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2021 年度 実施状況報告書

日本人の眼瞼基底細胞癌の網羅的ゲノム解析で明らかにする既存薬物の有効性

研究課題

研究課題/領域番号 21K16898
研究機関九州大学

研究代表者

秋山 雅人  九州大学, 医学研究院, 講師 (10757686)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
キーワード基底細胞癌 / エクソーム / がんゲノム
研究実績の概要

本年度までに、当院を受診し外科的治療を受けた合計26人から研究参加同意を取得し、13人の基底細胞癌患者に由来する腫瘍と血液サンプルについて、エクソームシークエンスを行った。基底細胞癌の既知のがん関連遺伝子が高頻度に眼瞼部の基底細胞癌で検出されることを確認した。また、過去に基底細胞癌に関して報告のない遺伝子の体細胞変異が、半数を超える7例 (54%)で同定され、そのうち5つの変異が遺伝子の機能への影響が強い、ストップコドンやフレームシフトなどの変異であった。このことから、眼瞼部基底細胞癌では、他の部位に発生する基底細胞癌と同様の遺伝子異常に起因する一方で、眼瞼部特有の体細胞異常が存在する可能性が示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度は、13人の基底細胞癌患者に由来する腫瘍と血液サンプルについて、エクソームシークエンスを行い、変異コールまで完了した。

今後の研究の推進方策

研究期間内に可能な限り検体を取得しエクソームシークエンスを実施する。得られたデータを用いて、予定しているコピーナンバー数の評価、体細胞変異パターンの検証、治療薬物候補の検索、臨床表現型や薬剤応答性に関わる遺伝子変異の検討を行う。

次年度使用額が生じた理由

検体収集は問題なく行えているが、腫瘍から抽出可能なDNA量が少ない検体があり、当該年度でシークエンス可能なサンプルについてはすべてシークエンスしたが、残余額が発生した。

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公開日: 2022-12-28  

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