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2023 年度 実績報告書

CRISPR libraryを用いた網羅的細胞間相互作用解析モデルの開発

研究課題

研究課題/領域番号 21K06945
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

倉田 盛人  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 講師 (40451926)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワード薬剤耐性 / 微小環境 / がん / CRISPR screening / 白血病 / 骨髄
研究実績の概要

がんの治療抵抗性は現在でも依然としてがん診療における大きな問題である。また、腫瘍微小環境において、がん幹細胞と間質支持細胞の相互作用により薬剤耐性が誘導されることが知られている。そこで、申請者らは新たな実験系である「間接的CRISPR screening」を確立した。
間質支持細胞にCRISPR libraryと紫外線照射にて緑色から赤色へ光変換するDendra2を導入し、抗癌剤下で腫瘍細胞株と共培養した。腫瘍細胞は大部分が死滅したが、一部の変異支持細胞と接着していた腫瘍細胞のみ生存・増殖した。この変異支持細胞に紫外線を照射して光変換を誘導し、赤色の支持細胞をセルソーターで分離することで薬剤耐性責任候補遺伝子として39遺伝子を同定した。
各候補遺伝子の変異支持細胞を作成し、それらと共培養した白血病細胞株が抗癌剤曝露下で有意に生存・増殖することが確認された。また、間質が豊富なことで知られている膵癌においても検証し、膵癌細胞株に対して、共培養・薬剤曝露下での生存細胞数を増加させた候補遺伝子を同定した。
候補遺伝子の中で、C9orf89, MAGI2, MLPH, RHBDD2, 欠損支持細胞で強い薬剤耐性や抗アポトーシス作用が誘導されることが確認され、各々欠損細胞に対してRNA-seqを施行すると、CXCL12の上昇が腫瘍細胞に薬剤耐性を誘導することが確認された。
膵癌臨床検体の検討では、間質細胞でのRHBDD2低発現が独立予後不良因子であり、またRHBDD2とCXCX12発現に逆相関することが確認された。
今回確立した間接的CRISPR screeningは全ての種類の細胞間相互作用機序の解明や新薬開発の新たなプラットフォームになり得る。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2023 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件) (うち招待講演 1件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] David Largaespada/University of Minnesota/Masonic Cancer Center(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      David Largaespada/University of Minnesota/Masonic Cancer Center
  • [国際共同研究] Branden Moriarity/University of Minnesota/Masonic Cancer Center(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Branden Moriarity/University of Minnesota/Masonic Cancer Center
  • [雑誌論文] Indirect CRISPR screening with photoconversion revealed key factors of drug resistance with cell-cell interactions2023

    • 著者名/発表者名
      Sugita Keisuke、Onishi Iichiroh、Nakayama Ran、Ishibashi Sachiko、Ikeda Masumi、Inoue Miori、Narita Rina、Oshima Shiori、Shimizu Kaho、Saito Shinichiro、Sato Shingo、Moriarity Branden S.、Yamamoto Kouhei、Largaespada David A.、Kitagawa Masanobu、Kurata Morito
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 ページ: 582

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04941-9

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] ランダム変異スクリーニングを利用したがん治療ターゲットの網羅的検索2023

    • 著者名/発表者名
      倉田盛人
    • 学会等名
      第69回日本病理学会秋期特別総会(久留米)
    • 招待講演
  • [備考] プレスリリース:新規CRISPR screeningを用いた薬剤耐性の解明

    • URL

      https://www.tmd.ac.jp/press-release/20230601-1/

  • [備考] 科学新聞 Science Japan:

    • URL

      https://sj.jst.go.jp/news/202308/n0817-02k.html

URL: 

公開日: 2024-12-25  

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