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2021 年度 実績報告書

張力ホメオスタシスを説明する細胞内分子挙動の測定と熱力学的記述

研究課題

研究課題/領域番号 21H03796
研究機関大阪大学

研究代表者

出口 真次  大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 教授 (30379713)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワード張力ホメオスタシス / バイオメカニクス / メカノバイオロジー / 熱力学 / FRAP
研究実績の概要

増殖が可能な細胞には張力ホメオスタシスと呼ばれる、細胞内部の物理的な張力を一定に維持する性質が備わっている。これは細胞が周囲環境の変化に対して適応的に振る舞うための基盤となっており、その能力の不全は様々な疾患との関連をもつことが指摘されている。張力ホメオスタシスのメカニズムの解明のために、本年度は従来困難であった細胞内タンパク質の複数の挙動(純拡散・化学結合・移流・機械的変形)の区別を行うことができる測定法を開発した。具体的にはFRAP法(fluorescence recovery after photobleaching)のデータに対して、様々な物理化学的現象を考慮した解析モデルを構築・適用し、上記の複数挙動のそれぞれの性質を抽出した。張力ホメオスタシスを実現する条件を阻害する薬剤投与実験を行い、この改良FRAP法(連続体力学をもとに記述していることから、Continuum mechanics-based FRAP, CM-FRAP法と名付けた)をもとにそのときの細胞の状態変化について定量化を行った。さらに、張力ホメオスタシスの分子・物理機構に手がかりを得るための数値解析を行った。また、実験結果の一部に対して熱統計力学に基づく解析を行い、現象の背後にある細胞の性質について数理的な記述のもと解釈することができた。具体的には、細胞が張力ホメオスタシスを満たす条件を数式で表現し、構成要素であるactin filamentにどのような長さ分布をもつことが求められるかを理論的(統計力学および熱力学)に導き、それが実験結果と一致することを示した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

成果をまとめて論文投稿を行うこともできた。

今後の研究の推進方策

上記の数理モデルには精度の観点から改良点が含まれていることも明らかとなった。そこで今後はモデルの改良に取り組みつつ、並行して様々な条件で実験を行い、両者の比較から細胞の性質を解釈・抽出することに取り組む。また、熱統計力学で扱う対象を広げてより普遍性の高いモデルを構築して解析を進める。

  • 研究成果

    (15件)

すべて 2021 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 6件、 招待講演 10件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Mechanosensitive myosin II but not cofilin primarily contributes to cyclic cell stretch-induced selective disassembly of actin stress fibers2021

    • 著者名/発表者名
      Huang, W., Matsui, T.S., Saito, T., Kuragano, M., Takahashi, M., Kawahara, T., Sato, M., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      American Journal of Physiology Cell Physiology

      巻: 320 ページ: C1153-C1163

    • DOI

      10.1152/ajpcell.00225.2020

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Determining the domain-level reaction-diffusion properties of an actin-binding protein transgelin-2 within cells2021

    • 著者名/発表者名
      Saito, T., Matsunaga, D., Matsui, T.S., Noi, K., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      Experimental Cell Research

      巻: 404 ページ: 112619

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2021.112619

    • 査読あり
  • [雑誌論文] ARHGAP4-SEPT2-SEPT9 complex enables both up- and down-modulation of integrin-mediated focal adhesions, cell migration, and invasion2021

    • 著者名/発表者名
      Kang, N., Matsui, T.S., Liu, S., Deguchi, S.
    • 雑誌名

      Molecular Biology of the Cell

      巻: 32 ページ: ar28, 1-12

    • DOI

      10.1091/mbc.E21-01-0010

    • 査読あり
  • [学会発表] Does durotaxis direct NE cell migration in developing lung?2021

    • 著者名/発表者名
      Kana Furukawa, Shinji Deguchi
    • 学会等名
      The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞による力学環境への適応のメカニズム2021

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      MMDS・AIMap研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] Machine learning-based detection of cellular forces and its application to drug screening2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      International Conference on Future Healthcare and Economic Development
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] シグナル伝達, 数理モデルに基づく細胞計測2021

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      生物物理学会サブグループ・メカノバイオロジー研究会
  • [学会発表] バイオメカニクスの最前線ー細胞の恒常性を理解するー2021

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      次世代医療システム産業化フォーラム
    • 招待講演
  • [学会発表] Cellular adaptation to mechanical environment2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      MEI-Center Summer School 2021
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ストレスファイバーの熱力学2021

    • 著者名/発表者名
      出口 真次, 上田 唯花, 松井 翼, 松永 大樹
    • 学会等名
      第33回バイオエンジニアリング講演会
    • 招待講演
  • [学会発表] Wrinkle force microscopy: a machine learning-based approach to evaluate cellular forces2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      DevMech Webinar
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞の力のホメオスタシス、細胞の力のアッセイ2021

    • 著者名/発表者名
      出口真次
    • 学会等名
      京大ウイルス再生研生体材料学分野・セミナー
    • 招待講演
  • [学会発表] Machine learning-based cellular force evaluation2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      From Research to Innovation” Symposium on the 15th Anniversary of Osaka University and University of Strasbourg
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Machine learning-based detection of cellular traction forces2021

    • 著者名/発表者名
      Shinji Deguchi
    • 学会等名
      LINK-J & UC San Diego Joint Webinar Series #4 with Osaka University
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 大阪大学大学院基礎工学研究科・出口研究室

    • URL

      http://mbm.me.es.osaka-u.ac.jp

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公開日: 2023-12-25  

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