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2021 年度 実施状況報告書

脂質代謝を起点とした転写による小胞輸送制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K19088
研究機関広島大学

研究代表者

船戸 耕一  広島大学, 統合生命科学研究科(生), 准教授 (30379854)

研究分担者 中川 強  島根大学, 学術研究院農生命科学系, 教授 (30202211)
研究期間 (年度) 2021-07-09 – 2024-03-31
キーワード転写 / 脂質 / COPII小胞 / 酵母 / シロイヌナズナ
研究実績の概要

研究代表者の酵母を用いたこれまでの解析により、COPII小胞の形成が脂質代謝を介する転写制御によってコントロールされていることが見出された。しかし、その調節に関与する転写因子の支配下にある因子はまだ同定されていない。本研究では、転写因子の欠損株で発現が大きく変動した220の遺伝子を対象に網羅的にスクリーニングし、COPII小胞の形成に関与する因子の同定を目指す。また、実験モデル生物として酵母とシロイナズナを用いて、COPII小胞形成に必要なSEC遺伝子との多重変異株を作製し、候補因子のCOPII小胞の形成における役割の解明も目指す。

初年度の2021年度は、220の遺伝子のうち転写因子の欠損株で発現が減少した173遺伝子を野生型酵母に形質転換し、過剰発現させて、酵母の生育を悪化させる遺伝子を探索し、8つの候補遺伝子を取得した。さらに、絞り込みを行うため、酵母の候補遺伝子とSEC12遺伝子との二重変異株を作製し、sec12-4変異による表現型における候補遺伝子破壊の抑圧効果を解析し、COPII小胞の形成を負に制御する2つの候補遺伝子を同定した。この結果を踏まえ、シロイヌナズナの候補遺伝子ホモログとSEC遺伝子間での交配による二重変異株の作製に取り掛かった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究では、220の遺伝子を対象に網羅的にスクリーニングし、COPII小胞の形成に関与する因子の同定とCOPII小胞形成における役割の解明を目指している。2021年度は、転写因子の欠損株で発現が減少した173遺伝子を対象に、過剰発現によって酵母の生育が悪化する遺伝子をスクリーニングし、8つの候補遺伝子を取得した。さらに、それら8つの候補遺伝子とSEC12遺伝子との二重変異株を作製し、表現型解析による絞り込み行った。その結果、遺伝子破壊によってsec12-4変異の表現型を抑圧する2つの遺伝子を取得することができ、COPII小胞の形成を負に制御する候補遺伝子を発見することができた。また、その結果を踏まえ、交配によるシロイヌナズナの候補遺伝子ホモログとSEC遺伝子間での二重変異株の作製にも取り掛かった。以上の結果から、ほぼ当初の計画通り、順調に進展している。

今後の研究の推進方策

2021年度で作製した候補遺伝子とSEC12遺伝子との二重変異株を用いて、COPII小胞形成における候補遺伝子の役割について解析を行う。また、候補遺伝子産物と物理的相互作用するタンパク質の酵母遺伝子とSEC遺伝子との二重変異株の作製を行う。シロイヌナズナの二重変異株の作製も継続して行う。さらに、220の遺伝子のうち転写因子の欠損株で発現が増加した47遺伝子については、sec12-4変異株に形質転換し、過剰発現させて表現型を抑圧する多コピーサプレッサーをスクリーニングし、COPII小胞の形成を正に制御する候補遺伝子の取得を目指す。

  • 研究成果

    (24件)

すべて 2022 2021

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 4件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Quality-controlled ceramide-based GPI-anchored protein sorting into selective ER exit sites2022

    • 著者名/発表者名
      Rodriguez-Gallardo S, Sabido-Bozo S, Ikeda A, Araki, M, Okazaki K, Nakano M, Aguilera-Romero A, Cortes-Gomez A, Lopez S, Waga M, Nakano A, Kurokawa K, Muniz M, Funato K.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 39 ページ: 110768

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110768

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Expression analysis of plant intracellular Ras-group related leucine-rich repeat proteins (PIRLs) in Arabidopsis thaliana.2022

    • 著者名/発表者名
      Hossain MF, Sultana MM, Tanaka A, Dutta AK, Hachiya T, Nakagawa T.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Rep.

      巻: 30 ページ: 101241

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2022.101241

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The Ceramide Synthase Subunit Lac1 Regulates Cell Growth and Size in Fission Yeast.2021

    • 著者名/発表者名
      Flor-Parra I, Sabido-Bozo S, Ikeda A, Hanaoka K, Aguilera-Romero A, Funato K, Muniz M, Lucena R.
    • 雑誌名

      Int. J. Mol. Sci.

      巻: 23 ページ: 303

    • DOI

      10.3390/ijms23010303

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Membrane Contact Sites in Yeast: Control Hubs of Sphingolipid Homeostasis.2021

    • 著者名/発表者名
      Schlarmann P, Ikeda A, Funato K.
    • 雑誌名

      Membranes (Basel)

      巻: 11 ページ: 971

    • DOI

      10.3390/membranes11120971

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Protocol for measuring sphingolipid metabolism in budding yeast.2021

    • 著者名/発表者名
      Ikeda A, Hanaoka K, Funato K.
    • 雑誌名

      STAR Protoc.

      巻: 2 ページ: 100412

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2021.100412

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural analysis of the GPI glycan.2021

    • 著者名/発表者名
      Nakano M, Sabido-Bozo S, Okazaki K, Aguilera-Romero A, Rodriguez-Gallardo S, Cortes-Gomez A, Lopez S, Ikeda A, Funato K, Muniz M.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 16 ページ: e0257435

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0257435

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] リピドーム解析から見えてきた小胞輸送の脂質代謝制御2022

    • 著者名/発表者名
      中里光希,池田敦子,Isabelle Riezman,Howard Riezman,船戸耕一
    • 学会等名
      支部創立20周年記念日本農芸化学会中四国支部第61回講演会
  • [学会発表] 出芽酵母におけるスフィンゴ脂質による液胞の形態制御機構2022

    • 著者名/発表者名
      花岡和樹,池田敦子,船戸耕一
    • 学会等名
      支部創立20周年記念日本農芸化学会中四国支部第61回講演会
  • [学会発表] 分裂酵母におけるセラミド合成酵素Lag1とLac1の機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      花岡 和樹, 池田 敦子, 船戸 耕一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
  • [学会発表] COPII小胞輸送を制御する遺伝子の探索と機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      中里 光希, 池田 敦子, 船戸 耕一
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
  • [学会発表] 転写制御因子によるCOPⅡ小胞輸送の制御機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      中里光希, 加藤萌伊, 金井宗良, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      支部創立20周年記念 日本農芸化学会中四国支部会第59回講演会(例会)
  • [学会発表] Screening for kinase genes regulating COPII vesicle trafficking in Saccharomyces cerevisiae2021

    • 著者名/発表者名
      Mitsuki Nakazato, Yuga Sono, Atsuko Ikeda, Kouichi Funato
    • 学会等名
      ICY15 meets ICYGMB30
    • 国際学会
  • [学会発表] Membrane contact sites regulate vacuole morphology2021

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Hanaoka, Kensuke Nishikawa,Sayumi Yamashita, Aya Nakaji, Atsuko Ikeda, Kouichi Funato
    • 学会等名
      ICY15 meets ICYGMB30
    • 国際学会
  • [学会発表] 小胞体での脂質代謝変動の核による感知が小胞輸送を調節する2021

    • 著者名/発表者名
      中里光希, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本・中四国・関西支部合同大会(第60回講演会)
  • [学会発表] オルガネラの構造におけるGPI脂質リモデリングの役割2021

    • 著者名/発表者名
      西井日向子,荒木美彩子, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本・中四国・関西支部合同大会(第60回講演会)
  • [学会発表] セラミドの長さが脂質ドメインを介したTORC1の活性に重要である2021

    • 著者名/発表者名
      櫻木桂子,關川裕一郎, 池田敦子,船戸耕一
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本・中四国・関西支部合同大会(第60回講演会)
  • [学会発表] 分裂酵母のセラミド合成酵素Lag1とLac1の機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      花岡和樹, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      第38回 YEAST WORKSHOP
  • [学会発表] TORC2の下流で働く新規キナーゼの探索2021

    • 著者名/発表者名
      後田梨緒, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      第38回 YEAST WORKSHOP
  • [学会発表] Nnk1キナーゼは小胞輸送を介したスフィンゴ脂質の合成に関与する2021

    • 著者名/発表者名
      佐野美咲, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      第38回 YEAST WORKSHOP
  • [学会発表] オルガネラの形態維持におけるGPI脂質リモデリングの役割2021

    • 著者名/発表者名
      西井日向子, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      第38回 YEAST WORKSHOP
  • [学会発表] 小胞体での脂質代謝変動の核による感知が小胞輸送を調節する2021

    • 著者名/発表者名
      中里光希, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      第38回 YEAST WORKSHOP
  • [学会発表] メチオニン代謝がCOPⅡ小胞輸送を調節する可能性の発見2021

    • 著者名/発表者名
      藤内孝樹, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      第38回 YEAST WORKSHOP
  • [学会発表] 液胞膜ドメインの形成におけるスフィンゴ脂質とMCSの役割に関する研究2021

    • 著者名/発表者名
      櫻木桂子, 池田敦子, 船戸耕一
    • 学会等名
      第38回 YEAST WORKSHOP
  • [図書] SDGsに向けた生物生産学部入門2021

    • 著者名/発表者名
      三本木 至宏監修・上田 晃弘・杉野 利久・鈴木 卓弥・冨山 毅・船戸 耕一編
    • 総ページ数
      256
    • 出版者
      共立出版
    • ISBN
      978-4-320-05831-6

URL: 

公開日: 2022-12-28  

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