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2023 年度 実施状況報告書

グラフ表現学習の転移性・構成性の獲得とその実践

研究課題

研究課題/領域番号 21K12041
研究機関京都大学

研究代表者

瀧川 一学  京都大学, 国際高等教育院, 特定教授 (10374597)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
キーワード機械学習 / グラフ / 表現学習
研究実績の概要

本年度の研究実績の概要は以下の通りである。
(i) 標準的なグラフ畳み込み操作によるグラフニューラルネットワーク(GNN)について、畳み込みネットワーク(CNN)やTransformerなど画像や言語処理で成功を収めているアーキテクチャとの比較的検証により、Graph TransformerとGNNの設計パターン(特に深層化、スキップ接続、グラフ正規化)について本年度は様々な発展が見られた。本課題で主として念頭に置いている分子科学データにおいても、この技術的進展・知見を反映することで、実データでの予測モデルの分析・改良を行った。この際、CNNで開発されてきた様々な技巧を総括評価しVision Transformerに比する精度実現に至ったConvNextの知見を参考にGNNの設計についても様々な技法を総合的に評価する土台が得られた。
(ii) グラフデータにおいて、各頂点に3次元座標を伴う幾何的制約の考慮が必要な幾何グラフに対する予測タスクについて、幾何代数に基づく表現に基づいてニューラルネットワークを構成することで自然な幾何的制約を効果的に扱うことができると言う新たな知見に基づき、方法の分析・検討を行った。また、主にN粒子系の時系列変化を予測するGNS法についてユークリッド群同変性を導入する技術的検証を行った。
(iii) グラフニューラルネットワークを用いて時間ダイナミクスのシミュレーションを行うGNS法に基づいて細胞の自己組織化過程の学習を行い検証した。この予備的結果について専門誌への投稿を行い論文として出版した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

機械学習分野において、Graph Transformerや3次元の変換群同変性の扱いの研究に技術的な進展が見られたため、その知見の検証と評価を行うことで、モデル設計や学習制御について一定の理解が得られた。また、代表者の所属変更により新たな研究者との連携も得られるなど、進捗としてはまずまず順調に進んでいると考えられる。

今後の研究の推進方策

本年度は最終年度であり、研究期間に得られた成果を出版に向けて総括するとともに、今後の課題の整理を行う。具体的には下記の研究計画で研究を行う予定である。
(i) N粒子系の時間変動の機械学習シミュレーションの方法であるGNS法のベースモデルでE(3)同変性を幾何代数表現に基づく方法で考慮するモデルのプロトタイプ構築を行い、実際のN-粒子系シミュレーションデータ、分子動力学データ、化学反応経路データなどの実データでモデルの精度検証を行う。
(ii) Graph Transformerの系譜を含めて、深層グラフニューラルネットワークの実践的設計パターンについて、さらに一般的に検証を行う。特にスキップ接続の効果、グラフ正規化層の設計と効果、グラフプーリングの評価などを系統的に行い、画像をグラフと見た場合の評価も含めて実験的に検証を行う。
(iii) 研究期間の初期に得られた分子グラフ描画におけるグラフ自動補完について、機械学習システムと使用者であるユーザとのインタラクションをML-Human Interactionの問題としてさらに探求する。機械学習システムを実際にユーザが利用する状況で、考慮すべき機械学習システムの振る舞いについて理解を進める。

次年度使用額が生じた理由

代表者の所属変更により本年度は当初予定の出張が困難となり、出張費が見込みより少なくなった。また、所属変更により必要となっていた昨年度繰越で実施した大型計算機器の移送の実施が遅れたため、移送費に係る支出見込みの確定が年明けにずれ込んだ。差額については、本年度の出張および機器整備や計算費用に支出予定である。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件)

  • [雑誌論文] Machine Learning Refinement of <i>In Situ</i> Images Acquired by Low Electron Dose LC-TEM2024

    • 著者名/発表者名
      Katsuno Hiroyasu、Kimura Yuki、Yamazaki Tomoya、Takigawa Ichigaku
    • 雑誌名

      Microscopy and Microanalysis

      巻: 30 ページ: 77~84

    • DOI

      10.1093/micmic/ozad142

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Graph Network-Based Simulation of Multicellular Dynamics Driven by Concentrated Polymer Brush-Modified Cellulose Nanofibers2024

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa Chiaki、Nguyen Duc Anh、Nakaji-Hirabayashi Tadashi、Takigawa Ichigaku、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      ACS Biomaterials Science &amp; Engineering

      巻: 10 ページ: 2165~2176

    • DOI

      10.1021/acsbiomaterials.3c01888

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Machine Learning-Based Analysis of Molar and Enantiomeric Ratios and Reaction Yields Using Images of Solid Mixtures2023

    • 著者名/発表者名
      Ide Yuki、Shirakura Hayato、Sano Taichi、Murugavel Muthuchamy、Inaba Yuya、Hu Sheng、Takigawa Ichigaku、Inokuma Yasuhide
    • 雑誌名

      Industrial &amp; Engineering Chemistry Research

      巻: 62 ページ: 13790~13798

    • DOI

      10.1021/acs.iecr.3c01882

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gait video-based prediction of unified Parkinson’s disease rating scale score: a retrospective study2023

    • 著者名/発表者名
      Eguchi Katsuki、Takigawa Ichigaku、Shirai Shinichi、Takahashi-Iwata Ikuko、Matsushima Masaaki、Kano Takahiro、Yaguchi Hiroaki、Yabe Ichiro
    • 雑誌名

      BMC Neurology

      巻: 23 ページ: 358

    • DOI

      10.1186/s12883-023-03385-2

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Accelerated discovery of multi-elemental reverse water-gas shift catalysts using extrapolative machine learning approach2023

    • 著者名/発表者名
      Wang Gang、Mine Shinya、Chen Duotian、Jing Yuan、Ting Kah Wei、Yamaguchi Taichi、Takao Motoshi、Maeno Zen、Takigawa Ichigaku、Matsushita Koichi、Shimizu Ken-ichi、Toyao Takashi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 ページ: 5861

    • DOI

      10.1038/s41467-023-41341-3

    • 査読あり

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公開日: 2024-12-25  

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