2023 年度研究成果報告書

長鎖シークエンシング技術を利用した環状RNAの全長一発同定手法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号	21K19238
研究種目	挑戦的研究(萌芽)
配分区分	基金
審査区分	中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関	函館短期大学
研究代表者	梅影創函館短期大学, 食物栄養学科, 講師(移行) (30419436)
研究期間 (年度)	2021-07-09 – 2024-03-31
キーワード	circular RNA
研究成果の概要	環状RNAは新たなバイオマーカーとして期待されており、新たな環状RNAの探索が精力的に進められている。従来の環状RNAの探索手法は、ショートリードシークエンシング技術をベースとしていおり、環状RNAの全配列を一気に決定することができないという欠点があった。この研究では、この問題点を克服することを目的として、ロングリードシークエンシング技術に着目して、環状RNA配列の全長を一気に決定できる手法の開発を目指したプログラムを作成した。一方、環状RNA由来のコンカテマー配列を作成するロングリードシークエンシングライブラリ作成方法を完成させることができず、今後の課題となった。
自由記述の分野	RNA biology
研究成果の学術的意義や社会的意義	環状RNAをロングリードシークエンシングによって一気に解決することができれば、バイオマーカーとなりうる環状RNAの探索がよりスムーズになると期待できる。また、検体試料（例えば唾液）から環状RNA検出までの全行程を確立することができれば、新たな健康診断ツールとしての利用が期待される。