| 研究課題/領域番号 |
21K06305
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| 研究機関 | 九州大学 |
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研究代表者 |
山崎 博史 九州大学, 基幹教育院, 助教 (80750330)
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| 研究分担者 |
松林 圭 酪農学園大学, 農食環境学群, 助教 (60528256)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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| キーワード | メイオベントス / メイオファウナパラドックス / 動吻動物 / トゲカワムシ / 分散 / 集団遺伝 |
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| 研究実績の概要 |
令和５年度は三重県菅島で採集調査を実施し、解析対象種であるEchinoderes sensibilisおよびEchinoderes rexを、それぞれ十分な個体数得る事ができた。また、瀬戸内海のEchinoderes sensibilisサンプルを増やすために、大分県国東半島で採集を行い、こちらも十分な個体数を得る事が出来ている。
現在得られている集団すべてについて、各種20-30個体のDNA抽出が完了している。さらにこれらのミトコンドリアCOI遺伝子の塩基配列の決定も完了済みである。現在は核ITS遺伝子の塩基配列決定を進めているが、一部の個体はヘテロ接合配列を持っており、かつそれぞれの塩基配列長が異なることが示されている。これらのヘテロ配列はサンガーシーケンスでの解読が困難なため、まずは容易に解読可能な個体のみでITSの塩基配列決定ならびに解析を進めている。
ミトコンドリアCOI遺伝子に基づく予備的な解析では、 E. sensibilis、 E. songae、 E. rex、 E. cf. parahorniのいずれも、地理的な遺伝構造が確認できた。特に潮間帯性種であるE. sensibilisと E. songaeについては、海流が集団の分散に影響を及ぼしている可能性が示唆されている。さらにE. sensibilisについては、種子島と九州本島の間に分断がみられており、この海域に流れる黒潮海流が本種の分断に影響を与えていると考えられる。一方で潮下帯性種である E. rexおよび E. cf. parahorniについては、集団の分散・分断に影響を与える要因について特定できていない。今後、ITS遺伝子塩基配列データの追加、IM解析（Isolation with Migration analysis）を行う事で、これらの特定を試みる。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
新型コロナウイルス感染症の感染拡大の影響を受けて延期していた韓国産サンプルの調査について、韓国の研究協力者とのスケジュールが合わず、まだ実施に至っていない。現在得られている個体については、ミトコンドリアCOI遺伝子解析はほぼ予定通り完了している。一方でITS遺伝子解析は、ヘテロ接合配列を持つ個体の解析を試行に想定していた以上の時間がかかってしまった。
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| 今後の研究の推進方策 |
韓国産サンプル調査の実施を行う。また、既に手元にあるサンプルの、ITS遺伝子DNA配列決定を進める。令和６年度後半には得られている全てのDNA配列を用いて、集団遺伝解析を実施する。これらの結果をもとに、動吻動物集団の広域分布を助長あるいは集団の分断に影響を与えている要因について、種ごとならびに生息環境ごとに検証する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
予定していた韓国産サンプル調査について、スケジュールの都合がつかず令和５年度中に実施する事ができなかった。また、ITS遺伝子解析が、計画より一部遅れている。これらの理由で、次年度使用額が生じた。
生じた次年度使用額は、ITS遺伝子解析ならびに延期している韓国産サンプル調査の旅費としての使用を計画している。
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