| 研究課題/領域番号 |
21K19579
|
|---|
| 研究機関 | 慶應義塾大学 |
|---|
研究代表者 |
小坂 威雄 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 講師 (30445407)
|
|---|
| 研究分担者 |
植田 幸嗣 公益財団法人がん研究会, がんプレシジョン医療研究センター がんオーダーメイド医療開発プロジェクト, プロジェクトリーダー (10509110)
西原 広史 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 教授 (50322805)
北野 滋久 公益財団法人がん研究会, 有明病院 がん免疫治療開発部, 部長 (60402682)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2021-07-09 – 2023-03-31
|
| キーワード | 神経内分泌がん / リキッドバイオプシー / シングルセル解析 / 次世代シーケンサー / 前立腺癌 |
|---|
| 研究実績の概要 |
アンドロゲン受容体シグナル阻害剤(Androgen Receptor Pathway inhibitor; ARPI)が登場したが、患者の予後が延長しているという恩恵と相反する臨床上の課題が浮き彫りとなった。それは治療誘導型神経内分泌がん（tNEPC） の出現である。腫瘍はがん幹細胞を始め、多様な性質を有する細胞が存在し不均一性（ITH）を有する。
本研究では、NEPC患者の血液循環腫瘍細胞(CTC)のシングルセル解析とPDXモデルの作成、組織切片における空間的遺伝子発現解析による活性化遺伝子の3次元地図情報を統合解析することで、NEPCのITHの理解と、ITHの制御を可能とする標的分子を同定し、新規治療戦略の確立を目的とした。
1.NEPC患者のITH解明のための血液循環腫瘍細胞のシングルセル解析とPDXモデルの作成：新規CTC回収システムを用いて、NEPC患者の進行度や時間軸に沿ってCTCを回収し、CTCシングルセルRNAシークエンス解析を開始し、特定のクラスターを同定した。
２．NEPC患者の空間的遺伝子発現解析システムを統合した多層性ビッグデータ解析：NEPCの手術検体を対象として、最新の空間的遺伝子発現解析システム（Visium 空間的遺伝子発現ソリューション）を用いてITH解析を開始した。本システムはスライドガラス上にポリTのオリゴ配列を並べ、分子バーコードを付与した塩基を使ってRNA解析する画期的な技術である。NEPC検検体切片における全トランスクリプトームを空間的な位置情報を保ったままマッピングすることで、組織切片上で活性化している遺伝子の地図を入手することができる。オミックスデータを合し多層性ビッグデータとして解析した。
上記二つのテーマから、ITHを解析し、新規バイオマーカーならびに新規治療標的候補を同定した。
|
