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2022 年度 実施状況報告書

ゲノム編集とiPS細胞やオルガノイド培養技術を用いたヒトモデル表現型解析系の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21K18247
研究機関大阪大学

研究代表者

水口 裕之  大阪大学, 大学院薬学研究科, 教授 (50311387)

研究期間 (年度) 2021-07-09 – 2024-03-31
キーワードゲノム編集 / iPS細胞 / オルガノイド / 肝臓 / 腸管
研究実績の概要

本研究は、ゲノム編集技術とヒトiPS細胞やオルガノイドを用いた細胞分化誘導系を利用して、特定遺伝子のヒトモデルでの表現型解析系の開発を行うことを目的とする。遺伝子組換えマウスの普及は、個々の遺伝子の機能解明研究に“最終的な答え”を提供し、生命科学研究に決定的な貢献をしてきた。しかしながら、遺伝子組換えマウスを用いた研究成果がヒトに外挿できないことも多く、『種差』の問題があった。そこで本研究では、創薬応用の観点からも重要な組織である肝臓と腸管に焦点をあて、ヒト肝発生や肝幹前駆細胞から肝細胞/胆管上皮細胞への分化選別、ヒト腸管幹細胞から腸管上皮細胞への分化過程に関与する各種分子の機能解明、非アルコール性脂肪肝疾(NASH)関連分子であるMAIP1を実証例として、ヒトモデルでの汎用性の高い表現型解析法を確立する。R4年度は、以下の成果を得た。
1)昨年度確立したゲノム編集技術が、ヒトiPS細胞だけでなく、ヒトiPS細胞由来肝オルガノイドにおいても適用できることを確認した。
2)前年度にTolloid-like1(TLL1)は肝幹前駆細胞から胆管上皮細胞への分化を促進することを明らかにしたが、R4年度はTLL1は肝星細胞から主に産生され、TGFβシグナルの活性化を介して胆管上皮細胞の成熟化に寄与していることを明らかにした。
3)ヒトiPS細胞から腸管上皮細胞への分化誘導系やヒト腸管オルガノイドを用いた腸管上皮細胞分化に関わる遺伝子群の機能解析を目的に、オルガノイドの単層培養化等で腸管機能を上昇させる培養条件の検討とRNAseq解析、および化合物を用いた阻害実験を行った。
4) 我々が同定したNASH関連分子であるMAIP1の機能解析を進め、Maip1欠損マウスでは絶食誘発性脂肪肝が亢進することを見出した。さらに、MAIP1欠損ヒトiPS細胞由来肝細胞の作製を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

R4年度は以下を実施し、おおむね順調に進展している。
1)ヒトiPS細胞やヒト肝臓・腸管オルガノイドにおける高効率両アリルゲノム編集技術開発: 昨年度確立したゲノム編集技術が、ヒトiPS細胞だけでなく、ヒトiPS細胞由来肝細胞をオルガノイド化した肝細胞においても適用できることを確認した。
2)ヒトiPS細胞から肝細胞への分化誘導系やヒト肝臓オルガノイドを用いたTLL1および中胚葉細胞の肝発生における機能解析: C型肝炎ウイルス排除後の肝癌発症やNASH患患者の肝線維化進展へ関与が報告されているTLL1の胆管形成に寄与について解析した。TLL1欠損ヒトiPS細胞を用いた解析から、TLL1は肝星細胞から主に産生され、TGFβシグナルの活性化を介して胆管上皮細胞の成熟化に寄与していることを明らかにした。
2)ヒトiPS細胞から腸管上皮細胞への分化誘導系やヒト腸管オルガノイドを用いた腸管上皮細胞分化に関わる遺伝子群の機能解析: 腸管オルガノイドを単層培養化した場合や、特殊な基材で培養することで腸管機能が上昇することを見出したので、本過程に関与する培養条件の検討とRNAseq解析、および化合物を用いた阻害実験を行った。
3) NASH関連マイクロRNA miR-27bの標的遺伝子MAIP1の機能解析: 我々が同定したNASH関連マイクロRNA miR-27bの標的遺伝子であるMAIP1の機能を培養細胞、および欠損マウスを用いて解析した。その結果、細胞レベルでの解析で、MAIP1をノックダウンするとミトコンドリア機能の低下および脂質蓄積の亢進が誘導されることを明らかとした。Maip1コンベンショナル欠損マウスにおいては、絶食誘発性脂肪肝が亢進することを見出した。さらに、MAIP1欠損ヒトiPS細胞を樹立し、肝細胞への分化誘導、およびオルガノイド化を行った。

今後の研究の推進方策

1)ヒトiPS細胞やヒト肝臓・腸管オルガノイドにおける高効率両アリルゲノム編集技術開発: 本研究全般に使用する欠損細胞を樹立する。適宜修正が必要であれば、修正し、本研究の迅速な実施につなげる。
2)ヒトiPS細胞から肝細胞への分化誘導系やヒト肝臓オルガノイドを用いたTLL1および中胚葉細胞の肝発生における機能解析: TLL1による胆管分化促進効果のより詳細な機能解析を目的に、ヒトiPS細胞を胆管分化させた細胞群におけるsingle cell RNAseq解析を実施し、解析を進める。
3)ヒトiPS細胞から腸管上皮細胞への分化誘導系やヒト腸管オルガノイドを用いた腸管上皮細胞分化に関わる遺伝子群の機能解析: 引き続き、単層化や特殊な基材で培養することで、ヒト腸管オルガノイドにおける腸管機能が向上するメカニズムを解析し、優れたin vitro薬物評価系の開発につなげる。
4) NASH関連マイクロRNA miR-27bの標的遺伝子MAIP1の機能解析: Maip1欠損マウスで見られた脂肪肝亢進の原因が、肝細胞におけるMaip1欠損によるものかどうかについて確認するため、Maip1欠損マウスに対し8型アデノ随伴ウイルス(AAV8)ベクターを用いて肝臓特異的にMaip1を発現させることにより詳細に検討する。さらに、肝臓特異的にMaip1を欠損させたマウスを新たに作出し、検討を進める。また、MAIP1欠損ヒトiPS細胞由来肝オルガノイドを用いて、ヒト肝細胞でのMAIP1欠損の影響を解析する。

次年度使用額が生じた理由

初年度に新型コロナウイルス感染症の影響により、iPS細胞を用いた実験を行うにあたって必須の海外メーカーから調達する実験試薬の調達に大幅な遅延が生じたため、iPS細胞を用いた一部の実験に遅延が生じた。本実験試薬は、R4年3月から4月にかけて入手できたため、遅延した研究についてはR4年度中に実施したが、一部はR5年度にずれ込んだ。なお、一部の研究については研究が遅延したが、本研究全体を考えると研究は計画通りに実施できたため、現在までの進捗状況としてはおおむね順調に進展しているとした。

  • 研究成果

    (25件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (22件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Biliary epithelial cell differentiation of bipotent human liver-derived organoids by 2D and 3D culture.2023

    • 著者名/発表者名
      Tong Y., Ueyama-Toba Y., Mizuguchi H.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Rep.

      巻: 33 ページ: 101432

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2023.101432.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Establishment of MDR1-knockout human enteroids for pharmaceutical application.2023

    • 著者名/発表者名
      Inui T., Nomoto R., Yokota J., Yamashita T., Okada K., Kishimoto W., Nakase H., Mizuguchi H.
    • 雑誌名

      Drug. Metab. Pharmacokinet.

      巻: 48 ページ: 100476

    • DOI

      10.1016/j.dmpk.2022.100476.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparison of human biopsy-derived and human iPS cell-derived intestinal organoids established from a single individual.2023

    • 著者名/発表者名
      Inui T., Yamashita T., Tomita J., Yokota J., Kishimoto W., Nakase H., Mizuguchi H.
    • 雑誌名

      Drug. Metab. Pharmacokinet.

      巻: 48 ページ: 100482

    • DOI

      10.1016/j.dmpk.2022.100482.

    • 査読あり
  • [学会発表] マトリゲルに代わる三次元培養基材(HYDROXTM)を用いた高機能ヒト肝臓オルガノイドの作製2023

    • 著者名/発表者名
      仝嫣然、植山(鳥羽)由希子、横田純平、山崎春香、叶井正樹、松井勇人、水口裕之
    • 学会等名
      第22回日本再生医療学会総会
  • [学会発表] ヒトiPS細胞由来肝細胞を用いた肝オルガノイドの樹立と二次元培養による創薬応用2023

    • 著者名/発表者名
      乾純平、植山(鳥羽)由希子、水口裕之
    • 学会等名
      第22回日本再生医療学会総会
  • [学会発表] ヒト肝臓オルガノイド由来成熟肝細胞の分化誘導法の開発2023

    • 著者名/発表者名
      植山(鳥羽)由希子、仝嫣然、水口裕之
    • 学会等名
      第22回日本再生医療学会総会
  • [学会発表] オルガノイド培養技術を利用した高機能なヒトiPS細胞由来小腸上皮細胞の開発2023

    • 著者名/発表者名
      乾達也、横田純平、河合夏苗、山下智起、植山由希子、水口裕之
    • 学会等名
      第22回日本再生医療学会総会
  • [学会発表] 両親媒性ポリマー由来三次元ナノファイバー(HYDROX)のヒト肝臓オルガノイド培養への適用評価2023

    • 著者名/発表者名
      仝嫣然、植山(鳥羽)由希子、横田純平、山崎春香、叶井正樹、松井勇人、水口裕之
    • 学会等名
      日本薬学会第143年会
  • [学会発表] 両親媒性ポリマー由来三次元ナノファイバー(HYDROX)を用いた高機能なヒト腸管オルガノイドの培養2023

    • 著者名/発表者名
      横田純平、植山(鳥羽)由希子、仝嫣然、岡田健太郎、浦谷悠生、岸本航、仲瀬裕志、山崎春香、叶井正樹、松井勇人、水口裕之
    • 学会等名
      日本薬学会第143年会
  • [学会発表] AAV8を用いた肝特異的Maip1発現はMaip1ノックアウトマウスの絶食誘発性脂肪肝の亢進を抑制する2023

    • 著者名/発表者名
      荒居千遥、酒井英子、Marcos Taracena-Gandara、増田有香、櫻井文教、水口裕之
    • 学会等名
      日本薬学会第143年会
  • [学会発表] 創薬イノベーション・レギュレーションプラットフォーム技術 ーヒトiPS細胞およびヒト生検腸管オルガノイドを用いた新規ヒト型in vitro試験系2023

    • 著者名/発表者名
      水口裕之
    • 学会等名
      日本薬学会第143年会
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト肝細胞および腸管上皮細胞モデルの開発と創薬応用 ~MPSへの応用に向けた課題と克服~2023

    • 著者名/発表者名
      水口裕之
    • 学会等名
      Dialogue社Webinar
    • 招待講演
  • [学会発表] The Differentiation Potency of Human Liver Organoids Toward Biliary Epithelial Cells2022

    • 著者名/発表者名
      Yanran Tong, Yukiko Ueyama-Toba, Hiroyuki Mizuguchi
    • 学会等名
      日本組織培養学会第94回大会
  • [学会発表] Establishment of hepatocyte organoids using human iPS cell-derived hepatocytes and their investigation for drug discovery research2022

    • 著者名/発表者名
      Jumpei Inui, Yukiko Ueyama-Toba, Hiroyuki Mizuguchi
    • 学会等名
      日本組織培養学会第94回大会
  • [学会発表] Comparison of culture media for human enteroids from the viewpoint of pharmacokinetic studies2022

    • 著者名/発表者名
      Jumpei Yokota, Tomoki Yamashita, Tatsuya Inui, Wataru Kishimoto, Hiroshi Nakase, Hiroyuki Mizuguchi
    • 学会等名
      日本組織培養学会第94回大会
  • [学会発表] 肝臓オルガノイドからの高機能な肝細胞の作製法開発とその応用2022

    • 著者名/発表者名
      植山(鳥羽)由希子、仝嫣然、今村千春、村井一裕、下田彬允、疋田隼人、渡士幸一、江口英利、竹原徹郎、水口裕之
    • 学会等名
      第29回 肝細胞研究会
  • [学会発表] ヒトiPS細胞由来肝細胞を用いた肝オルガノイドの作製と創薬応用に向けた検討2022

    • 著者名/発表者名
      乾純平、植山(鳥羽)由希子、水口裕之
    • 学会等名
      第29回 肝細胞研究会
  • [学会発表] Maip1ノックアウトマウスにおける絶食誘発性脂肪肝の亢進は肝臓特異的Maip1発現により抑制される2022

    • 著者名/発表者名
      荒居千遥、酒井英子、Marcos Taracena-Gandara、増田有香、櫻井文教、水口裕之
    • 学会等名
      第72回 日本薬学会 関西支部総会・大会
  • [学会発表] ヒト肝臓オルガノイド由来胆管上皮細胞様細胞の作製と機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      仝嫣然、植山(鳥羽)由希子、水口裕之
    • 学会等名
      第72回 日本薬学会 関西支部総会・大会
  • [学会発表] Tolloid-like 1欠損ヒトiPS細胞株を用いた胆管上皮細胞への分化過程におけるTLL1の機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      越野智葵、植山(鳥羽)由希子、山口朋子、川端健二、田中靖人、水口裕之
    • 学会等名
      第72回 日本薬学会 関西支部総会・大会
  • [学会発表] Comparison of human intestinal organoid culture media for pharmacokinetic applications2022

    • 著者名/発表者名
      Jumpei Yokota, Tomoki Yamashita, Tatsuya Inui, Wataru Kishimoto, Hiroshi Nakase, Hiroyuki Mizuguchi
    • 学会等名
      日本薬物動態学会第37回年会
  • [学会発表] Development of intestinal organoids with functions of human iPS cell-derived enterocyte like cells and their application to drug discovery research2022

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Inui, Jumpei Yokota, Kanae Kawai, Tomoki Yamashita, Hiroyuki Mizuguchi
    • 学会等名
      日本薬物動態学会第37回年会
  • [学会発表] Establishment of hepatocyte organoids from human iPS cell-derived hepatocytes and development of their two-dimensional culture method2022

    • 著者名/発表者名
      Jumpei inui, Yukiko Ueyama-Toba, Hiroyuki Mizuguchi
    • 学会等名
      日本薬物動態学会第37回年会
  • [学会発表] In Vitro Models for Drug Metabolism and Response in Poor Metabolizers Using Human iPS Cells and Genome Editing Technology2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Mizuguchi
    • 学会等名
      Gordon Research Conference Drug Metabolism
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 再生医療技術を利用したヒト肝細胞および腸管上皮細胞モデルの開発と創薬応用2022

    • 著者名/発表者名
      水口裕之
    • 学会等名
      第37回年会日本薬物動態学会
    • 招待講演

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公開日: 2023-12-25  

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