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2021 年度 実施状況報告書

水田土壌の生物的鉄酸化反応ー微好気性鉄酸化細菌の潜在的役割の評価

研究課題

研究課題/領域番号 21K05326
研究機関名古屋大学

研究代表者

渡邉 健史  名古屋大学, 生命農学研究科, 講師 (60547016)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワード鉄酸化細菌 / 水田
研究実績の概要

本研究では、Gallionellaceae科微好気性鉄酸化細菌(以下、微好気性鉄酸化細菌)の分離菌株を用いた培養実験による鉄酸化活性の評価と、室内での土壌培養実験による微好気性鉄酸化細菌の動態の解析から、水田土壌での微好気性鉄酸化細菌の鉄酸化ポテンシャルを推定することを試みる。本年度は、室内での土壌培養実験の条件を検討した。
先端を閉じた10mL容のガラスシリンジに、風乾した水田土壌(粉末状にした稲わら、またはグルコースを添加)を詰め、30℃で湛水培養して土壌中の鉄を還元させた。その後、先端を開放し落水して鉄を酸化させた。経時的に土壌を採取し、土壌中の活性2価鉄量と微好気性鉄酸化細菌の16S rRNA遺伝子コピー数を定量した。
その結果、落水直後の活性2価鉄量は大きく変化しなかったが、約一週間後より、急激に減少した。微好気性鉄酸化細菌の16S rRNA遺伝子コピー数は、落水後すぐに増加し始めたが、2価鉄量が急激に減少した段階での増加は緩やかであった。以上より、本培養実験により、落水時の微好気性鉄酸化細菌の動態を追跡することが可能であると考えられた。ただし、落水時の2価鉄量の変化のバラツキが大きかったため、今後は、落水前に土壌を混合して均一化するなどの処理が必要と考えられた。
また、当初の計画では、水田土壌から分離した菌株の鉄酸化活性を評価し、その値を用いてポテンシャルを推定する予定であった。しかし、使用した菌体量が少なく、分離菌株の鉄酸化活性を評価することができなかったため、今後、十分な菌体量を得て、鉄酸化活性を評価する必要があると考えられた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

当初は、分離菌株の鉄酸化活性も評価する予定であったが、培養液中の2価鉄濃度を測定方法の検討に時間がかかった。また、十分な菌体量を得ることができず、鉄酸化細菌接種培養液と非接種培養液の間の鉄酸化活性に顕著な違いを見ることができなかった。今後、十分な菌体量を得て、さらに検討する必要がある。

今後の研究の推進方策

分離菌株の鉄酸化活性については、十分な菌体量を得て実験を行う。
土壌の室内培養実験については、湛水培養中に発生した気泡が、落水時の水の落ち方に影響している可能性があるため、落水時の条件が均一になるように工夫する必要がある。その点について改善した後、温度が鉄酸化ポテンシャルに及ぼす影響や、異なる土壌間での比較などを行うことを検討している。

次年度使用額が生じた理由

分離菌株の鉄酸化活性を評価する予定であったが、実験が計画通りに進まなかったため、次年度使用額が生じた。繰越分は、次年度に予定している分離菌株の鉄酸化活性の評価の実験のために用いる。

  • 研究成果

    (1件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Ferrigenium kumadai An22, a Microaerophilic Iron-Oxidizing Bacterium Isolated from a Paddy Field Soil2021

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Takeshi、Khalifa Ashraf、Asakawa Susumu
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 10 ページ: e00346-21

    • DOI

      10.1128/MRA.00346-21

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

URL: 

公開日: 2022-12-28  

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