAライブラリーを構築し、いくつかの合成致死標的となるパラログペの候補を抽出した。
2022年度は、それらの中でSMARCB1欠損型細胞株モデルでの検討を行った。SMARCB1欠損型細胞株（ーSMARCB1細胞株）において、SMARCB1のcDNAを導入したレスキュー細胞株（+SMARCB1細胞株）を構築した。すなわち、これらの細胞株は、同じ細胞株バックグラウンドにおいて、SMARCB1があるか（+SMARCB1細胞株）、ないか（ーSMARCB1細胞株）の違いのみであるアイソジェニック細胞株モデルである。このSAMRCB1のアイソジェニック細胞株モデルを用いて、パラログペアsiRNAライブラリーによって、パラログペアを同時抑制したときに＋SMARCB1細胞株では生存し、－SMARCB1細胞株では致死性を示す、すなわち合成致死性を示すパラログペアを探索した。その結果、7ペアのパラログペアを抽出した。その中で1ペアは既存の標的候補であったため、スクリーニング自体の信頼性も担保されていると考えられた。そこで、残りの6ペアについて、別のバックグラウンドのSMARCB1正常型細胞株とSMARCB1欠損型細胞株で再検証を行った結果、1ペアのパラログペアX1/X2を絞り込んだ。さらにX1/X2の合成致死標的パラログペアの有望性を検証するために、SMARCB1正常型6細胞株とSMARCB1欠損型細胞株6細胞株の細胞株モデルで再検証した結果、SMARCB1欠損型細胞株群で選択的に致死性、すなわち合成致死性を示すことを明らかにした。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
これまでに、パラログペアを選定し、それらの同時抑制siRNAライブラリーを構築するとともに、SMARCB1欠損がんモデルを構築することで、SMARCB1欠損がんに有望なパラログペア合成致死標的を同定することができているため。
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| 今後の研究の推進方策 |
１．パラログペアX1/X2について、パラログペアの同時抑制と片方だけの単独抑制によるSMARCB1欠損型細胞株への合成致死性を検討する。
２．パラログペアX1/X2の既存阻害剤の薬剤感受性試験により、SMARCB1欠損型細胞株への選択性を検討する。
３．遺伝子発現解析やCUT＆RUN-seqやATAC-seqによるクロマチン構造解析などの網羅的解析を統合的に解析することによって、SMARCB1欠損型細胞株におけるパラログペアX1/X2同時抑制による合成致死性のメカニズムを解明する。
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