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2022 年度 実績報告書

呼吸鎖酵素の新規アロステリック調節機構の証明と抗菌剤開発への展開

研究課題

研究課題/領域番号 21K15443
研究機関国立研究開発法人国立循環器病研究センター

研究代表者

西田 優也  国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 研究所, 室長 (10793440)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
キーワードシトクロムc酸化酵素 / 呼吸鎖 / 薬剤耐性菌 / 抗菌薬 / アロステリック阻害薬 / クライオ電子顕微鏡 / X線結晶構造解析
研究実績の概要

近年、次々と新しい薬剤耐性病原菌が発生しており、その脅威に備えることは、世界保健衛生上の最重要課題であることから、新規なメカニズムによる抗生物質の開発が強く求められている。この背景のなか、エネルギー産生機構・呼吸鎖は、新たな創薬標的として近年注目を集めるようになった。本研究の研究代表者は、ミトコンドリア内膜の呼吸鎖で働くヘムタンパク質シトクロムc酸化酵素(CcO)の新規なアロステリック阻害剤を発見すると共に、CcOと阻害剤との複合体構造を決定することで、新規なアロステリック活性調節部位を発見した。続いて、この活性調節部位を形成するヘム周囲の立体配座がアミノ酸配列相同性が低い他のヘムタンパク質においても見出される事実を発見し、“ヘムタンパク質に普遍的なアロステリック活性調節機構が存在する” という仮説から本研究立案に至った。
本研究では、自作のカスタム化合物ライブラリを用いて、複数のタンパク質において、“ヘムタンパク質に普遍的なアロステリック活性調節部位” に結合する化合物をハイスループットスクリーニングに依存しない合理的な発見を目指す。ヘムタンパク質は生体内の様々な反応に関わるため、創薬標的として期待が高いことから、本研究の成果は、学術的のみならず、医療や産業への展開が期待できる。得られた阻害剤を用いて菌の増殖抑制効果を検討することで、新規阻害剤の抗菌剤としての実用的な基本コンセプトの実証を目指す。
これまでに種々のヘムタンパク質阻害剤を発見したが、大腸菌酵素では複合体構造の決定と阻害メカニズムの解明を行うとともに、抗菌薬となり得る菌の増殖を抑制する化合物を取得した。さらに、髄膜炎菌/淋菌酵素でも特異的な阻害剤を発見し、これが薬剤耐性淋菌に対して殺菌作用を持つことを示した。以上の結果は申請者の仮説を実証する内容であり、今後は当該コンセプトに基づく抗菌薬開発の実用化を目指したい。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2022 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 2件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Identifying antibiotics based on structural differences in the conserved allostery from mitochondrial heme-copper oxidases2022

    • 著者名/発表者名
      Nishida Yuya et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 ページ: 7591-

    • DOI

      10.1038/s41467-022-34771-y

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Effects of Interfacial Interactions on Electrocatalytic Activity of Cytochrome <i>c</i> Oxidase in Biomimetic Lipid Membranes on Gold Electrodes2022

    • 著者名/発表者名
      Kato Masaru、Sano Ryoya、Yoshida Narumi、Iwafuji Masatoshi、Nishiyama Yoshito、Oka Sayuki、Shinzawa-Itoh Kyoko、Nishida Yuya、Shintani Yasunori、Yagi Ichizo
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      巻: 13 ページ: 9165~9170

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.2c01765

    • 査読あり
  • [学会発表] 呼吸鎖複合体 IV のコア構造に注目した病原菌特異的抗菌薬の探索2022

    • 著者名/発表者名
      Yuya Nishida, Yasunori Shintani
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会 第48回討論会
  • [学会発表] Conserved allostery in heme-copper oxidases can generate pathogen-specific antibiotics2022

    • 著者名/発表者名
      Yuya Nishida, Yasunori Shintani
    • 学会等名
      Cell Symposia: Multifaceted Mitochondria (CMIT2022)
    • 国際学会
  • [学会発表] Evolutionally conserved allostery in heme-copper oxidases can generate pathogen-specific antibiotics2022

    • 著者名/発表者名
      Yuya Nishida, Yasunori Shintani
    • 学会等名
      21th European Bioenergetics Conference
    • 国際学会
  • [図書] ヘムタンパク質の科学2022

    • 著者名/発表者名
      城 宜嗣、青野 重利、齋藤 正男
    • 総ページ数
      472
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      978-4-86043-778-7
  • [備考] 呼吸鎖酵素に隠された阻害機構の解明 病原菌特異的な新規抗菌薬の合理的創出を目指して

    • URL

      https://www.ncvc.go.jp/pr/release/pr_35763/

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公開日: 2023-12-25  

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