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2023 年度 実績報告書

カリウムチャネルKcsAの脂質内高分解能構造解析によるゲーティング機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K06030
研究機関大阪大学

研究代表者

高崎 寛子  大阪大学, 蛋白質研究所, 助教 (50610432)

研究分担者 清水 啓史  福井大学, 学術研究院医学系部門, 講師 (50324158)
安永 卓生  九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (60251394)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワードチャネルタンパク質 / クライオ電子顕微鏡 / 単粒子解析 / ナノディスク
研究実績の概要

本研究は、イオンチャネルのモデルタンパク質であるKcsAの構造解析を行い、多様に存在するイオンチャネル間の共通のゲーティング機構を明らかにすることを目的としている。そのために、ナノディスク技術を用いて、生体内と同じ脂質二重膜内に存在するKcsAを精製し、中性溶液中の閉構造、酸性溶液中の開構造をクライオ電子顕微鏡単粒子解析法を用いて明らかにする。
前年度、KcsAを含むナノディスク形成に成功したものの、大量精製にはいたらず、本格的な構造解析まで到っていない。ナノディスクでの大量精製の検討を行うとともに、ぺプチディスクを用いた精製の検討を始めた。ペプチディスクは、膜タンパク質を内在性脂質のみを利用して精製する方法であり、酸性条件での使用も期待できる。
その他、本年度は、マイクロ流路を用いたKcsAの動体解析において、中性条件から酸性条件、酸性条件から中性条件への溶液変換に成功し、溶液変換によるKcsAの動体変化を観測した。今後、さらにデータ取得を進め、現在考えているKcsAの閉構造から開構造への構造変化モデルを再検討する。また、MDシミュレーションを開始し、KcsAを脂質2重膜内に埋め込み、膜の内外のイオン濃度を変えながら、計算を行なった。現在、電子顕微鏡構造マップによる拘束条件を含め、計算の精密化を進めている。
KcsAのゲーティング機構を解明する準備は着実に整ってきている。生体内に近い状態でのKcsAの構造変化モデルの提唱のため、KcsAの高分解能構造取得を急ぎたい。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2023

すべて 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [学会発表] Microfluidic-Based Diffracted X-ray Tracking Method for Precise Recording of Ion Channel Motion in Response to Sequential Chemical Solution Changes2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Asagoe, Hirofumi Shimizu, Yoshikazu Hirai
    • 学会等名
      The 27th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • 国際学会
  • [学会発表] Microfluidic Device for Diffracted X-ray Tracking Method to Measure the Conformational Change of Ion Channel in Response to Chemical Stimuli2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Asagoe, Hirofumi Shimizu, Yoshikazu Hirai
    • 学会等名
      The 19th IEEE International Conference on Nano/Micro Engineered and Molecular Systems
    • 国際学会
  • [学会発表] pH変化に対するKcsAイオンチャネルの運動応答を解析するためのX線1分子動態計測用流体デバイス2023

    • 著者名/発表者名
      浅越雄介, 清水啓史, 平井義和
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会第47回研究会
  • [学会発表] 化学刺激によるイオンチャネル構造変化を解析する1分子動態計測技術2023

    • 著者名/発表者名
      琴屋健太郎, 山内一慶, 清水啓史, 平井義和
    • 学会等名
      第40回「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム

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公開日: 2024-12-25  

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