ヒストン修飾による季節的な遺伝子制御の進化プロセス

2023 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 21K15164
• 研究機関: 滋賀大学
• 研究代表者: 西尾 治幾 滋賀大学, データサイエンス学系, 助教 (60802593)
• 研究期間 (年度): 2021-04-01 – 2024-03-31
• キーワード: 植物の環境記憶 / エピゲノム

研究実績の概要

研究代表者らは、ヒストン修飾による発現記憶の仕組みの進化プロセスを明らかにするため、昨年度より引き続き、進化的系譜を代表する複数植物種（被子植物門のハクサンハタザオ、ヤブツバキ、裸子植物門のアカマツ、ヒカゲノカズラ植物門のクラマゴケ、シダ植物門のコシダ、ゼニコケ植物門のオオジャゴケの6種）について、兵庫県多可郡多可町の思出川沿いに生育する自然個体を対象として、定期的なサンプリングおよび分子実験を行った。そしてバイオインフォマティクス解析により、各植物のヒストン修飾の季節ダイナミクスを調べた。特にハクサンハタザオにおいて、発現が活性化している遺伝子群の進化的な古さが、季節によって異なることがわかった。

研究成果

• [雑誌論文] Beyond heat waves: Unlocking epigenetic heat stress memory in <i>Arabidopsis</i> (2023)
  • 著者名/発表者名: Nishio Haruki、Kawakatsu Taiji、Yamaguchi Nobutoshi
  • 雑誌名: Plant Physiology 巻: 194 ページ: 1934～1951
  • DOI: 10.1093/plphys/kiad558
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Statistical analysis of organelle movement using state-space models (2023)
  • 著者名/発表者名: Nishio Haruki、Hirano Satoyuki、Kodama Yutaka
  • 雑誌名: Plant Methods 巻: 19 ページ: 67
  • DOI: 10.1186/s13007-023-01038-6
• [学会発表] 非生物的ストレスの記憶および花成制御における冬の記憶 (2024)
  • 著者名/発表者名: 西尾治幾
  • 学会等名: 第71回日本生態学会大会
• [学会発表] Circadian and environmental signal integration in a natural population of <i>Arabidopsis</i> (2024)
  • 著者名/発表者名: Nishio H, Cano-Ramirez DL, Muranaka T, de Barros Dantas LL, Honjo MN, Sugisaka J, Kudoh H, Dodd AN
  • 学会等名: 第65回日本植物生理学会年会
• [学会発表] Seasonal dynamics of epigenome in a natural population of <i>Arabidopsis halleri</i> (2023)
  • 著者名/発表者名: Nishio H, Ito T, Honjo MN, Muranaka T, Emura N, Kimura H, To TK, Inagaki S, Kakutani T, Kudoh H
  • 学会等名: The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
  • 国際学会