研究課題/領域番号 |
21K05861
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研究機関 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 |
研究代表者 |
望月 遼太 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, 研究員 (90846065)
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研究分担者 |
鈴木 達郎 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, グループ長補佐 (00469842)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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キーワード | 温度応答 / 微気象 / RNA-seq / 遺伝子発現 |
研究実績の概要 |
寒冷地での栽培が主流な普通ソバを用いて、作物体の温度応答を調査した。初年度に作出した自殖性の高温耐性系統と感受性系統それぞれの生育調査および各器官(葉・花・蕾)別のサンプリングを実施した。RNA-seqにより、温度応答に関連する複数の遺伝子候補が見つかってきた。現在は、遺伝子候補群のプライマーを作成し、リアルタイムPCRにより温度応答遺伝子を同定していく予定である。 ソバ栽培における花芽器官と標準高度間での気温差異を観測した。水稲と比較してソバ群落内の気温は標準高度から大きな差はつかず、日中1度程度の差が生じる程度であった。このことからもソバの花芽器官は高温条件にさらされやすいことが明らかとなった。6月-8月の高温条件下での栽培試験の結果、高温耐性系統において次世代の発芽率が大幅に低下する傾向が見られた。本年度は圃場での栽培試験についても生育調査を細かく実施していく。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
昨年、実施できていなかった葉のサンプルからRNAを取得し、RNA-seqによる解析を実施中である。電気代高騰のあおりを受け、人工気象器を用いた栽培試験が一時的に中断していた。その影響もあり、昨年度はRNA-seqおよびリアルタイムPCR用のサンプルを十分に確保することが出来なかった。圃場試験でのサンプリング調査を前倒しで実施しているものの全体としては、遅延している。
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今後の研究の推進方策 |
RNA-seqサンプルの解析手法等の環境は、先行して実施していたサンプルを用いて構築済みであるので、結果を受領次第、リアルタイムPCRを用いた解析を進めていく予定である。当初計画に、組み込んでいた圃場試験を用いた遺伝子応答の追跡試験については次年度以降の検証・報告内容として実施する可能性も視野に作業を実施していく。
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次年度使用額が生じた理由 |
人工気象器を用いた栽培試験が一時的に中断していた影響を受け、RNA-seqを外注する分の費用が一部余剰資金としてプールされている。また当初想定より、RNA-seq費用が高騰していることから、旅費や消耗品費の一部をRNA-seqの委託費用に変更する予定である。
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