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本研究では、長鎖シークエンス法を用いた癌と非癌部の転写産物の全長解析から、非コード領域に存在する新規タンパク質コード遺伝子候補を同定し機能を解明することを目的とした。ロングリードシークエンサーを用いて複数の腫瘍の転写産物全長解析を行い、癌部で発現量が上昇している転写産物を複数同定した。また、アミノ酸配列からタンパク質のドメイン構造を予測するプログラムを自動化とin houseのプログラムを組み合わせて、発現差がある転写産物に存在するドメインを抽出するプログラムを開発した。これらのアプローチで検出した候補について、さらに詳細な解析を行うとともに、細胞を用いた実験を行う予定である。
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