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2021 年度 実績報告書

標的誘導型合成による革新的医薬品候補化合物の創製

研究課題

研究課題/領域番号 21H04795
研究機関大阪大学

研究代表者

鈴木 孝禎  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (90372838)

研究分担者 山下 泰信  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (10873408)
伊藤 幸裕  大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (30636402)
高田 悠里  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (20902357)
研究期間 (年度) 2021-04-05 – 2024-03-31
キーワード標的誘導型合成 / 医薬品 / 阻害薬 / in situクリックケミストリー / 創薬
研究実績の概要

本研究では、標的タンパク質自身に阻害薬を合成させる手法である「標的誘導型合成」により、より簡便かつ迅速に、医薬品候補化合物を見出すことを目的とする。具体的には、①標的酵素の触媒メカニズムに基づいた阻害薬の創製、②invitro in situクリックケミストリー、③in cell in situクリックケミストリー、を実行している。
①標的酵素の触媒メカニズムに基づいた阻害薬の創製:酵素触媒反応を利用した標的誘導型合成では、基質を模倣した化合物が酵素活性中心で触媒反応を施され、補酵素との共有結合形成や標的酵素自身の修飾を導き、酵素を阻害する。本研究では、触媒反応に基づいたリシン脱メチル化酵素阻害薬を創製する。令和2年度は、触媒反応に基づいたリシン脱メチル化酵素阻害薬を設計、合成し、酵素阻害活性評価を行った結果、新規リシン脱メチル化酵素阻害薬を見出した。
②in vitro in situクリックケミストリー:本研究では、金属含有酵素阻害薬創製のための標的誘導型合成を用いてリシン脱メチル化酵素阻害薬の探索を行っている。令和2年度は、本手法で用いる、アジドフラグメントおよびアルキンフラグメントを設計、合成し、酵素を用いた予備試験を行うことで、in vitro in situクリックケミストリースクリーニングの準備が完了した。
③in cell in situクリックケミストリー:本研究では、生体直交型かつ高収率で反応が進行するテトラジン-アルケン間の逆電子要請型Diels-Alder反応を利用して、in cell in situクリックケミストリーを行っている。令和2年度は、本手法で用いる、テトラジンフラグメントおよびアルケンフラグメントを設計、合成し、in cell in situクリックケミストリーの準備が完了した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

予定通りに分子設計、合成、活性評価を行うことができたため。

今後の研究の推進方策

①標的酵素の触媒メカニズムに基づいた阻害薬の創製
酵素触媒反応を利用した標的誘導型合成では、基質を模倣した化合物が酵素活性中心で触媒反応を施され、補酵素との共有結合形成や標的酵素自身の修飾を導き、酵素を阻害する。本研究では、触媒反応に基づいたリシンメチル化酵素阻害薬を創製する。今後は、令和2年度に得られた阻害薬を基にした設計、合成し、酵素阻害活性評価および酵素阻害メカニズム解析を行う。
②in vitro in situクリックケミストリー
当研究室は、活性中心に在る金属イオンにより活性化されるアジド-アルキン環化付加反応を開発し、金属含有酵素を標的としたin situクリックケミストリーに本反応が適用可能であることを示した。本研究では、金属含有酵素阻害薬創製のための標的誘導型合成を用いてリシン脱メチル化酵素阻害薬の探索を行う。今後は、令和2年度に合成したアジドフラグメントおよびアルキンフラグメントをもちいて、in vitro in situクリックケミストリースクリーニングを行う。
③in cell in situクリックケミストリー
in situクリックケミストリーにおけるアジド-アルキン環化付加反応の収率は、極めて低いため、細胞活性評価によるスクリーニングは困難である。そこで、本研究では、生体直交型かつ高収率で反応が進行するテトラジン-アルケン間の逆電子要請型Diels-Alder反応を利用する。今後は、令和2年度度に合成したテトラジンフラグメントおよびアルケンフラグメントを用いて、細胞ベースのスクリーニングを行う。

  • 研究成果

    (19件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 3件、 査読あり 9件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件、 招待講演 6件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Selective degradation of histone deacetylase 8 mediated by a proteolysis targeting chimera (PROTAC)2022

    • 著者名/発表者名
      Chotitumnavee Jiranan、Yamashita Yasunobu、Takahashi Yukari、Takada Yuri、Iida Tetsuya、Oba Makoto、Itoh Yukihiro、Suzuki Takayoshi
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 58 ページ: 4635~4638

    • DOI

      10.1039/d2cc00272h

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel histone modifications in microglia derived from a mouse model of chronic pain2022

    • 著者名/発表者名
      Zhang Ping、Guergues Jennifer、Alleyne Amy R.、Cirino Thomas J.、Nadeau Owen、Figueroa Ariana M.、Stacy Heather M.、Suzuki Takayoshi、McLaughlin Jay P.、Stevens Stanley M.、Liu Bin
    • 雑誌名

      PROTEOMICS

      巻: - ページ: 2100137~2100137

    • DOI

      10.1002/pmic.202100137

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Using α- and β-Epimerizations of cis-2,3-Bis(hydroxymethyl)-γ-butyrolactone for the Synthesis of Both Enantiomers of Enterolactone2022

    • 著者名/発表者名
      Jiang Rui、Ismiyarto、Abe Tsukasa、Zhou Da-Yang、Asano Kaori、Suzuki Takayoshi、Sasai Hiroaki、Suzuki Takeyuki
    • 雑誌名

      The Journal of Organic Chemistry

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1021/acs.joc.1c02801

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recent progress on small molecules targeting epigenetic complexes2022

    • 著者名/発表者名
      Itoh Yukihiro、Takada Yuri、Yamashita Yasunobu、Suzuki Takayoshi
    • 雑誌名

      Current Opinion in Chemical Biology

      巻: 67 ページ: 102130~102130

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2022.102130

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of Potent and Selective Inhibitors of Fat Mass Obesity-Associated Protein Using a Fragment-Merging Approach2021

    • 著者名/発表者名
      Prakash Muthuraj、Itoh Yukihiro、Fujiwara Yoshie、Takahashi Yukari、Takada Yuri、Mellini Paolo、Elboray Elghareeb E.、Terao Mitsuhiro、Yamashita Yasunobu、Yamamoto Chika、Yamaguchi Takao、Kotoku Masayuki、Kitao Yuki、Singh Ritesh、Roy Rohini、Obika Satoshi、Oba Makoto、Wang Dan Ohtan、Suzuki Takayoshi
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 64 ページ: 15810~15824

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.1c01107

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification of Novel Histone Deacetylase 6‐Selective Inhibitors Bearing 3,3,3‐Trifluorolactic Amide (TFLAM) Motif as a Zinc Binding Group2021

    • 著者名/発表者名
      Kurohara Takashi、Tanaka Keita、Takahashi Daisuke、Ueda Satoshi、Yamashita Yasunobu、Takada Yuri、Takeshima Hirokazu、Yu Shengwang、Itoh Yukihiro、Hase Koji、Suzuki Takayoshi
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 22 ページ: 3158~3163

    • DOI

      10.1002/cbic.202100255

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ca2+‐activated K+ channel KCa1.1 as a therapeutic target to overcome chemoresistance in three‐dimensional sarcoma spheroid models2021

    • 著者名/発表者名
      Ohya Susumu、Kajikuri Junko、Endo Kyoko、Kito Hiroaki、Elboray Elghareeb E.、Suzuki Takayoshi
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 112 ページ: 3769~3783

    • DOI

      10.1111/cas.15046

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Synthetic RNA Modulators in Drug Discovery2021

    • 著者名/発表者名
      Zamani Farzad、Suzuki Takayoshi
    • 雑誌名

      Journal of Medicinal Chemistry

      巻: 64 ページ: 7110~7155

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.1c00154

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Discovery of novel tetrahydrobenzo[b]thiophene-3-carbonitriles as histone deacetylase inhibitors2021

    • 著者名/発表者名
      Gediya Piyush、Vyas Vivek K.、Carafa Vincenzo、Sitwala Nikum、Della Torre Laura、Poziello Angelita、Kurohara Takashi、Suzuki Takayoshi、Sanna Vinod、Raguraman Varalakshmi、Suthindhiran K.、Ghosh Debarpan、Bhatia Dhiraj、Altucci Lucia、Ghate Manjunath D.
    • 雑誌名

      Bioorganic Chemistry

      巻: 110 ページ: 104801~104801

    • DOI

      10.1016/j.bioorg.2021.104801

    • 査読あり
  • [学会発表] Discovery of epigenetic enzyme inhibitors by target-guided synthesis2022

    • 著者名/発表者名
      Takayoshi Suzuki
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA創薬を志向した金属錯体型RNA分解分子の開発2022

    • 著者名/発表者名
      花谷 優太朗、黒原 崇、山下 泰信、高田 悠里、伊藤 幸裕、鈴木 孝禎
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 招待講演
  • [学会発表] エピジェネティクスを標的とした創薬化学研究2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木 孝禎
    • 学会等名
      千里ライフサイエンス振興財団 新適塾「未来創薬への誘い」第53回会合
    • 招待講演
  • [学会発表] 中枢神経性疾患治療を目指したエピジェネティクス制御化合物の創製2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木 孝禎
    • 学会等名
      第64回日本神経化学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒストン修飾を制御する小分子化合物の探索2021

    • 著者名/発表者名
      鈴木 孝禎
    • 学会等名
      第94回 日本生化学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] Identification of lysine demethylase inhibitors as candidate therapeutic agents2021

    • 著者名/発表者名
      Takayoshi Suzuki
    • 学会等名
      Pacifichem 2021
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Induced-fit 型 HDAC 酵素阻害薬の同定とそのアロステリック作用の解析2021

    • 著者名/発表者名
      伊藤幸裕、展鵬、東條敏史、鈴木美紀、李頴、内田周作、鈴木孝禎
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第15回年会
  • [学会発表] エピジェネティクス関連酵素に対する分解誘導薬の創製2021

    • 著者名/発表者名
      伊藤幸裕、飯田哲也、Chotitumnavee Jiranan、高橋 ゆかり、山下泰信、黒原崇、三宅由花、大庭誠、鈴木孝禎
    • 学会等名
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
  • [図書] 遺伝学の百科事典2022

    • 著者名/発表者名
      日本遺伝学会
    • 総ページ数
      690
    • 出版者
      丸善出版
    • ISBN
      9784621306604
  • [備考] 大阪大学産業科学研究所複合分子化学研究分野ホームページ

    • URL

      https://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/cmc/

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公開日: 2022-12-28  

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