2023 年度研究成果報告書

系統的に近縁関係の梅毒トレポネーマ株間を細分化する塩基置換候補の評価とその応用

研究課題

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研究課題/領域番号	21K09388
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	基金
応募区分	一般
審査区分	小区分56030:泌尿器科学関連
研究機関	国立感染症研究所
研究代表者	中山周一国立感染症研究所, 細菌第一部, 主任研究官 (80280767)
研究期間 (年度)	2021-04-01 – 2024-03-31
キーワード	梅毒トレポネーマ / 系統分類 / 感染ルート推定
研究成果の概要	2020年３月以降の127検体でTP_0705内3 SNPsのデータを取得した。3 SNPs特定127例での仮説による予想系統分布はSS14-East Asia系統111、SS14-Omega系統5、Nichols C&E 系統 6、TEN 系統 5であった。このデータからの予想系統が正しいかをゲノム解析で確認することが直近の課題となる。これまでの調査報告では国内株の、SS14-East Asia以外の３系統はMSM患者由来に限定されていたが、今回のデータでは女性患者由来の予想Nichols C&E系統 1例、予想SS14-Omega系統 1例がそれぞれ検出された。
自由記述の分野	細菌遺伝学
研究成果の学術的意義や社会的意義	世界的な流行が継続、拡大している梅毒の制御に当たっては、検体からの迅速な系統分類を通した科学的根拠を持った感染ルート推定を行うことが必須である。試験管内培養が基本的に不能な本菌では系統を確定するためのゲノム解析は、その成功率が低い。我々は特定1遺伝子TP_0705のPCR産物内の３箇所の１塩基置換が系統と対応するという仮説を提出した。このことが実証されれば、飛躍的に多数の検体での系統決定が可能となり、また、その結果が判明するまでの期間も大幅に短縮できる。これは冒頭の課題に足して多大な貢献を与える。