次世代シーケンサーを用いた肺小細胞癌の薬剤耐性化制御機構の解明

2021 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 21H04241
• 研究機関: 熊本大学
• 研究代表者: 工藤 信次 熊本大学, 技術部, 技術専門職員
• 研究期間 (年度): 2021-04-01 – 2022-03-31
• キーワード: 肺小細胞癌 / 薬剤耐性獲得機構 / RNA-Seq

研究実績の概要

肺小細胞癌は肺癌の約10～15％を占める高悪性度の神経内分泌癌で、抗癌剤治療後の薬剤耐性が問題となっているが、未だその薬剤耐性獲得機構に対する知見は乏しい。本研究の目的は、薬剤耐性獲得機構の解明を目指すことである。そこで、肺小細胞癌の抗癌剤耐性細胞を作製し、次世代シーケンサーを用いて薬剤耐性分子の同定を試みた。
研究材料は、抗癌剤エトポシドを作用させて樹立したエトポシド耐性細胞株(SBC1-ER)とその薬剤感受性細胞株(SBC1)を用いた。また、異なる抗癌剤のドキソルビシン耐性肺小細胞癌細胞株(H69AR)とその薬剤感受性細胞株(H69)も併用した。研究方法は、(1)SBC1ER、SBC1、H69AR、H69細胞からRNAを抽出し、次世代シーケンサーを使用して網羅的に遺伝子発現解析した（RNA-Seq）。(2)SBC1ERとSBC1細胞、H69ARとH69細胞のそれぞれ両群間で有意差（p<0.05）のある共通の遺伝子を抽出し、遺伝子オントロジー(GO) 解析を実施した。
研究成果は、(1)SBC1ERとSBC1細胞で5244、H69ARとH69細胞で10028の発現変動遺伝子を同定した。(2)両群共通の遺伝子は334存在した。薬剤耐性に関与する遺伝子探索のため、334遺伝子をGO解析した結果、ATP-binding cassette(ABC)トランスポーター001とsolute carrier (SLC)トランスポーター277の候補遺伝子を選別した。この候補遺伝子001と277は、ヒト肺小細胞癌腫瘍のRNA-Seq、Microarrayのパブリックデータセット(GSE60052・GSE62021)を用いた解析でも同様に発現亢進していた。
本研究により、肺小細胞癌における薬剤耐性獲得機構の一つとして、トランスポーターを介した制御機構が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] The role of YAP1 in small cell lung cancer (2022)
  • 著者名/発表者名: Haruki Saito, Yuki Tenjin, Tatsuya Yamada, Shinji Kudoh, Noritaka Kudo, Mune Sanada, Younosuke Sato, Akira Matsuo, Yorihisa Orita & Takaaki Ito
  • 雑誌名: Human Cell 巻: 35 ページ: 628-638
  • DOI: 10.1007/s13577-022-00669-6.
  • 査読あり