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2021 年度 実施状況報告書

AIを応用した膵癌患者体液中miRNA診断パネルの作製および体液間移行の解析

研究課題

研究課題/領域番号 21K16436
研究機関千葉県がんセンター(研究所)

研究代表者

石毛 文隆  千葉県がんセンター(研究所), 肝胆膵外科, 医長 (60815801)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
キーワードmiRNA / 膵癌 / バイオマーカー
研究実績の概要

膵癌患者(n=9)と健常者(n=6)からUrine Cell-Free Circulating RNA Purification Maxi Kitを用いて尿中マイクロRNAを抽出。Small RNA Libraryの構築を行い、次世代シーケンサー(Ion PGM&8482; System)を用いてmicroRNAの網羅的な発現プロファイリングを行った。
膵癌患者では数種類のマイクロRNAを含むクラスターが高発現している傾向があった。
同様に、血液からもTotal Exosome RNA & Protein Isolation Kitを用いてTotal RNAを抽出し、Ion Total RNA-Seq Kit V2を用いてSmall RNA Libraryの構築を行った。次世代シーケンサーを用いた発現プロファイリングを行ったが、膵癌患者と健常者間での有意な発現差異を呈するマイクロRNAは認められなかった。
今後はさらにサンプル数を増やし、AIを用いた統合的な解析やマーカー候補となるようなマイクロRNAの絞り込み・多検体での検証や、パネル化に向けて研究を進める。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

膵がんに対する術前化学療法が当院での標準治療のひとつになり、治療開始前の体液採取が非常に困難となった。そのため症例の蓄積がやや減ったが、院内各部署の連携を構築し改善してきている。

今後の研究の推進方策

当院の各機関・部署と連携して、血液や尿といったサンプルのスムーズな採取と保管の仕組みを構築し、サンプル数増加を図る。
また、治療前サンプルにこだわらず、化学療法後・手術後といったサンプルでの検討を考慮する。

次年度使用額が生じた理由

実験器具・キットの購入や学会発表・論文掲載料、そのほか諸経費です。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件)

  • [雑誌論文] Cell-free microRNA-1246 in different body fluids as a diagnostic biomarker for esophageal squamous cell carcinoma2021

    • 著者名/発表者名
      Hoshino Isamu、Ishige Fumitaka、Iwatate Yosuke、Gunji Hisashi、Kuwayama Naoki、Nabeya Yoshihiro、Yokota Hajime、Takeshita Nobuyoshi、Iida Keiko、Nagase Hiroki、Matsubara Hisahiro
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 16 ページ: e248016~e248016

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0248016

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Deep learning-based gene selection in comprehensive gene analysis in pancreatic cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Mori Yasukuni、Yokota Hajime、Hoshino Isamu、Iwatate Yosuke、Wakamatsu Kohei、Uno Takashi、Suyari Hiroki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 ページ: -

    • DOI

      10.1038/s41598-021-95969-6

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The usefulness of microRNA in urine and saliva as a biomarker of gastroenterological cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Hoshino Isamu
    • 雑誌名

      International Journal of Clinical Oncology

      巻: 26 ページ: 1431~1440

    • DOI

      10.1007/s10147-021-01911-1

    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2022-12-28  

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