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2023 年度 実績報告書

非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 21K06053
研究機関京都産業大学

研究代表者

千葉 志信  京都産業大学, 生命科学部, 教授 (20523517)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワードYidC / タンパク質膜挿入
研究実績の概要

膜タンパク質を膜に組み込む膜組込装置には、孔(チャネル)を持つタイプと持たないタイプがある。チャネル型膜組込装置の分子機構の理解は比較的すすんでいるが、非チャネル型タンパク質膜組込装置の分子機構はその多くが不明である。本研究では、非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構と生理機能を理解するために、変異解析や阻害剤のスクリーニングを行うことを計画した。
2023年度は、昨年度に探索したYidCの阻害剤についての解析を進めるとともに、別の研究グループから報告された、別種YidCの活性を阻害するとされた物質について、枯草菌での効果を調べた。その結果、既知の阻害剤では、枯草菌YidCに対する強い阻害効果は観察されず、YidC阻害剤の種特異性が明らかになった。YidCの構造の柔軟性がこのような種特異性を生み出す原因である可能性が考えられる。
一方で、昨年度までに同定した枯草菌YidCの新規基質についての解析を、論文投稿していたが、そのリバイスなどを行い、出版まで到達した。
さらに、YidCの細胞質領域の変異解析を進めた。特に、塩基性残基の数や分布が基質の膜挿入にどのような影響を与えるのかについて解析を行った。その結果、細胞質領域の塩基性の一般的な重要性が明らかになった。この重要性は、異なる基質においても共通であることを示唆する結果を得た。一方、塩基性残基の空間的配置の重要性は基質によって多様である事も示唆された。

  • 研究成果

    (20件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] ハンブルク大学(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      ハンブルク大学
  • [雑誌論文] The SecM arrest peptide traps a pre-peptide bond formation state of the ribosome2024

    • 著者名/発表者名
      Gersteuer Felix、Morici Martino、Gabrielli Sara、Fujiwara Keigo、Safdari Haaris A.、Paternoga Helge、Bock Lars V.、Chiba Shinobu、Wilson Daniel N.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 15 ページ: 1~16

    • DOI

      10.1038/s41467-024-46762-2

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] RAPP-containing arrest peptides induce translational stalling by short circuiting the ribosomal peptidyltransferase activity2024

    • 著者名/発表者名
      Morici Martino、Gabrielli Sara、Fujiwara Keigo、Paternoga Helge、Beckert Bertrand、Bock Lars V.、Chiba Shinobu、Wilson Daniel N.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 15 ページ: 1~16

    • DOI

      10.1038/s41467-024-46761-3

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification of Bacillus subtilis YidC Substrates Using a MifM-instructed Translation Arrest-based Reporter2023

    • 著者名/発表者名
      Shiota Narumi、Shimokawa-Chiba Naomi、Fujiwara Keigo、Chiba Shinobu
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 435 ページ: 168172~168172

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2023.168172

    • 査読あり
  • [学会発表] 翻訳アレストを介した細胞の機能制御2024

    • 著者名/発表者名
      千葉志信
    • 学会等名
      第2回タンパク質関連シンポジウム
    • 招待講演
  • [学会発表] 海洋性バクテリア Alteromonas macreodii の多様な翻訳アレスト因子2024

    • 著者名/発表者名
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • 学会等名
      第18回日本ゲノム微生物学会年会
  • [学会発表] 機能性翻訳途上鎖の生理機能と分子機構2023

    • 著者名/発表者名
      千葉志信
    • 学会等名
      第4回マルチファセットプロテインズ領域会議
  • [学会発表] 新規翻訳アレスト因子のバクテリアワイドな探索2023

    • 著者名/発表者名
      藤原圭吾、辻奈緒子、吉田真悠、千葉志信
    • 学会等名
      第19回21世紀大腸菌研究会
  • [学会発表] アルテロモナス属由来新規翻訳アレスト因子の下流遺伝子発現制御機構の解析2023

    • 著者名/発表者名
      辻奈緒子、藤原圭吾、千葉志信
    • 学会等名
      第19回21世紀大腸菌研究会
  • [学会発表] クロストリジウム綱に由来する新規翻訳アレスト因子の分子機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      吉田真悠、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • 学会等名
      第19回21世紀大腸菌研究会
  • [学会発表] 翻訳アレストを利用した細胞の機能制御の分子機構2023

    • 著者名/発表者名
      千葉志信
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会年会
  • [学会発表] Bacteria-wide search for translational arrest peptides2023

    • 著者名/発表者名
      藤原圭吾、辻奈緒子、吉田真悠、千葉志信
    • 学会等名
      第24回日本RNA学会年会
  • [学会発表] Identification of Novel Translation Arrest Peptides with RAPP and RGPP sequence Motifs2023

    • 著者名/発表者名
      Tsuji Naoko,_Fujiwara Keigo, Takada Hiraku_, Chiba Shinobu
    • 学会等名
      第24回日本RNA学会年会
  • [学会発表] タンパク質局在化装置に関連する翻訳アレスト因子のバクテリアワイドサーチ2023

    • 著者名/発表者名
      藤原圭吾、辻奈緒子、吉田真悠、千葉志信
    • 学会等名
      マルチファセットプロテインズ領域会議・第2回若手の会
  • [学会発表] クロストリジウム綱由来の新規アレスト因子の分子機構と下流遺伝子制御の解明2023

    • 著者名/発表者名
      吉田真悠、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • 学会等名
      マルチファセットプロテインズ領域会議・第2回若手の会
  • [学会発表] 配列モチーフの探索による新規アレスト因子の同定2023

    • 著者名/発表者名
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • 学会等名
      マルチファセットプロテインズ領域会議・第2回若手の会
  • [学会発表] 機能性翻訳途上鎖の生理機能と分子機構2023

    • 著者名/発表者名
      千葉志信
    • 学会等名
      第5回マルチファセットプロテインズ領域会議
  • [学会発表] RAPP様配列を含む新規翻訳アレスト因子の同定2023

    • 著者名/発表者名
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • 学会等名
      第96会日本生化学会大会
  • [学会発表] Regulated translation arrest: a regulation mechanism of genes for bacterial protein localization machinery2023

    • 著者名/発表者名
      Shinobu Chiba
    • 学会等名
      BACELL2023
    • 国際学会
  • [学会発表] 新生ポリペプチド鎖によるタンパク質バイオジェネシスのモニタリング2023

    • 著者名/発表者名
      千葉志信
    • 学会等名
      新資源生物変換研究会
    • 招待講演

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公開日: 2024-12-25  

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