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2023 年度 実績報告書

植物の非膜オルガネラを消失させる因子の大規模探索

研究課題

研究課題/領域番号 21K19145
研究機関京都大学

研究代表者

山野 隆志  京都大学, 生命科学研究科, 准教授 (70570167)

研究期間 (年度) 2021-07-09 – 2024-03-31
キーワードピレノイド / 相分離 / クラミドモナス / CO2濃縮機構
研究実績の概要

藻類の葉緑体内に発達するピレノイドは、地球上の炭素固定の約3割を担い、生物相の一次生産を根幹から支える重要なオルガネラである。ピレノイドを陸上植物に導入し、光合成を改良することで作物の生産性向上につなげようとする研究が進められているが、液-液相分離(以下、相分離)する性質を持つピレノイドそのものの理解が十分ではないため、成功には至っていない。
本研究の最終的な目標は、ピレノイドをモデルとした相分離オルガネラの消失に関わる因子を同定することである。これは、植物が陸上化に伴ってなぜピレノイドを消失していったのかという植物科学の大きな謎を明らかにするだけでなく、食糧問題の解決に向けた植物バイオマス生産の増大という喫緊の課題からも重要である。本研究課題では、ピレノイドの形成や消失が異常になった変異株のスクリーニングを大規模に進め、相分離オルガネラの形成や消失に関わる因子の同定の土台となる変異株を複数単離し、その解析を行った。具体的には、ピレノイドのマーカーとして利用されるルビスコの小サブユニットRbcS1とVenusの融合タンパク質を発現する株に対して、ハイグロマイシン耐性カセットの形質転換によるランダム変異導入を行い、スクリーニングを行った。
スクリーニングの結果、ピレノイドの数と位置に異常がある変異株を5株単離することに成功した。また、次世代シーケンサーを用いたゲノムリシーケンシングによりハイグロマイシンカセットの挿入部位配列の同定を進め、RNA結合タンパク質をコードする遺伝子を同定した。さらに、光合成に関する生理学的な表現型解析を進めた結果、ピレノイドの数を1つに規定することの生理学的意義が明らかとなった。

  • 研究成果

    (23件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 図書 (2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Periplasmic carbonic anhydrase CAH1 contributes to high inorganic carbon affinity in<i>Chlamydomonas reinhardtii</i>2024

    • 著者名/発表者名
      Shimamura Daisuke、Ikeuchi Tomoaki、Tsuji Yoshinori、Fukuzawa Hideya、Yamano Takashi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1101/2024.03.04.583368

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] A pyrenoid-localized protein SAGA1 is necessary for Ca2+-binding protein CAS-dependent expression of nuclear genes encoding inorganic carbon transporters in Chlamydomonas reinhardtii2023

    • 著者名/発表者名
      Shimamura Daisuke、Yamano Takashi、Niikawa Yuki、Hu Donghui、Fukuzawa Hideya
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: 156 ページ: 181~192

    • DOI

      10.1007/s11120-022-00996-7

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pyrenoids: Cutting Edge of Phase-separated Organelles in Plants2023

    • 著者名/発表者名
      Yamano Takashi、Hirakawa Yoshihisa、Matsuzaki Ryo
    • 雑誌名

      PLANT MORPHOLOGY

      巻: 35 ページ: 1~2

    • DOI

      10.5685/plmorphol.35.1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Understanding of green algal pyrenoid as a phase-separating and CO&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;-concentrating organelle2023

    • 著者名/発表者名
      Yamano Takashi
    • 雑誌名

      PLANT MORPHOLOGY

      巻: 35 ページ: 3~8

    • DOI

      10.5685/plmorphol.35.3

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshizawa Susumu、Azuma Tomonori、Kojima Keiichi、Inomura Keisuke、Hasegawa Masumi、Nishimura Yosuke、Kikuchi Masuzu、Armin Gabrielle、Tsukamoto Yuya、Miyashita Hideaki、Ifuku Kentaro、Yamano Takashi、Marchetti Adrian、Fukuzawa Hideya、Sudo Yuki、Kamikawa Ryoma
    • 雑誌名

      Microbes and Environments

      巻: 38 ページ: n/a~n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME23015

    • 査読あり
  • [学会発表] Pyrenoid-based CO2-concentrating mechanism in green alga Chlamydomonas reinhardtii2024

    • 著者名/発表者名
      Takashi Yamano
    • 学会等名
      第2回 理研CSRS ”Carbon neutrality and the beyond” ワークショップ
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] High-resolution observation of the algal pyrenoid, a CO2-concentrating and phase-separated organelle, during cell division2024

    • 著者名/発表者名
      Koujirou Matsuo, Takashi Yamano
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
  • [学会発表] A pyrenoid-localized protein SAGA1 is necessary for Ca2+-binding protein CAS-dependent expression of nuclear genes encoding inorganic carbon transporters2023

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Shimamura, Yuki Niikawa, Donghui Hu, Hideya Fukuzawa, Takashi Yamano
    • 学会等名
      The 20th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas (Chlamy2023)
    • 国際学会
  • [学会発表] ピレノイドをモデルとした相分離オルガネラ形成異常変異株の単離と解析2023

    • 著者名/発表者名
      増田 夢佳、小峠 達大、松尾 光治良、山野 隆志
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
  • [学会発表] クラミドモナスのCO2濃縮機構を抑制するCobW-likeドメインを有するタンパク質の機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      見市 静香、嶋村 大亮、安田 詢子、福澤 秀哉、山野 隆志
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
  • [学会発表] ピレノイドをモデルとした相分離オルガネラ形成異常変異株の単離と解析2023

    • 著者名/発表者名
      増田 夢佳、小峠 達大、松尾 光治良、得津 隆太郎、山野 隆志
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
  • [学会発表] ペリプラズム局在型炭酸脱水酵素CAH1は無機炭素親和性の上昇に寄与する2023

    • 著者名/発表者名
      嶋村 大亮、池内 友彰、辻 敬典、福澤 秀哉、山野 隆志
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
  • [学会発表] 細胞分裂時におけるピレノイド動態の高解像度観察2023

    • 著者名/発表者名
      松尾 光治良、小峠 達大、山野 隆志
    • 学会等名
      第17回クラミドモナス研究会
  • [学会発表] クラミドモナスのピレノイド個数異常株を用いた相分離オルガネラ個数決定機構の研究2023

    • 著者名/発表者名
      増田 夢佳、小峠 達大、松尾 光治良、得津 隆太郎、山野 隆志
    • 学会等名
      第38回ユーグレナ研究会
  • [学会発表] 緑藻クラミドモナスの無機炭素濃縮機構を制御する新規タンパク質の同定2023

    • 著者名/発表者名
      嶋村 大亮、見市 静香、安田 詢子、山原 洋佑、中野 博文、中野 雄司、山上 あゆみ、福澤 秀哉、山野 隆志
    • 学会等名
      第38回ユーグレナ研究会・若手の会
  • [学会発表] クラミドモナスのピレノイド個数異常株を用いた相分離オルガネラ個数決定機構の研究2023

    • 著者名/発表者名
      増田 夢佳、小峠 達大、松尾 光治良、得津 隆太郎、山野 隆志
    • 学会等名
      第19回京大植物縦横無尽の会 ワークショップ
  • [学会発表] 緑藻クラミドモナスの無機炭素濃縮機構を制御する新規タンパク質の同定2023

    • 著者名/発表者名
      嶋村 大亮、見市 静香、安田 詢子、山原 洋佑、中野 博文、中野 雄司、山上 あゆみ、福澤 秀哉、山野 隆志
    • 学会等名
      第19回京大植物縦横無尽の会 ワークショップ
  • [学会発表] 細胞分裂時におけるピレノイド動態の高解像度観察2023

    • 著者名/発表者名
      松尾 光治良、小峠 達大、山野 隆志
    • 学会等名
      第19回京大植物縦横無尽の会 ワークショップ
  • [学会発表] クラミドモナスのCO2濃縮機構を抑制するCobW-WWドメインタンパク質の機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      見市 静香、嶋村 大亮、安田 詢子、福澤 秀哉、山野 隆志
    • 学会等名
      第19回京大植物縦横無尽の会 ワークショップ
  • [図書] 緑藻のピレノイドとCO2濃縮機構2024

    • 著者名/発表者名
      山野 隆志
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      月刊アグリバイオ
  • [図書] 『独立栄養細菌によるCO2資源化技術』 第Ⅱ編第18章 シアノバクテリアのCO2濃縮機構2023

    • 著者名/発表者名
      山野 隆志
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      シーエムシー出版
  • [備考] 微生物細胞機構学分野HP

    • URL

      https://www.molecule.lif.kyoto-u.ac.jp/index.html

  • [備考] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/tyamano

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公開日: 2024-12-25  

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