| 研究課題/領域番号 |
21K09337
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| 研究機関 | 愛知県がんセンター(研究所) |
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研究代表者 |
濱田 俊介 愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 研究員 (90747289)
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| 研究分担者 |
細田 和貴 愛知県がんセンター(研究所), がん情報・対策研究分野, 研究員 (00728412)
今釜 史郎 名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (40467288)
田口 歩 愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 分野長 (50817567)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| キーワード | 骨軟部肉腫 / PDXモデル / PDC / プロテオミクス / 細胞表面タンパク質 / 多層オミクス解析 / CRISPR-Cas9 / 合成致死 |
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| 研究実績の概要 |
希少がんである骨軟部肉腫の大部分を占める、脂肪肉腫、未分化多形肉腫，平滑筋肉腫，滑膜肉腫などの非円形細胞肉腫においては、化学療法あるいは放射線療法に対する感受性は低い。近年、トラベクテジン、エリブリン、さらに分子標的治療薬であるパゾパニブなどが開発されているものの、その効果は限定的であり、分子生物学的な知見に基づく新たな骨軟部肉腫治療法の開発は、喫緊かつ最重要の課題である。本研究では、外科手術検体から肉腫患者腫瘍組織移植（patient-derived xenograft; PDX）モデルを作成し、細胞表面タンパク質（サーフェスオーム）解析から下流の活性化シグナル経路同定のためのリン酸化タンパク質解析まで含む高深度な多層プロテオーム解析によって、新規治療標的分子や薬剤感受性予測バイオマーカーの探索同定を行った。現在までに、骨軟部肉腫20症例（滑膜肉腫2例、平滑筋肉腫1例、未分化多型肉腫9例、繊維肉腫2例、粘液繊維肉腫3例、横紋筋肉腫1例、悪性末梢神経鞘腫1例）についてPDXモデルを作成し、このうち6症例においては、さらに患者腫瘍由来細胞株（Patient-derived cells; PDC）を樹立できた。PDX腫瘍、PDCそれぞれにおいて、ゲノム、トランスクリプトーム、サーフェスオームを含む空間プロテオーム解析を行い、他癌種PDX腫瘍多層オミクスデータとの比較から、肉腫分子シグネチャの同定を進めている。また、並行して、化学療法の感受性に関与する分子を網羅的に捕捉するために、PDCを用いてCRISPR-Cas9システムによるゲノムワイド機能スクリーニングを進めている。
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