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2021 年度 実績報告書

スピロプラズマが持つ新奇な"らせん反転"分子モーターの解明

研究課題

研究課題/領域番号 21J15218
研究機関大阪市立大学

研究代表者

笹嶋 雄也  大阪市立大学, 大学院理学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2021-04-28 – 2023-03-31
キーワードクライオ電子顕微鏡法 / 細胞骨格 / ヌクレオシダーゼ / スピロプラズマ
研究実績の概要

スピロプラズマはリボンと呼ばれる独自の細胞骨格を持つ。このリボンはフィブリルという、細菌ヌクレオシダーゼから進化したスピロプラズマ特異的な細胞骨格タンパク質から構成される。私たちはこれまでにS. eriocheirisから単離したフィブリルフィラメントの単粒子クライオ電子顕微鏡法により、フィブリルの新規原子構造を決定した。本研究では、新たに電子線クライオトモグラフィを用いてリボンを可視化し、その成り立ちをフィブリル原子構造をもとに議論する。
氷の中に閉じ込めたスピロプラズマ細胞の傾斜撮影像からトモグラムを再構成したところ、細胞らせんを裏打ちするリボンを可視化することに成功した。次にリボンを構成するプロトフィラメントの詳細な三次元構造を可視化するために、リボンを3本のプロトフィラメントを含む大きさの四角い箱で区切って、箱の中の密度を平均化するサブトモグラム平均を行った。得られた三次元構造は、連なったリング状密度をシリンダー状密度が架橋するような繊維構造をしており、リングを重ねるように3本のプロトフィラメントが並んでいた。これらの特徴は、フィブリルフィラメントを作るサブユニット間の、N末端ドメイン同士が相互作用するシリンダー部分、C末端ドメイン同士が相互作用するリング部分にそれぞれよく対応していた。また、リング表裏の分子表面は電荷が偏り、表側は正電荷を、裏側は負電荷を帯びていた。このことから、複数本のフィブリルフィラメントは、正電荷を帯びた側面が、負電荷を帯びた片側の側面に引き寄せられて、互いに電荷を打ち消すように繊維の向きを揃えて配向し、リボンを形成する可能性が考えられる。
これらの成果は、バクテリア細胞骨格の新規構造および進化的起源の一例を示し、関係する研究分野において新たな知見を与え、その研究分野の発展に寄与する。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

これまでの研究成果をまとめた1編の原著論文をプレプリントリポジトリであるbiorxivに発表し、学会誌へ投稿した。そこで、2度の投稿により得た査読結果をもとに追加実験および論文内容の論理展開を再考し、本研究を完成させるべく取り組んだ。また、本研究により得られた知見を含む、スピロプラズマ遊泳運動の進化的起源についての1編の英文総説をFrontiers in microbiologyにて発表した。

今後の研究の推進方策

2021年度にプレプリントリポジトリであるbiorxivに発表した1編の原著論文について、該当年度中に学会誌に投稿したときに得た査読結果をもとに、論文内容の完成度を上げ、適当な学会誌に発表する。また現在進行中の研究内容を新たに1篇の原著論文としてまとめ、学会誌にて発表し研究を完成する。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Prospects for the mechanism of Spiroplasma swimming2021

    • 著者名/発表者名
      Sasajima Y and Miyata M
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.706426

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Elucidation of fibril helix structure responsible for swimming in Spiroplasma using electron microscopy2021

    • 著者名/発表者名
      Sasajima Y, Kato K, Miyata T, Namba K and Miyata M
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1101/2021.02.24.432793

  • [学会発表] スピロプラズマのらせん反転運動機構2021

    • 著者名/発表者名
      笹嶋 雄也,加藤 貴之,宮田 知子,難波 啓一,宮田 真人
    • 学会等名
      日本マイコプラズマ学会第48回学術集会
  • [学会発表] クライオ EMで明らかにしたスピロプラズマ遊泳に関与するらせん状細胞骨格フィブリルの構造2021

    • 著者名/発表者名
      笹嶋 雄也,加藤 貴之,宮田 知子,難波 啓一,宮田 真人
    • 学会等名
      第94回日本細菌学会総会
  • [学会発表] Mechanism of Spiroplasma swimming suggested by CryoEM structure of fibril2021

    • 著者名/発表者名
      Yuya Sasajima, Takayuki Kato, Tomoko Miyata, Keiichi Namba, Makoto Miyata
    • 学会等名
      XXIII Biennial Congress of the International Organization for Mycoplasmology - IOM
    • 国際学会
  • [学会発表] Mechanism of Spiroplasma swimming suggested by Cryo-EM structure of the fibril2021

    • 著者名/発表者名
      Yuya Sasajima, Takayuki Kato, Tomoko Miyata, Keiichi Namba, Makoto Miyata
    • 学会等名
      BLAST XVI
    • 国際学会

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公開日: 2022-12-28  

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