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2021 年度 実施状況報告書

体細胞分化の鍵となる遺伝子探索のための新方法論:インバース・ジェネティクスの開拓

研究課題

研究課題/領域番号 21K19603
研究機関岡山大学

研究代表者

久保田 聡  岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (90221936)

研究分担者 西田 崇  岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (30322233)
服部 高子  岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (00228488)
高江洲 かずみ (河田かずみ)  岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (10457228)
青山 絵理子  岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (10432650)
滝川 正春  岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (20112063)
大野 充昭  岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (60613156)
研究期間 (年度) 2021-07-09 – 2023-03-31
キーワードreprogramming / iPS cell / chondrocyte / transcription factor / lncRNA
研究実績の概要

初年度である本年度は、本研究で提唱する「インバース・ジェネティクス方法論」を、軟骨細胞を用いて検証することを第一の目的と定め研究を進めた。当初の予定ではマウス肋軟骨細胞を用いる予定であったが、長鎖非コードRNA (lncRNA) 遺伝子の数がはるかに多いこと、およびフィーダー細胞としてマウス由来SNL細胞を使うことを考慮しヒト軟骨細胞を用いた検討から開始することとした。理論上は可能だが軟骨細胞からiPS細胞を作成できたという報告はまだない。したがってまず山中4因子 (OSKM) を強制発現するレンチウイルスベクターを作成し、ヒト軟骨細胞に導入、リプログラミングが起こるかどうかをコロニー形成を指標に検討した。その結果OSKM導入発現2週間後には多数のコロニーの形成が見られ、軟骨細胞もiPS細胞化しうることが確認された。この結果を受けて、iPS干渉法によって仮説の妥当性とSOX9遺伝子の軟骨細胞分化の機能確認に進んだ。すなわち軟骨細胞にOSKMに加えてSOX9を発現させることでリプログラミングが阻止されるかを検証した。その結果SOX9発現によって形成されるコロニーは減少したがゼロにはならなかった。これはSOX9が単独で軟骨細胞分化を決定しているのではないためと考えている。そして次にシングルセル解析に進むにあたっては、解析前にフィーダー細胞を除去する必要がある。そのため以上の研究に並行して、蛍光色素mCherryを発現するSNL細胞を新たに樹立し、フローサイトメトリーで除去するシステムを整えてきた。ここまでは順調であったが、この実験システムではリプログラミング効率が十分ではなく、シングルセル解析で有意な結果を得るために必要なOSKM導入細胞数の確保が難しいことが分かってきた。そこで最近開発された一体型山中因子発現ウイルスベクターを試したところ、予備実験で飛躍的に高い導入効率が得られた。来年度はこのシステムを用いて研究を先に進める予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

年度半ばまでは予定を超えるスピードで研究が進み、シングルセル解析用試薬も早々に揃えていたが、従前の実験システムの稼働効率に問題が生じたため、年度内にシングルセル解析まで進めなかった。この点は研究にやや遅れを生じていると評価せざるを得ない。しかしこれに並行してフィーダー細胞を除去する方法を考案、準備をするなど必要な軌道修正を行うとともに、新たな遺伝子導入システムの導入とその有効性を実験的に確認するなど、今後の研究を加速させるための成果も得ることができた。したがって結果的には、次年度の研究を急速に進めるための基盤が整備され、研究期間が終了する頃までには本研究課題が目指すゴールに到達できる見込みがついたため、上記のような評価とした。

今後の研究の推進方策

新たに導入したリプログラミング用遺伝子発現ベクターは、センダイウイルスをベースとした最新のテクノロジーに基づくもので、非常に高い効率で導入細胞を得ることができる。リプログラミングは本研究課題の基幹をなすプロセスなので、今後はこのシステムを活用することで一層の推進が図れる。さらに、本研究課題の次に行うべき研究として位置付けていた、インバース・ジェネティクスによる歯原性細胞分化を支配するマスター遺伝子の探索に取り組もうとする人材が、本研究チームに集結しつつある。研究期間中に本研究課題のゴールを超えて次の段階に進めることを目指し研究に取り組みたい。

次年度使用額が生じた理由

本年度実施予定であったシングルセル解析を行わなかったため、残余が生じた。当該部分は同じ目的で次年度に使用する。

  • 研究成果

    (28件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (21件) (うち招待講演 2件)

  • [国際共同研究] モントリオール大学(カナダ)

    • 国名
      カナダ
    • 外国機関名
      モントリオール大学
  • [雑誌論文] Effect of cellular communication network factor 2/connective tissue growth factor on tube formation by endothelial cells derived from human periodontal ligaments2021

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi-Igarashi Hiroko、Tachibana Toshiaki、Murakashi Etsuko、Kubota Satoshi、Numabe Yukihiro
    • 雑誌名

      Archives of Oral Biology

      巻: 132 ページ: 105279~105279

    • DOI

      10.1016/j.archoralbio.2021.105279

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cellular communication network factor 3 in cartilage development and maintenance2021

    • 著者名/発表者名
      Kubota Satoshi、Kawaki Harumi、Perbal Bernard、Kawata Kazumi、Hattori Takako、Nishida Takashi
    • 雑誌名

      Journal of Cell Communication and Signaling

      巻: 15 ページ: 533~543

    • DOI

      10.1007/s12079-021-00629-z

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] RFX1‐mediated CCN3 induction that may support chondrocyte survival under starved conditions2021

    • 著者名/発表者名
      Mizukawa Tomomi、Nishida Takashi、Akashi Sho、Kawata Kazumi、Kikuchi Sumire、Kawaki Harumi、Takigawa Masaharu、Kamioka Hiroshi、Kubota Satoshi
    • 雑誌名

      Journal of Cellular Physiology

      巻: 236 ページ: 6884~6896

    • DOI

      10.1002/jcp.30348

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Odontoblast differentiation is regulated by an interplay between primary cilia and the canonical Wnt pathway2021

    • 著者名/発表者名
      Kawata Kazumi、Narita Keishi、Washio Ayako、Kitamura Chiaki、Nishihara Tatsuji、Kubota Satoshi、Takeda Sen
    • 雑誌名

      Bone

      巻: 150 ページ: 116001~116001

    • DOI

      10.1016/j.bone.2021.116001

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of Angiotensin II on Chondrocyte Degeneration and Protection via Differential Usage of Angiotensin II Receptors2021

    • 著者名/発表者名
      Nishida Takashi、Akashi Sho、Takigawa Masaharu、Kubota Satoshi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 ページ: 9204~9204

    • DOI

      10.3390/ijms22179204

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Bipartite regulation of cellular communication network factor 2 and fibroblast growth factor 1 genes by fibroblast growth factor 1 through histone deacetylase 1 and fork head box protein A12021

    • 著者名/発表者名
      Elseoudi Abdellatif、Nishida Takashi、Mizukawa Tomomi、Hattori Takako、Kawata Kazumi、Taha Eman A.、Takigawa Masaharu、Kubota Satoshi
    • 雑誌名

      Journal of Cell Communication and Signaling

      巻: 15 ページ: 81~91

    • DOI

      10.1007/s12079-020-00600-4

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 成長因子の再誕:その隠された分子機構と相互作用2022

    • 著者名/発表者名
      久保田聡
    • 学会等名
      第34回日本軟骨代謝学会
    • 招待講演
  • [学会発表] メトホルミンによる非コードRNA誘導と軟骨細胞分化促進作用2022

    • 著者名/発表者名
      近藤 星、服部高子、桑原実穂、Fu Shanqi、西田 崇、薬師寺翔太、吉岡洋祐、森谷徳文、 飯田征二、滝川正春、久保田聡
    • 学会等名
      第34回日本軟骨代謝学会
  • [学会発表] 軟骨細胞におけるGDF5とCCN2との結合の意義2022

    • 著者名/発表者名
      東原直裕、青山絵理子、古松毅之、久保田聡、尾崎敏文、滝川正春
    • 学会等名
      第34回日本軟骨代謝学会
  • [学会発表] 軟骨細胞における転写因子RFX1を介したCCN3の発現制御機構とその役割2022

    • 著者名/発表者名
      水川朋美、西田 崇、明石 翔、河田かずみ、菊池 菫、川木晴美、滝川正春、上岡 寛、久保田聡
    • 学会等名
      第34回日本軟骨代謝学会
  • [学会発表] 変形性股関節症とCCN3発現の相関2022

    • 著者名/発表者名
      廣瀬一樹、中田英二、服部高子、鉄永智紀、山田和希、佐藤嘉洋、桑原実穂、滝川正春、 久保田聡、尾崎敏文
    • 学会等名
      第34回日本軟骨代謝学会
  • [学会発表] 持続可能な軟骨代謝を支えるCCN32021

    • 著者名/発表者名
      久保田聡
    • 学会等名
      第23回日本骨粗鬆症学会/第39回日本骨代謝学会
    • 招待講演
  • [学会発表] CCN2、CCN3とPDGFRLの軟骨細胞への作用におけるHippo pathwayの関与2021

    • 著者名/発表者名
      河田かずみ、青山絵理子、滝川正春、久保田聡
    • 学会等名
      第12回日本CCNファミリー研究会
  • [学会発表] 軟骨細胞でのRFX1によるCCNファミリータンパク質3遺伝子制御メカニズム2021

    • 著者名/発表者名
      水川朋美、西田 崇、明石 翔、河田かずみ、菊池 菫、川木晴美、滝川正春、上岡 寛、久保田聡
    • 学会等名
      第12回日本CCNファミリー研究会
  • [学会発表] Chondrocyte differentiation is positively regulated by S-adenosyl- methionine via polyamine biosynthesis.2021

    • 著者名/発表者名
      Hoang Dinh, L., Aoyama, E., Kubota, S., Kuboki, T., Takigawa, M.
    • 学会等名
      第12回日本CCNファミリー研究会
  • [学会発表] メトホルミンの軟骨細胞分化促進作用におけるUCA1とCCN2の役割2021

    • 著者名/発表者名
      近藤 星、服部高子、桑原実穂、Fu Shanqi、西田 崇、吉岡洋祐、森谷徳文、飯田征二、滝川正春、久保田聡
    • 学会等名
      第12回日本CCNファミリー研究会
  • [学会発表] Circadian production of melatonin and ita receptor influence metabolism and rhythmic gene expression in chondrocytes2021

    • 著者名/発表者名
      Fu, S.、桑原美穂、内田瑶子、近藤 星、池亀美華、丸山雄介、服部淳彦、林 大智、下村侑司、高垣安紗美、西田 崇、久保田聡、服部高子
    • 学会等名
      第62回日本生化学会 中国・四国支部例会
  • [学会発表] CCN2、CCN3とPDGFRLの軟骨細胞における生物学的作用へのHippo pathwayの関与2021

    • 著者名/発表者名
      河田かずみ、青山絵理子、滝川正春、久保田聡
    • 学会等名
      第62回日本生化学会 中国・四国支部例会
  • [学会発表] 軟骨細解糖阻害剤NaFの線維化抑制効果とCCNファミリー遺伝子の関与2021

    • 著者名/発表者名
      水川朋美、西田 崇、明石 翔、堀 彩花、高柴正悟、上岡 寛、滝川正春、久保田聡
    • 学会等名
      第62回日本生化学会 中国・四国支部例会
  • [学会発表] S-adenosylmethionine positively modulates differentiation in chondrocytes via polyamine biosynthesis.2021

    • 著者名/発表者名
      Hoang Dinh, L., Aoyama, E., Kubota, S., Kuboki, T., Takigawa, M.
    • 学会等名
      第39回日本骨代謝学会
  • [学会発表] 変形性肩関節症モデルとしてのCCN3過剰発現マウス2021

    • 著者名/発表者名
      廣瀬一樹、中田英二、服部高子、鉄永智紀、山田和希、佐藤嘉洋、桑原実穂、滝川正春
    • 学会等名
      第39回日本骨代謝学会
  • [学会発表] CCN3は関節軟骨の加齢変性を促進する2021

    • 著者名/発表者名
      桑原実穂、武内聡子、近藤 星、Fu Shanqi, 大野充昭、古松毅之、中田英二、滝川正春、久保田聡、服部高子
    • 学会等名
      第39回日本骨代謝学会
  • [学会発表] 軟骨細胞におけるRFX1を介したCCN3の発現制御機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      水川朋美、西田 崇、明石 翔、河田かずみ、菊池 菫、川木晴美、滝川正春、上岡 寛、久保田聡
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
  • [学会発表] 変形性肩関節症とCCN3発現上昇の相関について2021

    • 著者名/発表者名
      廣瀬一樹、中田英二、服部高子、鉄永智紀、山田和希、佐藤嘉洋、桑原実穂、滝川正春、 久保田聡、尾崎敏文
    • 学会等名
      第36回日本整形外科学会基礎学術集会
  • [学会発表] メトホルミンによるUCA1を介した軟骨保護作用の解析2021

    • 著者名/発表者名
      近藤 星、服部高子、桑原実穂、Fu Shanqi、西田 崇、薬師寺翔太、吉岡洋祐、森谷徳文、 飯田征二、滝川正春、久保田聡
    • 学会等名
      第42回岡山歯学会
  • [学会発表] メトホルミンの軟骨細胞におけるUCA1誘導をともなった分化促進作用2021

    • 著者名/発表者名
      近藤 星、服部高子、桑原実穂、Fu Shanqi、西田 崇、吉岡洋祐、森谷徳文、飯田征二、滝川正春、久保田聡
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
  • [学会発表] 軟骨細胞におけるCCN2、CCN3とPDGFRLの生物学的作用におけるHippo pathwayの関与2021

    • 著者名/発表者名
      河田かずみ、青山絵理子、滝川正春、久保田聡
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会

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公開日: 2022-12-28  

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