• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2023 年度 実施状況報告書

相同DNA鎖間の空間制御によるDNA相同組換え修復の促進機構

研究課題

研究課題/領域番号 21K06280
研究機関学習院大学

研究代表者

菱田 卓  学習院大学, 理学部, 教授 (60335388)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
キーワードDNA相同組換え / DNA二本鎖切断 / 染色体構造
研究実績の概要

大腸菌のSMC(染色体構造維持)ファミリーに属するRecNタンパク質は、真核生物の染色体に相当する核様体構造の安定性維持に関与し、DNA二本鎖切断(DSB)修復の促進に重要な役割を果たしている。本研究では、アラビノースの添加により遺伝子発現が誘導されるPBADプロモーターの下流にRecN遺伝子を導入した発現制御系を用いて、DNA損傷ストレス下でRecNの発現タイミングが核様体の動態や安定性に及ぼす影響を詳細に解析した。これまでの研究から、DSB誘導剤であるマイトマイシンCで処理したrecN欠損細胞では、核様体の断片化が引き起こされることが示されていたが、今回の実験系を用いた解析から、MMC処理後のrecN欠損細胞にRecNを発現すると、断片化した核様体が正常な構造へと回復し、野生型細胞と同程度にまで細胞生存率が回復することがわかった。同様の条件でGFPまたはmCherryを融合したRecN及びRecAを蛍光顕微鏡を用いて観察すると、GFP-RecNは断片化した核様体の間(ギャップ領域)で特異的な局在を示すフォーカスを形成し、この領域でDNA組換えタンパク質であるRecA-mCherryと共局在していることが示された。さらに、生細胞を用いたGFP-RecNのタイムラプス蛍光観察から、RecNがフォーカスを形成しているギャップ領域において断片化した核様体の再構築が起こることがわかった。これらの結果は、recN欠損細胞で観察された核様体の断片化は細胞死を伴う核様体の崩壊を示すものではなく、RecAを介したDSB修復のプロセスが中断された状態であることを示唆している。これらの結果より、DSB修復時にRecAが関与する相同鎖探索と鎖交換反応は時空間的に分離可能であり、RecNは核様体の動態を制御することによって、RecAによる組換え反応の促進に関与していることが明らかになった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

アラビノースによるRecN発現系を構築し、RecN発現の有無によるDNA損傷時における核様体構造の観察を行なった結果、RecNの発現誘導後に断片化した核様体が元の状態に回復することがわかった。そこで、この核様体の回復過程を詳細に解析するために、RecNとRecA、核様体結合タンパク質であるHUに蛍光タンパク質を融合した実験系を新たに構築し、蛍光顕微鏡を用いた各タンパク質の細胞内動態解析及び生細胞を用いたタイムラプス解析を行なった。その結果、RecNとRecAが核様体の再構築が起こる核様体間ギャップ領域に共局在することを明らかにした。さらに、RecNのATP加水分解活性の欠損したRecN変異体を用いて同様の解析を行なったところ、RecN変異体はギャップ領域に局在できる一方で、その後の核様体の再構築が起こらないことがわかった。

今後の研究の推進方策

今回の結果は、RecAが持つ2つのDNA相同組換えプロセス、すなわちRecAフィラメントによる相同鎖探索とDNA鎖交換反応が時間的・空間的に分離可能であり、SMC様のRecNがRecAフィラメントと核様体の両者の動態を制御することによって一連の反応を促進する必須の役割を果たしていることが明らかになった。今後は、精製タンパク質とDNAを用いた生化学実験によって、RecNによるRecAの組換え反応の制御メカニズムを分子レベルで明らかにする。

次年度使用額が生じた理由

GFP-RecNタンパク質の蛍光顕微鏡観察の実験に使用するRecN変異体の作成及び表現系の確認に一部遅れが生じたため。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] RecN spatially and temporally controls RecA-mediated repair of DNA double-strand breaks2023

    • 著者名/発表者名
      Noda Shunsuke、Akanuma Genki、Keyamura Kenji、Hishida Takashi
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 ページ: 105466~105466

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.105466

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] N-terminal acetyltransferase NatB regulates Rad51-dependent repair of double-strand breaks in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>2023

    • 著者名/発表者名
      Sugaya Natsuki、Tanaka Shion、Keyamura Kenji、Noda Shunsuke、Akanuma Genki、Hishida Takashi
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 98 ページ: 61~72

    • DOI

      10.1266/ggs.23-00013

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Cellular Responses to Chronic UV Radiation: Implications for Genomic Stability2024

    • 著者名/発表者名
      菱田卓
    • 学会等名
      BEAR2024
    • 国際学会
  • [学会発表] 大腸菌 RecN の染色体動態制御が相同組換え修復にもたらす影響の解析2023

    • 著者名/発表者名
      野田俊輔、仁木杏樹、毛谷村賢司、赤沼元気、菱田卓
    • 学会等名
      日本遺伝学会
  • [学会発表] 出芽酵母 Mgs1 C 末端ドメインの機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      赤沼元気、太田哲人、松本彩花、高畠晴、菱田卓
    • 学会等名
      日本遺伝学会
  • [学会発表] DSB 修復における RecN の機能獲得型変異体の単離と解析2023

    • 著者名/発表者名
      井上瑞貴、赤沼元気、野田俊輔、岸義弘、菱田卓
    • 学会等名
      日本遺伝学会
  • [学会発表] 出芽酵母 Mgs1 タンパク質の DNA 結合部位の探索と生化学的解析2023

    • 著者名/発表者名
      太田哲人、赤沼元気、菱田卓
    • 学会等名
      日本遺伝学会
  • [学会発表] 緑膿菌RecNの機能獲得型変異体の単離と解析2023

    • 著者名/発表者名
      井上瑞貴、赤沼元気、野田俊輔、岸義弘、菱田卓
    • 学会等名
      21世紀大腸菌研究会
  • [学会発表] 種を超えて高度に保存されたMgs1C末端ドメインの機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      赤沼元気、菱田卓
    • 学会等名
      第27回 DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [学会発表] 大腸菌の核様体再構築過程とSMC様タンパク質RecNの細胞内局在観察2023

    • 著者名/発表者名
      野田俊輔、仁木杏樹、毛谷村賢司、赤沼元気、菱田卓
    • 学会等名
      第27回 DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [備考] DNA二本鎖切断の修復を時空間的に制御するメカニズムの解明

    • URL

      https://www.univ.gakushuin.ac.jp/about/press/29499.html

URL: 

公開日: 2024-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi