研究課題/領域番号 |
21K16785
|
研究機関 | 新潟大学 |
研究代表者 |
田村 亮 新潟大学, 医歯学総合研究科, 客員研究員 (70650620)
|
研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
|
キーワード | 卵巣成熟嚢胞性奇形腫悪性転化 / 腫瘍内異質性 / マルチサンプリング / 全エクソンシーケンス / 扁平上皮癌 |
研究実績の概要 |
本研究は先行研究の追加として、検体数の追加による分子生物学的特徴の検証およびXCL1の発現差による違いの検証、臨床検体を用いた実験リソースの作成とXCL1-XCR1経路の機能解析および抗PD1/PD-L1抗体の効果の検証、腫瘍XCL1発現と抗PD-1/PD-L1抗体の奏効割合との関連性の評価を行うことを目的としている。これまでに、2症例の網羅的解析の追加と実験リソースの作成を行なっている。今回の報告では、2症例に対して腫瘍内の複数の部位から検体採取を行い網羅的解析を行なった結果を報告する。 先行研究において、卵巣成熟嚢胞性奇形腫から発生した扁平上皮癌で、TP53とPIK3CAの遺伝子変異を高頻度に認め、本疾患の発生・進展にこれらの変異が重要であることが示唆された。しかし、課題として、腫瘍組織の一箇所のみのサンプリングであり、遺伝子変異がどのように空間的に広がりを示しているのかを明らかにできていないことが挙げられる。そこで、同一症例の正常上皮を含む複数の部位に対して網羅的解析を行うことで、腫瘍内不均一性を明らかにすることでさらなる治療戦略を構築することを目的とした。今回、新規2症例に対して腫瘍内の正常上皮部分や複数の癌部分からマルチサンプリングを行い、網羅的ゲノム解析を行った。いずれの症例でも腫瘍内に組織学的異質性が存在し、(症例1: 非角化型扁平上皮癌および角化型扁平上皮癌、症例2: 非角化型扁平上皮癌および未分化癌)、組織型ごとに異なる遺伝子異常のプロファイルを有していた。また症例1では正常上皮を含む全ての部位でTP53変異を認めたのに対し、症例2では非扁平上皮癌の部分でのみTP53の変異を認めた。いずれの症例もPIK3CAは非角化型扁平上皮癌でのみ認めた。今回の結果により、本疾患の発生・進展における多様性や組織学的・分子生物学的に強い腫瘍内異質性が明らかとなった。
|
現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
希少疾患を対象にしており、検体収集に難渋している。また、新規2症例に対して、実験リソースの作成を試みたが、実験に使用できる段階まで進んでいない。関連研究として、新規症例2症例に対して、マルチサンプリングを行い網羅的解析を行なった結果をまとめ、論文化を進めている。
|
今後の研究の推進方策 |
引き続き、検体の収集や新規症例に対して網羅的解析や実験リソースの作成を試みる。ただし、希少疾患であることやこれまでに2症例に対して行いうまくいっていないことから、順調に進まない可能性を考慮し、他のアプローチによる本疾患におけるXCL1の意義の解明と治療戦略の構築を同時に進める。本疾患に対して、現在、single cell omics解析を行うことを予定している。
|
次年度使用額が生じた理由 |
稀な疾患を対象としており、新規症例の数が予定していたより少なく、検体収集、実験リソースの作成が順調に進まなかったため、実験が遅れ次年度使用額が生じた。本年度においては、必要により予定していた実験の順番を変更しての使用や、single cell解析など別のアプローチを用いての本研究の推進を考えており、新規症例が少ない場合にはその用途での使用を進めたい。
|