大腸粘膜下層浸潤癌におけるmicro RNA網羅的解析

2021 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 21K15406
• 研究機関: 岩手医科大学
• 研究代表者: 永塚 真 岩手医科大学, 医学部, 助教 (90815937)
• 研究期間 (年度): 2021-04-01 – 2024-03-31
• キーワード: micro RNA / 大腸癌

研究実績の概要

大腸粘膜下層浸潤癌についてパラフィンからRNAを抽出した、いくつかの症例でRNAの抽出に難渋し一部固有筋層浸潤、漿膜下層浸潤症例も登録した。術前化学療法が行われた症例、遺伝性腫瘍症例、免疫染色やMSI解析でMSIが示唆された症例は除外とした。結果としてリンパ節転移例18例, 非転移例21例で解析を行なった。網羅的miRNA解析はaffymetrix GeneChip miRNA Array 4.0を用いた。リンパ節転移群と非転移群のmiRNA発現変動の比較はFDR p<0.05かつdelta Fold change>絶対値2を越えるものを抽出することとした。その結果8個のmiRNA (miR-4685-3p, 6754-3p, 6806-3p, 8085など)でup regulationを示した。down regulationを示したものは認めなかった。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

収集し得た症例でのmicro RNAの網羅的解析を終え、転移群と非転移群間での発現変動の解析は終えた。

今後の研究の推進方策

解析を行った症例のmRNAについて網羅的解析を行い、転移群と非転移群の発現変動の比較、網羅的解析によって得られたmRNAとmiRNAのうち逆パターンを認める組み合わせの抽出をパスウェイ解析で絞り込みその回帰性を検討する。

次年度使用額が生じた理由

解析のための試薬を予定症例分購入したところ残が生じた。追加症例での解析ないしはmRNA解析に役立てたい。