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2021 年度 実施状況報告書

呼吸鎖酵素の新規アロステリック調節機構の証明と抗菌剤開発への展開

研究課題

研究課題/領域番号 21K15443
研究機関国立研究開発法人国立循環器病研究センター

研究代表者

西田 優也  国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 研究所, 上級研究員 (10793440)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
キーワードシトクロムc酸化酵素 / 呼吸鎖 / 薬剤耐性菌 / 抗菌薬 / アロステリック阻害薬 / クライオ電子顕微鏡 / X線結晶構造解析
研究実績の概要

近年、次々と新しい薬剤耐性病原菌が発生しており、その脅威に備えることは、世界保健衛生上の最重要課題であることから、新規なメカニズムによる抗生物質の開発が強く求められている。この背景のなか、エネルギー産生機構・呼吸鎖は、新たな創薬標的として近年注目を集めるようになった。本研究の研究代表者は、ミトコンドリア内膜の呼吸鎖で働くヘムタンパク質シトクロムc酸化酵素(CcO)の新規なアロステリック阻害剤を発見すると共に、CcOと阻害剤との複合体構造を決定することで、新規なアロステリック活性調節部位を発見した。続いて、この活性調節部位を形成するヘム周囲の立体配座がアミノ酸配列相同性が低い他のヘムタンパク質においても見出される事実を発見し、“ヘムタンパク質に普遍的なアロステリック活性調節機構が存在する”という仮説から本研究立案に至った。
本研究では、CcOの阻害剤をクエリーとして作成した自作のカスタム化合物ライブラリを用いて、複数のタンパク質において、“ヘムタンパク質に普遍的なアロステリック活性調節部位”に結合する化合物をハイスループットスクリーニングに依存しない合理的な発見を目指す。呼吸酵素を含むヘムタンパク質は生体内の様々な反応に関わるため、病原菌では創薬標的として期待が高いことから、本研究の成果は、学術的のみならず、医療や産業への展開が期待できる。得られた阻害剤を用いて菌の増殖抑制効果を検討することで、新規阻害剤の抗菌剤としての実用的な基本コンセプトの実証を目指す。
これまでに大腸菌酵素、緑膿菌酵素の阻害剤を発見し、大腸菌酵素では複合体構造の決定と阻害メカニズムの解明を行うとともに、抗菌薬となり得る菌の増殖を抑制する化合物を取得した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

とくに滞りなくすすんでいるため。

今後の研究の推進方策

大腸菌酵素については論文報告を進める。
緑膿菌酵素ではまだ複合体構造が得られておらず、また、菌の増殖抑制効果がある化合物も得られていないので、化合物展開をさらに進める。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] AMPK regulates cell shape of cardiomyocytes by modulating turnover of microtubules through CLIP‐1702021

    • 著者名/発表者名
      Nishida Yuya、Yashirogi Shohei、Nagao Takemasa、Takahashi Yusuke、Qaqorh Tasneem、Yazawa Issei、Katayama Toru、Kioka Hidetaka、Matsui Tsubasa S、Saito Shigeyoshi、Masumura Yuki、Tsukamoto Osamu、Kato Hisakazu、Ueda Hiromichi、Yamaguchi Osamu、Yashiro Kenta、Yamazaki Satoru、Takashima Seiji、Shintani Yasunori
    • 雑誌名

      EMBO reports

      巻: 22 ページ: -

    • DOI

      10.15252/embr.202050949

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Conserved allostery in heme-copper oxidases2021

    • 著者名/発表者名
      西田優也
    • 学会等名
      Chem-Bio Informatics Society Annual Meeting 2021
  • [学会発表] A novel allostery in cytochrome c oxidase2021

    • 著者名/発表者名
      西田優也
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
  • [学会発表] 呼吸鎖複合体 IV で見出された新規アロステリック活性調節機構2021

    • 著者名/発表者名
      西田優也
    • 学会等名
      第47回 生体分子討論会

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公開日: 2022-12-28  

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