研究課題
ミスマッチ修復欠損・マイクロサテライト不安定性（dMMR/MSI-H）を示す大腸癌は、全大腸癌のうち15%程度であり、転移再発例においては4-5%と低頻度であるが、免疫活性化と免疫逃避、免疫チェックポイント阻害剤（ICI）の適応など、日常臨床において最も確立したサブタイプといえる。しかしdMMR/MSI-Hは、部分的な重複と相反する特徴が混在し極めて広汎なスペクトラムを内包しており、この不均一性は既知のゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、免疫学的因子などによって容易に説明することはできない。本研究では、dMMR/MSI-H大腸癌を、個別化治療が可能な複数の希少サブフラクションの集合として再認識することである。
3: やや遅れている
dMMR/MSI-H大腸癌が包含する不均一性は、単一の因子により説明することはできず、網羅的・多層的視点が必須であり、複数の仮定のもとに複雑な解析に時間を要している。
独自のbioinformaticsを応用し、大規模かつ複数のdMMR/MSI-H大腸癌マルチオミクスコホートを用いて、網羅的プラットフォーム（マイクロアレイ、RNA-seq、コピー数解析、ゲノムseq）、非網羅的プラットフォーム（免疫染色、qRT-PCR、in vitro実験系、免疫学的実験系）を統合し、遺伝子だけでなく免疫・間質のプロファイルを活用する。
大規模な公開データを用いた解析が主体であったこと、当研究室ですでに確立した実験系が本研究の予備実験に流用可能であったことから、結果として新規の支出が抑えられた。次年度使用額は、消耗品費に充当する。
すべて 2022 2021
すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)
Cancer Immunology, Immunotherapy
巻: ‐ ページ: -
10.1007/s00262-022-03200-w
Anticancer Research
巻: 41 ページ: 4895～4905
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