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2021 年度 実施状況報告書

IgG4関連疾患におけるRNA-Seqを用いた遺伝子発現解析と新規治療標的の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21K08471
研究機関筑波大学

研究代表者

坪井 洋人  筑波大学, 医学医療系, 講師 (80580505)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワードIgG4関連疾患 / RNA-Seq / 主成分分析 / パスウェイ解析
研究実績の概要

無治療のIgG4関連疾患(IgG4-RD)確診例(2011年IgG4-RD包括診断基準)(N=3)から、組織学的基準を満たす顎下腺、末梢血単核球(PBMC)を採取し、magnetic-activated cell sorting(MACS)でCD3+T細胞、CD19+B細胞を分離した。顎下腺とPBMCの間で、1)CD3+T細胞、2)CD19+B細胞の遺伝子発現をRNA-Seqで比較し、主成分分析(principal component analysis: PCA)によるクラスタリング、発現変動遺伝子に関してIngenuity Pathway Analysis(IPA)を用いてパスウェイ解析を行った。
1)PCAでは末梢血CD3+T細胞と顎下腺CD3+T細胞の遺伝子発現パターンは異なり、顎下腺CD3+T細胞で発現増加した遺伝子は214個、減少した遺伝子は50個であった。IPAでは、顎下腺におけるTh2、Th1、Toll-like receptor(TLR)、SLE in T cell pathway、IL-17シグナルの亢進が認められた。
2)PCAでは末梢血CD19+B細胞と顎下腺CD19+B細胞の遺伝子発現パターンは異なり、顎下腺CD19+B細胞で発現増加した遺伝子は630個、減少した遺伝子は109個であった。IPAでは、顎下腺におけるSLE in B cell pathway、補体、IL-15産生、IL-8シグナルの亢進が認められた。
以上の結果から、RNA-SeqによりIgG4-RD病変局所のT細胞、B細胞で発現変動した遺伝子が同定され、病態への関与が示唆されるパスウェイが抽出された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

RNA-Seqを用いて、IgG4関連疾患(IgG4-RD)病変局所のT細胞、B細胞で発現変動した遺伝子を同定し、さらに病態への関与が示唆されるパスウェイを抽出できたため。

今後の研究の推進方策

RNA-Seqで同定された発現変動遺伝子に関して、定量PCRによるvalidationとタンパクレベルでの発現解析をすすめる。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2021

すべて 学会発表 (2件)

  • [学会発表] RNA-Seqを用いたIgG4関連疾患病変局所のT/B細胞特異的発現変動遺伝子の同定2021

    • 著者名/発表者名
      坪井洋人、本田文香、安部沙織、高橋広行、近藤裕也、松本功、住田孝之
    • 学会等名
      第65回日本リウマチ学会総会・学術集会
  • [学会発表] IgG4関連疾患におけるステロイド治療後の再燃例の検討2021

    • 著者名/発表者名
      田渕大貴、坪井洋人、杉田稔貴、西山泰平、寺崎真由、岡本翔太、寺崎俊彦、清水優、本田文香、栁下瑞希、藏田泉、大山綾子、安部沙織、長田侑、髙橋広行、萩原晋也、近藤裕也、住田孝之、松本功
    • 学会等名
      第65回日本リウマチ学会総会・学術集会

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公開日: 2022-12-28  

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