ハタンポ科魚類の分類学的整理と生物発光の獲得起源の解明

2022 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 21K06313
• 研究機関: 琉球大学
• 研究代表者: 小枝 圭太 琉球大学, 理学部, 助教 (40774584)
• 研究分担者: 別所 学 (別所ー上原学) 名古屋大学, 高等研究院(理), 特任助教 (80880434)
• 研究期間 (年度): 2021-04-01 – 2025-03-31
• キーワード: 生物発光 / 未記載種 / 分類学的整理 / ハタンポ科 / 野外観察 / 分類

研究実績の概要

申請研究を遂行した結果、ハタンポ科魚類を含む数多くの海産魚類の標本を収集することができ、DNA解析用の遺伝子標本に加え、RNA解析用の鮮度の良い遺伝子標本を収集することができた。とりわけ、台湾で収集したRNA用の鮮度の高い標本は、当初想定していた以上に発展的な遺伝子解析が可能であり、また、市場にて収集した標本からも高鮮度な組織標本が必要なRNA解析が可能であることが明らかになった。なお、遺伝解析に必要な南半球産のハタンポ科標本の採集の予定が新型コロナウィルスの影響により引き続き困難であったことから、オーストラリア・ニュージーランドに所在する博物館機関の魚類研究者に連絡し、遺伝標本の提供の手続きを進めている。収集した標本のうち、ハタンポ科標本については海外研究者のランディ・ムーイ氏との連携のもと、これまでに集積した標本も含めて形態観察や遺伝子解析を実施したことによりハタンポ科全体の整理も進み、現在は属の分類学的な整理を進めている。３月には台湾の北部を訪問し、基隆の魚市場と宜蘭縣大溪の魚市場にて標本収集を進め、国立海洋大学の研究室を借りて標本の作製と遺伝子標本の摘出を進めることで、生物発光研究の土台となる深海性の発光性魚類を積極的に収集した。訪問した博物館の所蔵標本を観察し、野外における観察や標本の採集をおこなった結果、ハゼ科やハタ科、テンジクダイ科、イトヨリダイ科、トラギス科、ナガアオメエソ科の複数の未記載種や日本初記録種、稀種の発見につながった。これらの発見の一部は原著論文として投稿中、受理済または発表済である。

現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

以下の予期せぬ理由により、計画よりも進捗がやや遅れていると自己評価した。
（1）自身の所属異動に伴う作業のため、自身の研究活動に使用できる時間が想定より少なかった。
（2）引き続き新型コロナウイルスの蔓延により、海外（とりわけオーストラリア）での標本収集が難かった。
（3）過去にオーストラリアにて収集した標本を再解析することを様々な条件下で複数回試みたが、遺伝子標本の保存が悪かったためかPCR産物を得ることができなかった。
（4）台湾への訪問が可能となったことで、市場にて鮮度の良い標本を入手することができた。また、移動時間が短いため、遺伝子試料を冷やしたまま持ち運ぶことが可能であり、RNAのデータを得ることができた。
（5）調査の過程で副産物的に様々な分類群の標本が入手でき、稀少なものが多く含まれていた。

今後の研究の推進方策

ハタンポ科の分類学的整理を引き続き進める。これらの成果を論文として執筆し、発表する予定である。現在は日本と台湾を中心としたハタンポ属と未記載種が確認されたキンメモドキ属の分類学的再検討に関する原稿の執筆をそれぞれ進めている。今回は新型コロナウイルスの影響により、海外調査は台湾でのみ実施することができた。今回、得られた経験を活かし、他のクレードに含まれる種のRNA解析用標本の入手を目指す。
これらハタンポ科の比較として収集した海産魚類の研究の過程で、数多くの未記載種の存在も明らかになったことから、今後はこれらを分類学的に精査し、適宜記載していく予定である。

次年度使用額が生じた理由

コロナ渦の影響により国外の渡航計画に変更が生じたため。遺伝子解析や国内で実施する研究活動に使用する。

研究成果

• [国際共同研究] 国立海洋大学/国立海洋生物博物館(台湾)
  • 国名: その他の国・地域
  • 外国機関名: 国立海洋大学/国立海洋生物博物館
• [雑誌論文] 石垣島近海から得られた八重山諸島初記録の稀種ヤツメダルマガレイ (2023)
  • 著者名/発表者名: 小枝圭太・平坂 寛・立原一憲
  • 雑誌名: Bull. Fac. Sci. Univ. Ryukyus 巻: 113 ページ: 1-6
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] 西表島トゥドゥマリ浜に漂着した八重山諸島初記録のアラハダカ (2022)
  • 著者名/発表者名: 小枝圭太・和智仲是
  • 雑誌名: 漂着物学会誌 巻: 20 ページ: 33-35
  • 査読あり
• [雑誌論文] A northward range extension of Thysanophrys papillaris (Actinopterygii: Scorpaeniformes: Platycephalidae) to Taiwan. (2022)
  • 著者名/発表者名: Imamura, H., Koeda, K. and Ho, H.-C.
  • 雑誌名: Acta Ichthyologica et Piscatoria 巻: 52 (4) ページ: 267-271
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Assessing the effectiveness of DNA barcoding for exploring hidden genetic diversity in deep-sea fishes. (2022)
  • 著者名/発表者名: Teramura, A., Koeda, K., Matsuo, A., Sato, M. P., Senou, H., Ho, H.-C., Suyama, Y., Kikuchi, K. and Hirase, S.
  • 雑誌名: Marine Ecology Progress Series 巻: 701 ページ: 83-98
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] First eumonostiliferous nemertean from the Nishi-Shichito Ridge, Genrokunemertes obesa gen. et sp. nov. (Eumonostilifera, Nemertea). (2022)
  • 著者名/発表者名: Hokabe, N., Koeda, K., Fujiwara, Y., Tsuchida, S. and Ueshima, R.
  • 雑誌名: Peerj 巻: e13857 ページ: 1-10
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 八丈島から得られたエビスシイラの記録 (2022)
  • 著者名/発表者名: 畑 晴陵・小枝 圭太
  • 雑誌名: 南紀生物 巻: 64 (1) ページ: 74-82
  • 査読あり
• [雑誌論文] 奄美群島喜界島から得られた分布北限記録のキビレハタンポ (2022)
  • 著者名/発表者名: 中村潤平・小枝圭太・本村浩之
  • 雑誌名: 魚類学雑誌 巻: 69 (2) ページ: 219-223
  • 査読あり
• [雑誌論文] 東京大学総合研究博物館動物部門の魚類コレクションの歴史 (2022)
  • 著者名/発表者名: 小枝圭太・畑 晴陵・藍澤正宏・坂本一男・上島 励
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 1-24
• [雑誌論文] Report on the specimens of order Lampridiformes (Teleostei) deposited in the Department of Zoology, the University Museum, the University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 25-35
• [雑誌論文] List of specimens of the families Coryphaenidae and Menidae (Actinopterygii: Teleostei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Harutaka Hata, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 36-44
• [雑誌論文] Report on the specimens of family Ephippidae (Teleostei: Perciformes) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 45-48
• [雑誌論文] Report on the specimens of Setarchidae (Teleostei: Scorpaenoidei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Wada, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 49-54
• [雑誌論文] Report on the specimens of Peristediidae (Teleostei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Wada, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 55-64
• [雑誌論文] Report on the specimens of Trachinidae and Uranoscopidae (Teleostei: Perciformes: Trachinoidei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Wada, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 65-74
• [雑誌論文] Report on the specimens of family Zeiformes (Teleostei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 75-86
• [雑誌論文] Report on the specimens of family Pomacanthidae (Teleostei: Perciformes) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 87-100
• [雑誌論文] A list of the specimens of Chimaeriformes (Holocephali) in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Akinori Teramura, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 101-108
• [雑誌論文] List of the specimens of family Sphyraenidae (Actinopterygii: Teleostei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Harutaka Hata, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 109-122
• [雑誌論文] List of the specimens of family Gempylidae (Actinopterygii: Teleostei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Harutaka Hata, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 123-130
• [雑誌論文] Report on the specimens of family Alepisauridae (Teleostei: Aulopiformes) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 131-136
• [雑誌論文] List of the specimens of the family Anguillidae (Actinopterygii: Anguilliformes) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Hibino, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 137-148
• [雑誌論文] Report on specimens of the family Zenarchopteridae (Teleostei: Beloniformes) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Hirozumi Kobayashi, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 149-156
• [雑誌論文] Report on specimens of the family Butidae (Teleostei: Gobiiformes) in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Hirozumi Kobayashi, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 157-164
• [雑誌論文] List of specimens of the families Ariommatidae, Centrolophidae, Nomeidae, Stromateidae, and Tetragonuridae (Actinopterygii: Teleostei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Harutaka Hata, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 165-180
• [雑誌論文] Specimens of the families Emmelichthyidae and Lobotidae (Actinopterygii: Teleostei) deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo (2022)
  • 著者名/発表者名: Harutaka Hata, Keita Koeda, Masahiro Aizawa, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 181-188
• [雑誌論文] Fish types deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo - Part 2: Myxiniformes, Lamniformes, Carcharhiniformes, Squaliformes, Torpediniformes, Rajiformes, Chimaeriformes, and Acipenseriformes (2022)
  • 著者名/発表者名: Masahiro Aizawa, Keita Koeda, Harutaka Hata, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 189-218
• [雑誌論文] Fish types deposited in the Department of Zoology, The University Museum, The University of Tokyo - Part 3: Clupeiformes, Notacanthiformes, Argentiniformes, Stomiiformes, Cypriniformes, Aulopiformes, Gadiformes, and Ophidiiformes. (2022)
  • 著者名/発表者名: Masahiro Aizawa, Keita Koeda, Harutaka Hata, Kazuo Sakamoto, Rei Ueshima
  • 雑誌名: 東京大学総合研究博物館標本資料報告 巻: 129 ページ: 219-253
• [学会発表] 魚たちの今昔－ゆるやかに変化する南日本の魚類多様性 (2023)
  • 著者名/発表者名: 小枝圭太
  • 学会等名: 魚の会
  • 招待講演
• [学会発表] 東京大学総合研究博物館動物部門収蔵の 魚類コレクションの歴史と現状ならびに今後 (2022)
  • 著者名/発表者名: 小枝 圭太・畑 晴陵・藍澤 正宏・坂本 一男 ・上島 励
  • 学会等名: 2022年度 日本魚類学会年会
• [学会発表] 黒潮からひも解く琉球列島の魚類相の成り立ち (2022)
  • 著者名/発表者名: 小枝圭太
  • 学会等名: 第７回おきなわマリンサイエンスワークショップ
• [学会発表] DNA バーコーディングとMIG-seq 法を用いた日本近海産深海性魚類の 種多様性の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 手良村 知功・小枝 圭太・松尾 歩・佐藤 光彦・瀬能 宏・Hsuan-Ching Ho・陶山 佳久・菊池 潔・平瀬 祥太朗
  • 学会等名: DNA多型学会
• [図書] 角川の集める図鑑GET！ 魚 (2022)
  • 著者名/発表者名: 宮 正樹（総監）・佐土哲也（監）・小枝圭太（監）
  • 総ページ数: 224
  • 出版者: KADOKAWA
• [備考] 小枝研究室
  • URL: https://okinawafish.com/