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2023 年度 研究成果報告書

エンハンサによる転写凝集体の形成と転写制御の物理

研究課題

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研究課題/領域番号 21K03479
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
研究機関北海道大学

研究代表者

山本 哲也  北海道大学, 化学反応創成研究拠点, 特任准教授 (40610027)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワードヘテロクロマチン / リピート配列 / RNA干渉経路 / 転写 / 高分子の表面吸着
研究成果の概要

分裂酵母の構成的ヘテロクロマチンは、RNA干渉経路によって形成される。最近の実験によって、リピートされた遺伝子がヘテロクロマチン化される傾向があることが示された。本研究では、リピートされた遺伝子がDNA上で「つながっている」ことに注目し、高分子の表面吸着のエッセンスをRNA干渉経路の速度方程式に組み込むことによって、分裂酵母のヘテロクロマチン形成機構を明らかにするための理論を構築した。本研究によって、リピートの数だけでなく、各遺伝子の長さもヘテロクロマチン形成に重要な因子であることを明らかにした。本研究は、ヘテロクロマチンの形成機構とリピート配列の生物物理学意義を発見した点で重要である。

自由記述の分野

遺伝子制御の物理

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究成果は、①リピート配列の生物物理学的意義と②相分離以外のヘテロクロマチン形成機構を明らかにした点で重要である。RNA干渉経路のようなシステム生物学的アプローチが適当な系に、遺伝子の連結性という構造的要素を加えて融合した点も新しい。本研究成果は、pRNA経路などの小分子RNAの生成によってヘテロクロマチンが形成される系だけでなく、リボソームDNA、ヒストン遺伝子、スーパーエンハンサなどのリピート配列(または、同じ機能配列が連結した領域)と核内構造体との相互作用を明らかにする研究に拡張することができる。

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公開日: 2025-01-30  

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