| 研究課題/領域番号 |
21K05632
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| 研究機関 | 広島修道大学 |
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研究代表者 |
岡西 政典 広島修道大学, 人間環境学部, 助教 (70639278)
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| 研究分担者 |
藤田 敏彦 独立行政法人国立科学博物館, 動物研究部, 部長 (70222263)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| キーワード | 海産無脊椎動物 / 分類 / 博物館標本 / 棘皮動物 / 海洋保全 / 分子系統解析 / 次世代シーケンサー / MIG-seq |
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| 研究実績の概要 |
本研究では、インド―西太平洋海域に生息する小型の海産無脊椎動物である，ニシキクモヒトデ（Ophiothela danae）について，50年前より国立科学博物館（科博）に保管されている日本産の過去の標本と新規採集標本のDNA配列の比較を行うことを目的とした．2022年度は解析を本格化し、2010年代以降に和歌山、神奈川、鹿児島、高知、熊本、沖縄、静岡、三重、長崎、パラオ、タイ、ミャンマーから得られた計156個体の標本より、DNA解析用の腕の断片を収集した。これらは東南アジアを含む日本沿岸を網羅的にカバーし、各地点で5個体以上を含むサンプリングとなるようにつとめ、これらについて、DNAの抽出、濃縮、断片度の測定、並びに次世代シーケンサーによるMI g-seq解析を行った。その結果、全ての標本から目的配列が得られた。
これらの断片化を測定したところ、年代が古くなると断片化が進んでいる傾向が確認された。これは、海産無脊椎動物においては、初めての成果となる。同時に、この傾向に合わない標本も見られることから、海産無脊椎動物のDNA解析用の標本の作成のためには、標本液に漬けている時間ではなく、採集から標本化までの時間が重要であることを示していると考えられた。
また、これらの配列の解析結果から、東南アジア地域において、北東ほど遺伝的多様性が高いという結果が得られた。このことから、ニシキクモヒトデの分布の中心は温帯域であるという結果が得られた。この成果も海産無脊椎動物では前例がほとんどなく、かつ、他の生物における先行研究とは異なる貴重なものである。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
2022年度に実施予定であった、日本沿岸のサンプルの網羅的な解析に、東南アジアの標本を加えることができた。これにより、当初予定していた日本沿岸域だけでなく、広い海域での海洋生物の遺伝情報の変化を検討することができた。一方でCOI配列の解析は行っていないため、今後はこれらも合わせた解析を行う必要がある。2023年度はこの解析を終了させ、成果発表に努める予定である。
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| 今後の研究の推進方策 |
2023年度は、これまでに得られたデータの解析を進め、その断片化傾向と地域・時間ごとの配列の変化を発表する予定である。具体的には9月開催の日本動物学会、並びに3月開催の日本生態学会で発表を行うとともに、投稿論文を作成し、年度内の投稿・採択を目指す。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
実験の過程で注文試薬にディスカウントなどが生じ、10104円が余った。次年度は、DNA解析用費用にこれを宛て、予定よりも多くのサンプルで解析が行えるよう試みる。
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