| 研究課題/領域番号 |
21K07979
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| 研究機関 | 金沢大学 |
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研究代表者 |
飯田 宗穂 金沢大学, 附属病院, 講師 (40705604)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| キーワード | 腸内細菌 |
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| 研究実績の概要 |
肝癌は癌による死因の中で第5位を占めており、肝癌を制御するための薬剤開発は年々進歩しているが、多種類の分子標的薬のうち、どのような特徴の肝癌にどの薬剤を用いるかを選択する判断材料となるバイオマーカーはほとんど明らかになっていない。治療薬選択のためのバイオマーカーの発見が求められている。
癌患者の癌組織の外科切除標本からDNAを抽出し、細菌に特異的な16SリボソームDNAを増幅したところ複数の菌種が見つかったことが報告され、癌組織の内部の細菌が抗癌剤の治療効果や癌患者の予後と相関しており、バイオマーカーの候補となりうることが報告された。しかし、肝癌内の細菌の存在について詳しく調べた報告が少なく、治療効果との関連は分かっていない。肝癌組織内にはどのような細菌が検出されるのか、その細菌が抗癌治療の効果や予後とどう相関するかを調べ、肝癌内細菌と同一患者の腸内・口腔内細菌との関連も検討し、非侵襲的な便、唾液の細菌検出から肝癌内細菌を予測できるかを検討する。
前年度は34例の肝癌症例から検体を採取したが、本年度においてはさらに21例の肝癌患者から、癌組織、便、唾液の3種の検体を収集した。便検体と唾液検体につき、イルミナ社のMiseqのMiseqを用いて全ゲノムショットガンシーケンシングを行った。細菌叢の同定を行った。また患者の臨床情報について特に背景因子の整理を行い、予後情報を得るための治療成績情報について整理を行った。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
前年度は34例の肝癌症例から検体を採取したが、本年度においてはさらに21例の肝癌患者から、癌組織、便、唾液の3種の検体を収集した。便検体と唾液検体につき、イルミナ社のMiseqのMiseqを用いて全ゲノムショットガンシーケンシングを行った。おおむね意図した症例数が集積しており、この症例数があれば患者臨床情報との相関解析が可能である。
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| 今後の研究の推進方策 |
さらに肝癌患者からの組織、便、唾液の3種の検体の収集を継続する。現時点で集まっている唾液検体からのDNA抽出と全ゲノムショットガンシーケンシングを実行する。また癌組織からのDNA抽出を行い、16SrDNA増幅シーケンシングを行う。臨床情報として、肝癌治療後の予後の情報を取得する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
本年度においては検体の収集と臨床情報の収集を主に実施したため未使用額が生じた。これら収集した検体を用いたシーケンシングは次年度に集中して行うこと
を予定している。そのため次年度にはこれら使用額を用いて複数回のシーケンシングを行う計画である。
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