研究課題
EGFR遺伝子陽性の肺腺癌におけるTTF-1の役割に関して、継続して実験・解析を行った。Gene Expression Omnibusにて公開されているデータセットを用いて、EGFR遺伝子変異陽性肺腺癌の患者組織検体を用いた網羅的遺伝子発現データを解析した。EGFRチロシンキナーゼ(EGFR-TKI)阻害薬への治療前後で比較すると、Gene Ontology解析およびGene Set Enrichment解析を行ったところ、TTF-1低発現株とTTF-1高発現株ではEGFR-TKIの耐性機序は異なり、TTF-1高発現株では上皮間葉転換が耐性に関与していることが示唆された。これは、前年度のin vitro実験、EGFR遺伝子変異陽性肺腺癌細胞株の網羅的遺伝子発現データ解析の結果と合致するものであった。その他、TTF-1の多面的作用の一部として腫瘍免疫にかかわる機能解析を行い、PD-L1を制御することで腫瘍免疫抑制的に働いていることが示唆された。
2: おおむね順調に進展している
遺伝子発現データ解析が進行している。
今後、TTF-1抗体を用いたクロマチン免疫沈降シークエンスやTTF-1ノックダウン細胞株のRNAシークエンスの解析を進める予定である。また、TTF-1とPD-L1の関連性についても解析が進行中である。
ChIP-seqの遺伝子発現データが未取得のため、追加実験で使用する予定である。また、論文投稿・掲載費用にも使用する予定である。
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